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  • 一种发现RNA高分辨率结构的新方法

    生物分子的结构可以揭示其功能和与周围环境的相互作用。DNA的双螺旋结构及其对遗传信息传递过程的影响形成了一个明显的例子。在一项新的研究SISSA——师范学校国际米兰Superiore di某Avanzati,发表在核酸研究,实验数据结合的分子动力学计算机模拟研究RNA片段的构象参与蛋白质合成及其依赖盐溶液中。这项研究为生物分子在生理环境中的结构提供了一种高分辨率定义的新方法。SISSA的物理学家Giovanni Bussi解释说:“x射线晶体学用于发现DNA的双螺旋构象,仍然是研究生物分子结构的最常用技术之一。”“这项技术使我们能够以固态晶体形式重建分子的图像。然而,这产生了一个静态的结构视图

    来源:Nucleic Acids Research

    时间:2021-06-15

  • 在空间和时间上追踪细胞RNA的新方法

    每一个生物都从一个细胞开始它的旅程,以令人难以置信的规模分化和专门化。第一个细胞的发育信息是通过母体分子信息(mRNA)的位置和运动来传递的。但是,到目前为止,由于缺乏收集mRNA时间和位置信息的方法,对这些流动和短暂过程的系统分析一直受阻。科学家们利用最先进的单细胞转录组学,根据单个细胞中RNA分子的相似性排列单个细胞,从而确定了正在出现的发育模式。然而,这种方法不能重建胚胎发育的早期阶段,在那里信息被嵌入到RNA分子的空间排列中。一项新的研究结合了空间解析转录组学和单细胞RNA标记,对单细胞斑马鱼和青蛙胚胎发育最初几个小时的转录组总数进行了时空实验。分析显示,在胚胎的单细胞阶段,就已经存在

    来源:

    时间:2021-06-15

  • 物理学院量子材料科学中心江颖教授等在《自然·综述·方法导论》发表扫描探针显微术领域综述论文

    近日,应《自然·综述·方法导论》邀请,北京大学物理学院量子材料科学中心、轻元素先进材料研究中心江颖教授联合瑞士巴塞尔大学Christoph Gerber教授(原子力显微镜发明者之一)、韩国基础科学研究院量子纳米科学中心主任Andreas Heinrich教授、瑞士苏黎世联邦理工大学Daniel Müller教授和美国康奈尔大学威尔康奈尔医学院Simon Scheuring教授等多位扫描探针显微术领域国际知名学者,共同撰写了题为“扫描探针显微术”(Scanning probe microscopy)的综述文章【Nature Reviews Methods Primers 1, 3

    来源:北京大学新闻网

    时间:2021-06-12

  • Cell新突破:没有显微镜的显微成像,剖析所有基因表达

    组成人类基因组的大约30,000 个基因中包含了对生命至关重要的指令。然而,我们的每个细胞在其日常功能中仅表达这些基因的一部分。例如,心脏细胞和肝细胞之间的差异取决于表达哪些基因——基因的正确表达可能意味着健康与疾病之间的差异。直到最近,研究潜在疾病基因的研究人员一直受到限制,因为传统的成像技术一次只能研究少数几个基因。密歇根大学医学院的 Jun Hee Lee 博士和他的团队开发的一项新技术,采用高通量测序而不是显微镜来获得来自组织载玻片的基因表达的超高分辨率图像。这项被他们称为 Seq-Scope ,可以研究人员能够以令人难以置信的高分辨率(0.6 微米或比人类头发小66 倍)观察每个表达

    来源:生物通

    时间:2021-06-11

  • 喜讯!表观生物获中科院Nature级RIC-seq技术成果转化授权

    近日,表观生物与中科院生物物理研究所签订RIC-seq技术转让(专利实施许可)协议,获得全球范围内实施RIC-seq技术成果转化的授权,为生命科学研究提供RIC-seq技术服务和RIC-seq建库试剂盒销售。 什么是RIC-seq? RIC-seq是一项全球领先的原始创新技术,由中科院生物物理研究所薛愿超课题组开发,能够捕获细胞内RNA原位高级结构及分子间相互作用位点,相关研究成果于2020年5月在《自然》(Nature)杂志在线发表[1]。  图1. Nature发表RIC-seq技术成果如何应用RIC-seq?RIC-seq技术具有重要的应

    来源:表观生物

    时间:2021-06-11

  • Nature Cell Biology:RNA结合蛋白靶标研究新方法LACE-seq

      2021年6月10日凌晨,中国科学院生物物理研究所薛愿超课题组及其合作者在《Nature Cell Biology》杂志上在线发表了题为"Global profiling of RNA-binding protein target sites by LACE-seq"的技术报告论文。  人类基因组编码了约1500个RNA结合蛋白(RNA-binding protein, RBP),它们往往通过结合RNA分子上的特定基序或结构元件而调控细胞内各种RNA分子的加工、定位、翻译和稳定性等。研究表明,RBP在早期生殖、个体发育、细胞分化、增殖和凋亡等几乎所有的生理过程中都发挥了

    来源:中国科学院生物物理研究所

    时间:2021-06-11

  • 新冠病毒变异太快了,试管技术可在新变种出现之前模拟病毒变异

     病毒的变种,例如引起COVID-19的病毒,现在可以在实验室里迅速研究,甚至在它们出现在自然界并成为一个重大的公共卫生挑战之前。昆士兰大学、Qimr Brgffor医学研究所、多尔蒂感染和免疫研究所、莫纳什大学和昆士兰健康发展了一种综合控制病毒的技术,允许快速分析和映射新的潜在病毒变体。UQ的首席研究员Alexander Khromykh教授说,这项技术非常适合在COVID-19等全球大流行期间使用。Khromykh教授说:“这项技术应该使我们能够回答有关潜在病毒变体是否对某种药物或疫苗敏感的问题,甚至在它们出现在自然界之前。”“到目前为止,我们对病毒变异的出现大多只是等待和反应,

    来源:生物通

    时间:2021-06-10

  • 多年研究,获昼夜节律基因突破性进展

          这种内在的驱动力促使你晚上去睡觉,早上醒来去吃饭、工作和娱乐,这是遗传的,而且不仅仅是人类。几乎每一个生物体——从动物到植物,以及几种微生物和真菌——都有一个内部的生物钟,或昼夜节律。然而,科学家们一直困惑于这些基因是如何运作的。现在,弗吉尼亚理工大学的科学家们借助老鼠的DNA、培养皿和耐心,离答案又近了一步。在一项新的研究发表在《基因与发展,Shihoko小岛,生物科学学系的助理教授,弗吉尼亚理工大学理学院的一部分,和Fralin生命科学研究所的研究员,和她的团队发现了一个新基因,Per2AS,控制睡眠/唤醒周期的老鼠。Per2AS是一种新型的非

    来源:Genes & Development

    时间:2021-06-10

  • RNA二级结构测序新技术解析Dicer结合与切割底物的RNA结构基础

    RNA结构是RNA的调控与功能的基础。过去科学家们使用X-ray晶体衍射、NMR、冷冻电镜等生物物理的手段,解析了许多RNA三维结构,揭示了RNA发挥不同功能的结构基础。随着二代测序技术的发展,研究者结合化学修饰与高通量测序开发了许多高通量探测全转录组RNA二级结构的技术,并应用于RNA结构与RNA相关调控的功能研究中,揭示出RNA结构在转录后调控中的广泛作用。张强锋课题组一直致力于RNA结构的研究,将RNA结构探测技术应用于不同亚细胞空间定位 (Sun et al., 2019)、早期胚胎发育不同时期 (Shi et al., 2020)RNA结构图谱的刻画以及寨卡病毒 (Li et a

    来源:清华园生命学院

    时间:2021-06-10

  • Nature子刊:一种无需在最开始就加入,无需重建生物分子的荧光标记新技术

        一种使用锰复合物的新技术可以有效地标记CD8+ t细胞。图片来源:Nikolaos Kaplaneris生物分子调节每个活细胞内的生物功能。如果科学家能够理解分子机制,那么就有可能检测出严重的功能障碍。在分子水平上,这可以通过将荧光标记来实现。最新一项研究现在能够证明锰的复合物能更加方便地标记某些生物分子。在过去,这是通过在生物分子中加入一个标记,从一开始就完全重建生物分子来实现的,这需要大量的步骤。但是这种方法不仅需要大量的时间和资源,而且还会产生不必要的废物。现在爱丁堡大学的研究人员已经证明,一种普通金属锰的无毒复合物可以在合成的最后一分钟方便地标记一类特殊

    来源:生物通

    时间:2021-06-09

  • 通过空间和时间追踪RNA的新方法

          图:单细胞斑马鱼胚胎:MDC研究实验室在这个发育的早期阶段发现了许多局部基因。它们的大部分遗传信息流入后一种细胞的前体细胞…资料来源:AG Junker, MDC“生命的奇迹”最开始是最明显的:受精卵细胞通过沟槽分裂成卵泡,包裹在羊膜囊中,展开形成胚层。当卵裂球开始分化成不同的细胞时——当它们最终发育成一个完整的有机体时。简·菲利普·容克博士说:“我们想知道不同细胞之间的后期差异是否已经部分地与受精卵细胞相连。”他是Helmholtz协会(MDC) Max Delbrück分子医学中心柏林系统生物学研究所(BIMSB)数量发育生物学实验室的负责人。

    来源:Nature Communications

    时间:2021-06-09

  • 《科学》临床前研究提出了降低老年人COVID-19死亡率的新方法

    明尼阿波利斯/圣。保罗(06/08/2021)——明尼苏达大学医学院和梅奥诊所的同事们的一项新研究揭示了一种可能的新方法,可以防止感染SARS-CoV-2的老年人死亡和严重疾病。研究人员在一项临床前研究中证明,老年小鼠感染与SARS-CoV-2密切相关的乙型冠状病毒后,衰老溶解药物显著降低了死亡率。这项发表在《科学》杂志上的研究是由Laura Niedernhofer医学博士、哲学博士和Paul Robbins博士共同领导的,他们都是密歇根大学医学院生物化学、分子生物学和生物物理学系的教授,也是衰老和新陈代谢生物学研究所的联合主任,以及Sara Hamilton博士,检验医学和病理学系助理教授

    来源:Science

    时间:2021-06-09

  • Nature新突破:全新IgM抗体能更有效地对抗新冠病毒

    德克萨斯大学等机构的研究人员近日开发出一种全新的IgM抗体疗法,比传统的IgG抗体疗法的中和效力高于230多倍。这种IgM抗体也能有效中和多个病毒变种。这项题为“Nasal delivery of an IgM offers broad protection from SARS-CoV-2 variants”的研究发表在本周的《Nature》杂志上。研究人员改造了IgM抗体,发现在所有情况下,这些抗体在中和COVID-19病毒方面明显比标准IgG抗体更有效。其中,一种名为IgM-14的抗体显示出对原始毒株和新兴变种(比如当前在英国、南非和巴西发现的须关注变种)的效力显著增强。此外,在鼻腔给药时

    来源:生物通

    时间:2021-06-07

  • 研究人员开发了一种测量大脑健康的新方法

    你的大脑和你的实际年龄相比有多大?根据发表在《阿尔茨海默氏症》杂志上的研究结果,拉什大学医学中心的研究人员开发的一种新的大脑健康测量方法,可能为识别有记忆和思维问题风险的个体提供了一种新的方法;痴呆症:6月1日发表在阿尔茨海默病协会杂志上。研究人员称之为“认知时钟”,该工具是一种基于认知表现的大脑健康测量工具。它可能在将来被用来预测随着年龄增长而出现记忆和思维问题的可能性。“老年痴呆症是痴呆症最常见的病因之一,其他脑部疾病随着年龄的增长会慢慢积累。年龄被广泛认为是阿尔茨海默病的主要危险因素,但这是一个非常不完善的预测因素,因为并不是每个人都会随着年龄的增长而发展成痴呆症,”拉什阿尔茨海默病中心

    来源:Rush University Medical Center

    时间:2021-06-07

  • 新发现为早期BRCA突变相关乳腺癌提供了更好的治疗方法

    本周公布了一种新的治疗方法的结果,这种方法有可能改善遗传性BRCA突变和高危早期乳腺癌患者的预后。这些结果首次表明,一种阻止癌细胞修复DNA的药物(称为PARP抑制剂)能够显著降低高危患者在完成标准化疗后乳腺癌复发的风险,手术和放射治疗。题为“BRCA1或BRCA2突变乳腺癌患者的辅助奥拉帕利,这篇论文发表在6月3日出版的《新英格兰医学杂志》上,并将于6月6日作为第一篇摘要在2021年美国临床肿瘤学协会(ASCO)年会的全体会议上发表。主要作者兼奥林匹亚试验指导委员会主席安德鲁·图特,医学博士。,伦敦国王学院癌症研究所的首席研究员是在美国以外的患者中进行的部分研究,并将在ASCO上展示研究结果

    来源:Houston Methodist

    时间:2021-06-07

  • 双管齐下!治疗地中海贫血的新方法

    费城儿童医院的研究人员开发出一种治疗血液疾病(比如镰状细胞病和β-地中海贫血)的概念验证疗法,这种疗法可以通过激活胎儿和成人血红蛋白的产生来提高血红蛋白水平。研究人员利用一种病毒载体来重新激活胎儿血红蛋白的产生,抑制突变血红蛋白,并提供功能性的成人血红蛋白。这项研究结果于近日发表在《Haematologica》杂志上。资深作者Stefano Rivella博士说:“到目前为止,研究人员一直通过两种方法来治疗镰状细胞病或β-地中海贫血等血液疾病:一是增加成人血红蛋白基因的功能拷贝,二是增加胎儿血红蛋白的产生。在这项研究中,我们同时开展了这两项研究,为这些患者产生更多的血红蛋白提供了机会。”镰状细

    来源:生物通

    时间:2021-06-03

  • Webinar邀请 | 高通量qPCR技术助力抗生素抗性基因研究专题分享会

    新冠疫情爆发以来,环境中微生物对公共卫生安全的潜在影响受到广泛关注。在临床与农业生产中,均存在抗生素过量使用现象。由此也引出了一个被日渐重视的问题——抗生素耐药菌。从第一种商品化合成抗菌药“百浪多息”面世以来,经过漫长的发展,目前已有上百种可供使用的抗生素类型。而另一方面,得到鉴定的耐药基因(Antimicrobial resistance genes,ARGs)也达到了数千种。对各类型样本中不同耐药基因序列开展研究与评估,需要更加高效的高通量技术进行应对。此外,在复杂的环境背景下,各类微生物也在不断地发展出新的ARGs,所以对于高通量技术也要求具备更好的灵活性,以应对持续地增加新目标基因,以

    来源:Takara

    时间:2021-06-02

  • 选择更好的避孕方法可以预防乳腺癌

          图像:导管内注射正常人类乳腺上皮细胞的小鼠乳腺的荧光立体显微图像。资料来源:玛丽·沙姆塞丁(EPFL)。激素避孕,如口服避孕药,和阴道环,含有人工合成的激素避孕通过停止排卵,改变宫颈粘液阻止精子通过宫颈和找到一个鸡蛋,或改变子宫的衬里防止受精卵植入。尽管激素避孕药被广泛使用,但众所周知,它会增加乳腺癌的风险,而乳腺癌是全球妇女与癌症相关的死亡的最常见原因,也是2020年最常见的诊断癌症名单上的首位。激素避孕药的主要成分是黄体酮,它与女性的性激素黄体酮相似。孕激素参与许多生物过程,包括月经周期、怀孕和胎儿发育的各个方面,如大脑编程。现在,一个由欧洲医

    来源:EMBO Molecular Medicine

    时间:2021-06-02

  • 牛津纳米孔技术公司超长DNA测序试剂盒

    Oxford Nanopore Technologies发布了新的超长DNA测序试剂盒,用于与Circulomics的Nanobind试剂盒结合使用。这种基于转座的试剂盒最大限度地提高了超长读长的数量,能够对单个DNA片段进行长达4.2 Mb的连续测序。每个PromethIon流细胞可以获得超过100个超过1mb的读取。立即索取Apogee超灵敏纳米流式细胞仪的更多资料

    来源:genomeweb

    时间:2021-06-02

  • 铁蛋白多聚抗原-抗体检测自身免疫病新方法

      自身免疫疾病是机体针对自身抗原产生大量自身抗体后引起的慢性全身性疾病。因此,检测患者体内特异性的自身抗体是诊断该病的主要指标。例如,用ELISA检测原发性干燥综合征(Primary Sjogren's syndrome, pSS)患者血清中的抗M3及α-fodrin抗体,为其诊断提供了重要参考。然而,目前存在的问题是M3及α-fodrin短肽检测其抗体的敏感度较低,临床存在漏诊现象。  为了提高自身免疫疾病的诊断效率,中国科学院生物物理研究所阎锡蕴院士团队与北京大学人民医院栗占国教授团队合作,以pSS为研究模型发展了一种基于铁蛋白展示多聚抗原和多聚二抗检测自身抗体的新方法,使其检测

    来源:中国科学院生物物理研究所

    时间:2021-06-01


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