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椰子树克隆技术的突破将有助于繁殖和保存
椰子树生长缓慢,很难克隆。鲁汶大学和该联盟的科学家们加快了椰子幼苗的繁殖,并长期保存了椰子的遗传资源。资料来源:鲁汶大学-汉内斯·威尔姆斯椰子树生长缓慢,很难克隆。鲁汶大学和该联盟的科学家们加快了椰子幼苗的繁殖,并长期保存了椰子的遗传资源。这将有助于保护椰子树的生物多样性,并满足对椰子及其衍生产品日益增长的需求。椰子是地球上第六大种植水果,对它的需求还在持续增长。近年来,消费者对椰子油的需求不断增加。椰子汁也被用作含糖软饮料的天然替代品。但椰子树主要生长在赤道附近的沿海地区,面临着许多挑战:致命的黄化病、气候变化、海平面上升和过时的
来源:Scientific Reports
时间:2021-09-18
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新的机器学习方法能更好地识别蛋白质中的酶金属
图片:乔安娜·斯鲁斯基,堪萨斯大学分子生物科学和计算生物学副教授,领导着一个实验室,机器学习提高了在蛋白质中识别酶和非酶金属的精度。MAHOMES不是针对广泛的受体,而是区分蛋白质中的酶和非酶金属,准确率为92.2%。堪萨斯大学的一个团队最近在《自然通讯》上发表了关于这种区分酶的机器学习方法的结果。通讯作者、堪萨斯大学分子生物科学和计算生物学副教授Joanna Slusky说:“酶是超级有趣的蛋白质,它能做所有的化学反应——酶在某物上进行化学反应,把它从一种东西转变成另一种东西。”“你带入身体的所有东西,你的身体都将其分解,并使其成
来源:Nature Communications
时间:2021-09-18
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鲁非研究组开发高效率群体转录组研究技术
RNA测序(RNA-Seq)是现代生物学研究的基石技术之一,将许多研究从单一的基因组水平提升到多组学水平,是解析基因组功能的强大工具。现有的全基因组水平的大规模测序以及高质量泛基因组的组装,为大规模转录组研究提供了广阔的空间,迫切需要高效的RNA-Seq技术进行深层次生物学解析。本研究综合了已报道的3' RNA-Seq定制化建库方法的优点,并针对测序外包市场标准双端150bp/250bp(PE150/250)模式优化实验设计,开发了一种通用高效的基因表达文库构建方法,即简化的poly(A)锚定测序(SiPAS)技术。通过在六倍体面包小麦中SiPAS性能的测试实验,证实了SiPAS具有高水平
来源:中国科学院遗传与发育生物学研究所
时间:2021-09-17
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突破性的杀死细菌的病毒与抗生素联合起来对抗毁灭性的耐抗生素细菌
图像:斑马鱼感染了荧光细菌脓肿分枝杆菌(红色)资料来源:马特·约翰森博士和克莱默实验室脓肿分枝杆菌是引起结核病和麻风病的细菌的近亲,它会对人的肺部造成特别严重的损害,并可能对许多标准抗生素产生耐药性,使感染极具挑战性。然而,还是有希望的。细菌对自然产生的病毒,即噬菌体很脆弱;对于每一种细菌,都有一种独特的噬菌体来摧毁它。科学家们正在测试将噬菌体与我们目前使用的抗生素结合起来的新疗法,以治疗耐抗生素感染。Laurent Kremer和来自法国Université de Montpellier和美国匹兹堡大学的同事在他们最近发表的《疾病
来源:Disease Models & Mechanisms
时间:2021-09-17
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2650万美元发现一个治疗HIV的新方法
在过去的40年里,艾滋病毒已经从一种致命而神秘的病毒转变为一种可以通过日常药物控制的病毒。但是,试图从艾滋病毒携带者体内彻底清除病毒、治愈他们的努力都失败了。现在,在美国国立卫生研究院(NIH) 2650万美元的资助下,一个由来自世界各地机构的多学科研究人员组成的小组正在尝试一种全新的治疗艾滋病的策略。这个小组被称为“程序化表观遗传学阻止艾滋病病毒”(HOPE)合作实验室,将由格莱斯顿研究所、佛罗里达斯克里普斯研究所和威尔康奈尔医学院的研究人员领导。他们的方法旨在使艾滋病毒沉默并永久地从人体中去除,利用了其他病毒随着时间的推移如何自然失活的知识。格莱斯顿病毒学研究所主任、HOPE合作实验室项目
来源:gladstone
时间:2021-09-16
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新技术使研究基因功能更容易、更快、更有效
贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的研究人员表示,现在研究基因在基础生物学和疾病中的作用更容易、更快、更有效。他们开发了一种基于药物的基因平台,使科学家能够在实验室中追踪果蝇的基因操作,而无需对数以千计的果蝇个体进行筛选。研究人员在《细胞报告》中介绍了这项新技术的基本原理及其应用实例。STAR协议的一篇配套论文展示了如何建立、进行和分析涉及这项技术的实验程序。基因工具和资源,包括质粒库,协助研究人员在他们的实验系统中实施这种新方法,是免费提供的。“实验室果蝇是一种广泛使用的动物模型研究的功能基因和突变生物过程,在健康和疾病,”第一作者尼克Matinyan博士说,
来源:Cell Reports
时间:2021-09-16
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自我复制RNA可以突破mRNA应用的局限性
突破信使RNA应用的局限,能否引领新一代的治疗方法?基于mRNA的疫苗和治疗方法的开发近年来成为人们关注的热点之一。上周,致力于开发环状RNA技术的Laronde完成了4.4亿美元的B轮融资。今天,另一种新的信使RNA出现在人们的视野中。复制生物科学宣布,它已经完成了4000万美元的a轮融资,用于开发癌症耐药性的创新疗法,以及治疗各种疾病,如自身免疫和炎症。该公司的技术平台是一种创新技术,称为自复制RNA (srRNA)。信使核糖核酸已成功地开发了传染病疫苗。然而,将其发展成为治疗疾病的疗法仍面临多重挑战。自我复制的RNA技术和传统的信使RNA技术有什么区别?它可以帮助扩展mRNA的应用范围吗
来源:medicaltrend
时间:2021-09-16
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吴边研究组在NSR发表无痕蛋白质酶法合成方法
蛋白质是所有生命的物质基础,也是生物体行使功能最重要的载体。蛋白质的获取与改造长久以来一直是生命科学研究的核心问题之一。虽然经典重组表达技术能够提供天然蛋白质,但其所能利用的分子砌块受到20种天然氨基酸的限制。伴随着蛋白质组学研究和生物医药产业的迅速发展,人们对于具有化学修饰与新型胺基单元的非天然蛋白质的需求与日俱增。因此,突破生物学中心法则的限制,创造出任意结构的蛋白质,不仅可以拓展人们对蛋白质这一生命核心元件的理解,也是人工设计生命的重要基础,具有深刻的科学意义。 从化学本质分析,蛋白质是胺基单元通过碳氮成键反应形成的生物大分子。因此,蛋白质的人工合成关键在于碳氮成键反
来源:中国科学院微生物研究所
时间:2021-09-16
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MIT新技术助力更好地培养癌症“类器官”
麻省理工学院的工程师们与英国曼彻斯特癌症研究所的科学家们合作,开发了一种新的方法,利用健康或癌变的胰腺细胞来培育微小的胰腺复制品。他们的新模型可以帮助研究人员开发和测试潜在的治疗胰腺癌的药物,目前胰腺癌是最难治疗的癌症之一。 使用一种模拟胰腺周围细胞外环境的特殊凝胶,研究人员能够培育胰腺“类器官”,使他们能够研究胰腺肿瘤与其环境之间的重要相互作用。与现在用来培养组织的一些凝胶不同,麻省理工学院的新型凝胶是完全合成的,易于组装,每次生产时成分都一致。 “可重复性是一个主要问题,”教学创新工程学院教授、生物工程和机械工程教授琳达·格里菲斯(Linda Griffith)说。“研
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新方法使人体器官的3D显微镜成像成为可能
瑞典Umeå大学的研究人员现在展示了一种方法,通过这种方法,可以以微米级的精度研究人体器官中的特定细胞类型。这种方法可以用来揭示以前无法识别的胰腺变化,但它也可以用来研究其他人体器官和疾病。Umeå大学的分子医学教授Ulf Ahlgren说:“这种方法可能有助于深入了解细胞变化与不同疾病状况之间的关系。”研究人员所做的是使用3D打印的基质来分割器官,利用3D技术创造出最适合光学成像的组织部分。然后可以对这些碎片进行标记,从而直观地看到所选择的任何细胞类型或蛋白质。由于每个组织都有已知的坐标,单个的3D图像可以
来源:Communications Biology
时间:2021-09-15
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自闭症研究突破:高度异质性
被称为微观状态,可以用ABCDE大脑活动图来表示,在图的底部可见。在自闭症谱系障碍(ASD)儿童中,与同龄儿童相比,它们出现的顺序和状态B的动态受到影响。自闭症是一种多方面的障碍,不能通过单一的症状来识别,也不能用单一的生物学原因来解释。因此,它被称为自闭症谱系障碍(ASD)。ASD患者会经历各种各样的问题,典型的特征是沟通障碍和社交障碍,以及限制性的重复性行为。为了改善长期筛查和治疗,研究人员正在寻求更好地理解这种高度异质性的神经生物学机制,更具体地说,是在大脑发育和大型神经网络形成期间。Marie Schaer是日内瓦大学(UN
来源:Communications Biology
时间:2021-09-15
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重要突破:基因的自我校正功能可以抵抗血癌
约翰霍普金斯大学的科学家们发现,基因的自我校正功能可以抵抗血癌,这有望成为血癌治疗的重大突破!血癌是生活中常见的恶性肿瘤疾病。该病的发病率非常小,且多见于儿童和青少年,所以是一种非常严重的疾病。根据目前的技术,病人不可能完全康复。只有持续化疗诊断才能缓解病情。因此,不断发现血癌的新机制,开发新的治疗方法,具有深远的意义。最近,来自美国约翰霍普金斯大学的科学家对血癌进行了进一步的研究。他们的新发现对未来白血病的临床治疗有什么启示?白血病是人类存在的十大恶性疾病之一。就我国男子的发病率和死亡率而言,这一恶性肿瘤疾病在世界上排名第八,发病率在35岁以下;儿童发病率居世界首位。由此可以看出它的严重性。
来源:medicaltrend
时间:2021-09-14
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Science子刊:理解蛋白质动力学和细胞过程调控的新方法
图像:共同进化推动了生物分子调控功能空间的探索。资料来源:Francesco Colizzi (IRB巴塞罗那)细胞过程是通过不同蛋白质形状之间的平衡来调节的,这些蛋白质形状赋予这些分子有活性或无活性的功能。在细胞调控的复杂性中,蛋白质的首选形状(或构象)往往取决于与另一个分子(称为效应体)的结合,因此,这意味着同一蛋白质可以根据它所结合的效应体发挥不同的功能。因此,在分子水平上,蛋白质功能转化为蛋白质动力学,这是从细胞分裂到能量供应和细胞命运决定的所有细胞过程发展的关键。由Modesto Orozco博士领导的巴塞罗那IRB分子建
来源:Science Advances
时间:2021-09-13
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痴呆症突破:氧气治疗“提高记忆力和注意力”
这一过程被称为高压氧治疗,患者通过加压室中的面罩吸入氧气。它显著增加了身体组织中的氧气量,此前已发现这一过程有助于愈合。当对小鼠进行治疗时,它减少了大脑中的淀粉样斑块。它们是阿尔茨海默病的一个信号。研究人员发现,在人类大脑的几个部分,血液流量“显著”增加了16%到23%。 志愿者在随后的记忆测试中得分也提高了16.5%,在注意力上提高了6%,在信息处理上提高了10.3%。研究人员说,这种治疗可能扩大了血管的宽度,减少了血管壁的厚度,从而增加了血液流量。 流向大脑的血液流量减少已经与痴呆症的发病有关。以色列特拉维夫大学神经生物学专家Uri Ashery教授说:“患有严重记忆丧
来源:today news post
时间:2021-09-13
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新材料学院在《化学学会评论》发表离子称量技术在电池中应用的教程类综述文章
深入理解与分析电池(包括锂离子、钠离子、空气电池等)运行过程中的体相和界面行为对于电池性能的持续改进具有重要意义。电化学石英晶体天平(EQCM)离子称量技术是实现这一目标的有力工具,因为它可以在原位工况下研究电池各种现象,包括电极内的离子插入/脱嵌、电解液中的固体成核、界面形成/演化和固液配位等。因此,电化学石英晶体天平对于分析电池中体相与界面的现象与机制具有重要意义。北京大学深圳研究生院新材料学院潘锋课题组近年来利用的电化学石英晶体天平从电池材料体相离子脱嵌与界面结构化学方面的取得了一系列的重要进展,在Nat. Nanotech. (Nat. Nanotech., 2019,
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Science子刊:理解蛋白质动力学的一种新方法
细胞过程是通过不同蛋白质形状之间的平衡来调节的,这些蛋白质形状赋予这些分子有活性或无活性的功能。在细胞调控的复杂性中,蛋白质的首选形状(或构象)往往取决于与另一个分子(称为效应体)的结合,因此,这意味着同一蛋白质可以根据它所结合的效应体发挥不同的功能。因此,在分子水平上,蛋白质功能转化为蛋白质动力学,这是从细胞分裂到能量供应和细胞命运决定的所有细胞过程发展的关键。由Modesto Orozco博士领导的巴塞罗那IRB分子建模和生物信息学实验室的研究人员开发了一种新的计算程序,可以发现和量化功能性蛋白质的形状,从而揭示细胞过程的分子细节。这项工作的重点是在变构调控下的蛋白质,这意味着它们的形状变
来源:IRB Barcelona
时间:2021-09-10
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PNAS发现新机制,利用成像技术开发新的sting激活药物
加州大学洛杉矶分校Jonsson综合癌症中心的科学家们的一项新研究发现,激活蛋白质STING(一种完善的免疫细胞激活调节剂)的新兴药物,实质上改变了负责生成DNA核苷酸构建块的代谢途径的活动。研究人员发现,这些改变发生在癌细胞中,可以使用[18F]FLT正电子发射断层成像(PET)成像来显示,这标志着首次使用无创成像技术追踪这些药物的效果。了解STING激动剂如何影响代谢过程,有助于在各种治疗环境中加速STING激活药物的临床开发,并指导新型生物标志物和联合疗法的设计。背景蛋白STING的激活已经成为一种有前景的癌症免疫治疗策略,目前正在研究多种STING激活药物刺激抗癌免疫反应的能力。虽然S
来源:Proceedings of the National Academy of Sciences
时间:2021-09-09
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错误的细胞核DNA示范!新成像方法揭示DNA在细胞核中的排列方式
左图:细胞核的三维示意图,代表其位于中心的经典DNA组织理论。右图:将拉面碗转过头——果蝇幼虫肌肉细胞细胞核的显微图像。DNA的长链(红色)连接到核膜(绿色)——核膜的内层。魏茨曼科学研究所核的外围如果你打开一本生物学教科书,浏览描述DNA在细胞核中如何组织的图像,你很可能会开始感到饥饿;DNA链看起来就像一碗拉面:长长的绳子漂浮在液体中。然而,根据分子遗传学系的Talila Volk教授和魏茨曼科学研究所化学和生物物理系的Sam Safran教授合作完成的两项新研究——一项是实验研究[1],另一项是理论研究[2],这一形象应该重新考虑。阐明这一点至关重要,因为DNA在细胞核中的空间排列可以影
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新技术!ecDNA与线性DNA的表观遗传差异研究迎来重要进展
最近几年的研究表明,染色体外环状DNA(ecDNA)可以促进癌基因扩增,驱动肿瘤进化,并具有遗传异质性,在癌症发生中发挥着关键作用[1,2,3,4]。但由于缺乏足够的分子分析技术,尽管ecDNA自1964年以来就已为人所知,对其具体作用的阐明却一直进展缓慢。目前的研究主要通过拷贝数变异(如Amplicon Architect)[5]和识别ecDNA junction位点(如Circle-Map和CIRC_finder)[6,7]等方法从测序数据中识别ecDNA。但是对ecDNA功能表观遗传学的研究还很缺乏。而了解全基因组范围ecDNA的染色质状态和转录状态是至关重要的,有助于促进对ecDNA及
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新的方法使预测藻类繁殖变得更容易
图片:藻华密度很高,会使水变色。然而,瑞典西海岸的大多数有毒海藻并没有使海水变色。有毒藻类会造成严重的问题。贻贝会变得有毒,水产养殖可能会被消灭。但是,尽管对藻类和毒素进行了监测,但很难预测藻类爆发的时间。现在,哥德堡大学的一个研究小组与奥斯陆大学合作,发现了一种提高预测有毒藻类繁殖能力的方法。哥德堡大学(University of Gothenburg)的海洋研究员埃里克·塞兰德(Erik Selander)说:“通过测量水中有毒藻类捕食者的数量,可以更确定地预测有毒藻类的繁殖。”有毒藻类察觉到浮游动物的存在,导致它们增加毒素的产
来源:Limnology and Oceanography
时间:2021-09-08