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  • 一种检测单细胞mRNA动态变化的新方法:scNT-seq

    在细胞命运转化和响应外界信号的过程中,细胞类型特异性基因表达会发生变化,RNA水平的动态变化受到RNA转录、加工和降解相互作用的调控。在具有多种细胞类型的复杂组织和系统中,准确判断这些mRNA在单细胞水平上的动态变化对于理解基因表达的调控非常重要。单细胞RNA测序(scRNA-seq)的最新进展导致了对细胞类型和状态的异质性的更完整的理解。然而,传统的单细胞转录组测序技术可以揭示不同细胞类型的稳定转录组,但不能准确区分特定时间内新生成和存在的mRNA。通常用于在同一转录组中区分新旧RNA的方法依赖于利用外源性核苷类似物4-硫脲(4sU)和生化富集标记RNA的RNA代谢标记。但它们需要充足的起始

    来源:creative biogene

    时间:2021-04-12

  • 一种新的血液检测方法将能检测抑郁症,双相情感障碍

    在世界范围内,每4个人中就有1人会在一生中遭受抑郁发作。虽然目前的诊断和治疗方法主要是反复试验,但印第安纳大学医学院研究人员的一项突破性研究揭示了情绪障碍的生物学基础,这项研究由伊利诺伊大学医学院精神病学教授Alexander B.Niculescu博士领导,发表在今天的高影响力杂志《分子精神病学》上。这项工作建立在尼古列斯库和他的同事以前对追踪自杀、疼痛、创伤后应激障碍和阿尔茨海默病的血液生物标记物进行的研究基础上。“在过去20年中,特别是在过去10年中,我们开创了精神病精确医学领域的先河。尼古列斯库说:“这项研究代表了我们努力的最新成果。”这是我们努力将精神病学从19世纪带入21世纪的一部

    来源:Indiana University School of Medicine

    时间:2021-04-09

  • Science Advances:预测组织特异性基因表达的新方法

    复杂疾病往往涉及到多种组织中的转录失调。因此,了解组织特异性的基因表达有望提供某个人健康状况的重要信息。然而,许多受到疾病影响的组织不容易采样和分析。于是,美国国家癌症研究所(NCI)的研究人员想了解是否能够从全血转录组来推断组织特异性的基因表达。国家癌症研究所的Sridhar Hannenhalli及其同事利用基因型-组织表达(GTEx)项目数据来测试模型,以便根据全血样本来预测组织特异性的基因表达。他们发现,对于30多种不同的组织类型,其中一种模型可以预测约60%基因的组织特异性表达水平,其中骨骼肌的基因比例更高。这项成果于上周五发表在《Science Advances》杂志上。研究人员认

    来源:生物通

    时间:2021-04-08

  • PNAS建立早期预测肿瘤放疗远隔效应的核医学显像方法

    放疗是目前临床上应用最广泛的肿瘤治疗手段之一,大约60%的肿瘤患者在病程不同时期需要接受放疗。放疗通常被认为是一种局部的肿瘤治疗手段,然而其“远隔效应”(abscopal effect)越来越受到人们的关注。“远隔效应”是指对肿瘤进行局部放疗,其远端未经辐照的肿瘤或转移病灶也可出现明显缩小或消失。这一现象早在1953年就被Mole发现和提出,但由于在临床上非常罕见,60余年来通常只在临床个案中被报道。近些年来,随着免疫治疗在临床上的广泛应用,放疗联合免疫治疗引发的远隔效应显著增多,但其作用机制仍不完全清楚。因此,解析和确认肿瘤放疗远隔效应中起关键作用的分子靶点对早期预测未辐照病灶的治疗效果,以

    来源:

    时间:2021-04-08

  • 一次发现两种小细胞肺癌治疗方法

          图片:培养中的小细胞肺癌细胞(蓝色),非内分泌细胞被染成红色。尽管治疗取得了许多进展,但小细胞肺癌的诊断意味着预后特别差。在德国,每年诊断出多达8000例新的小细胞肺癌(SCLC)。在诊断时,癌症已经发现许多漏洞可以逃脱身体的免疫系统传统的“细胞死亡机制,例如通过细胞凋亡调节的细胞死亡,通常在此阶段已经失活。这样,肿瘤细胞可以继续分裂并几乎不受干扰地扩散。由生物学家Silvia von Karstedt博士领导的一个研究小组使用小细胞肺肿瘤样本,发现了两种诱导肿瘤细胞死亡的新方法。肿瘤细胞的两个亚群之一可以通过激活铁死亡来靶向:由氧化应激引起的铁依

    来源:Nature Communications

    时间:2021-04-08

  • 纳米孔技术在细菌和微生物群落中发现多类型DNA甲基化

          西奈山伊坎医学院遗传学和基因组科学,Gang Fang副教授细菌DNA甲基化发生在不同的序列环境中,在细胞防御和基因调控中起着重要的作用。越来越多的研究报道,细菌DNA甲基化对临床相关表型如毒力、宿主定植、产孢、生物膜形成等具有重要作用。细菌甲基化包含三种主要形式的DNA甲基化:N6-甲基腺嘌呤(6mA), N4-甲基胞嘧啶(4mC)和5-甲基胞嘧啶(5mC)。在哺乳动物基因组DNA甲基化定位中广泛使用的亚硫酸氢盐测序(bisulfite sequencing)并不能有效地分解细菌甲基化组。单分子实时(Single molecule real-ti

    来源:Nature

    时间:2021-04-07

  • 新RNA测序方法打开了潘多拉之盒

    潘多拉(PANDORA)是美国加州大学河滨分校(UCR)的科学家们开发的一种新的RNA测序方法。与潘多拉盒子不同的是,潘多拉盒子指的是由于一个简单的错误计算而引起的无尽的复杂或麻烦的来源,这个潘多拉可能是一个机会的来源,因为它可以帮助发现许多以前无法检测到的修饰过的小rna。研究人员已经将他们的研究方法和发现发表在《自然细胞生物学》上,论文题为《PANDORA-seq通过克服RNA修饰扩展了调节小RNA的全部功能》。研究人员写道:“尽管高通量RNA测序(RNA-seq)极大地促进了小非编码RNA (sncRNA)的发现,但目前广泛使用的互补DNA库构建协议产生了偏置的测序结果。”“部分原因是R

    来源:UC Riverside

    时间:2021-04-07

  • 用玻璃纳米孔捕获游离DNA的创新技术

    DNA测序已经变得如此普遍,几乎没有人意识到从生物样本中提取单个DNA分子是多么困难。加州大学河沿分校(UC Riverside)领导的一项研究,利用微小的玻璃管和电流,使得从血液等液体样本中检测和捕获DNA变得更加容易。这项发表在《纳米尺度》杂志上的技术还可以改善未来的癌症诊断。DNA是一种双链的带电分子,它包含有机体创造和组织生命所需的所有信息,紧紧地折叠在细胞核内。从单个细胞中提取DNA既费时又不实用,对许多医学和科学目的来说都是如此。幸运的是,当细胞自然死亡时,它们的细胞膜会破裂,释放包括DNA在内的物质。这意味着,例如,一份血液样本包含许多自由漂浮的DNA链,理论上,这些DNA更容易

    来源:Nanoscale

    时间:2021-04-07

  • Nature Methods:徐涛/纪伟团队在超分辨显微镜研制领域取得新突破

      4月1日,徐涛院士课题组与纪伟课题组在Nature Methods杂志发表了题为"Molecular-scale axial localization by repetitive optical selective exposure"的研究论文,提出了一种轴向单分子定位成像新技术,并据此研制出新型干涉定位显微镜(ROSE-Z),把单分子定位成像的轴向分辨率提升到了纳米尺度。  这是该团队在2019年超高分辨成像重大成果(Nature Methods,2019,https://doi.org/10.1038/s41592-019-0544-2)的延续,在侧向分辨极限已突破

    来源:中国科学院生物物理研究所

    时间:2021-04-06

  • 为什么越老越糊涂?《Science》新技术Repair-seq提示神经元损伤修复的关键

    神经元缺乏复制DNA的能力,因此它们必须不断努力修复对其基因组的损害。现在,Salk科学家的一项新研究发现,这些修复不是随机的,而是专注于保护某些似乎在神经身份和功能中起关键作用的遗传“热点”。该研究结果发表于2021年4月2日的“Science”杂志,对衰老和神经退行性疾病的遗传结构提供了新的见解,并可能指出痴呆症、阿尔茨海默氏症,帕金森病和其他与衰老相关的疾病的潜在新疗法的发展。该论文的共同作者兼Salk所长Rusty Gage教授说:“这项研究首次表明,神经元在修复过程中优先考虑的基因组部分。我们对这些发现可能改变我们对许多与衰老有关的神经系统疾病的看法并潜在地探索DNA修复作为一种治疗

    来源:Salk

    时间:2021-04-05

  • AI宫颈癌检测技术可能取代巴氏涂片检查 拯救生命

          图像:用于即时HPV检测的HPV人工智能监测(AIM-HPV)设备。图片来源: 麻省总医院系统生物学中心子宫颈癌是世界第四大常见癌症,每年确诊病例超过50万例。几乎所有的子宫颈癌病例都是由人乳头瘤病毒引起的。检测到体内的癌前病变,医生就有机会治愈一种致命的癌症。巴氏涂片法于20世纪40年代被引入,如果定期进行,这种检测可以检测出大约80%的宫颈癌患者,大大减少了因宫颈癌而造成的死亡。可以说巴氏涂片检查在降低癌症死亡率方面创造了奇迹,因为宫颈癌这种癌症在早期发现时是可以治愈的,而在晚期发现时几乎总是致命的。但是,巴氏涂片是主观的,并不总是可靠的。它需

    来源:Biophysics Reviews

    时间:2021-04-01

  • 重磅综述:隐形眼镜技术之未来 有望检测癌症、治疗疾病和取代数字屏幕

          图像:《隐形眼镜技术之未来》对未来的隐形眼镜的发展进行了全面的回顾,将常用矫正屈光不正的医疗设备推向更广泛的应用领域,包括疾病检测,治疗和取代数字屏幕  来源::视觉研究与教育中心(CORE)滑铁卢,安大略省,2021年3月29日——一篇新发表的论文对隐形眼镜技术发展进行了可谓最全面的评述,将这种常用医疗设备的应用范围扩大到屈光不正矫正以外的领域。英国隐形眼镜协会(BCLA)的同行评议期刊Contact lenses and front Eye发表了《隐形眼镜技术之未来》(Jones L等)。它和其他九篇论文一起将在下个月的特别版上印刷,

    来源:Contact Lens & Anterior Eye: The Journal of the British Contact Lens Association

    时间:2021-03-31

  • 新的研究方法发现2种新的南美猫头鹰

           图片:两种新的南美猫头鹰  左:Xingu Screech Owl 右: Alagoas Screech Owl来源:赫尔辛基大学。赫尔辛基大学领导的一项新研究对南美猫头鹰新物种进行识别,确认两种新的南美猫头鹰:兴谷鸮和阿拉戈斯鸮。赫尔辛基大学和巴西和美国的研究人员发表了一项详细的研究报告,从形态学、声音和遗传变异上对从南美洲的亚马逊和大西洋森林地区的猫头鹰(Megascops atricapilla - m . watsonii)进行识别。这类角鸮的实际种类数量一直不确定,在2021年初,两种新的角鸮在同一份

    来源:Zootaxa

    时间:2021-03-31

  • Nature:新技术描绘COVID-19肺部病理详细图

          图像:在COVID-19晚期,免疫细胞(红色)在导致纤维化的细胞(绿色)附近移动图片来源:André Rendeiro。由威尔·康奈尔医学院(Weill Cornell Medicine)和纽约长老会医院(NewYork-Presbyterian)的研究人员领导的一个团队使用先进技术和分析技术,以单细胞分辨率绘制了COVID-19重症和其他传染性肺部疾病患者病变肺组织的细胞景观。在3月29日在线发表在《Nature》杂志上的这项研究中,研究人员对解剖后的肺组织进行了成像,同时突出了细胞上的几十个分子标记。使用新颖的分析工具分析这些数据,揭示了对这些

    来源:Nature

    时间:2021-03-31

  • 更快、更少侵入性的原子力显微镜技术AFM

          图像:(a)光栅扫描:样品阶段的追踪扫描(红线)和回描扫描(蓝线图片来源: KANAZAWA UNIVERSITY高速原子力显微镜(HS-AFM,High-speed atomic force microscopy)是一种成像技术,可用于生物进程——如蛋白质活性的可视化。现在,典型的HS-AFM帧率高达每秒12帧。为了提高该方法的性能,使其能够应用于更大范围的生物样本,需要更好的视频速度( video rate)。此外,更快的记录时间意味着tip扫描样品表面过程中,样品和探针之间的相互作用更少——这使得成像过程的侵入性更小。现在

    来源:Review of Scientific Instruments

    时间:2021-03-31

  • 骨折新疗法:纳米技术检测骨愈合干细胞

    南安普敦大学的研究人员开发了一种使用纳米材料识别和富集骨骼干细胞的新方法-这一发现最终可能导致对主要骨折的新治疗以及骨丢失或受损的修复。物理学家,化学家和组织工程专家团队共同努力,使用专门设计的金纳米粒子“寻找”特定的人体骨干细胞-产生荧光辉光,揭示它们在其他类型细胞中的存在,并允许它们被分离或'丰富'。研究人员得出结论,他们的新技术比其他方法更简单,更快,富集干细胞的效率高达50-500倍。该研究由肌肉骨骼科学教授Richard Oreffo和物理与天文学学院量子、光与物质组Antonios Kanaras教授领导,发表在ACS Nano。在实验室测试中,研究人员使用金纳米粒

    来源:ACS Nano

    时间:2021-03-31

  • 研究人员开发了识别癌症突变特征的新方法

    约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的研究人员使用机器学习技术来检测癌症患者的突变特征。他们的算法优于当前的分析标准,并揭示了与肥胖相关的新的突变特征,癌症预防专家认为,肥胖正成为美国和大多数西方国家导致癌症的最重要的生活方式因素。这项研究发表在1月25日的eLife杂志上。“突变签名很重要在当前癌症研究,因为他们让你看到潜在因素留下的迹象,如老化、吸烟、饮酒、紫外线照射、和BRCA遗传突变导致癌症的发展,”研究负责人说,克里斯蒂安·Tomasetti,博士,肿瘤学副教授约翰霍普金斯Kimmel癌症中心,与生物统计学联合任命约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学院的。这项新技术使用了一种被称为机器学习

    来源:eLife

    时间:2021-03-31

  • Cell突破性成果:首次创造出可以正常生长和分裂的简单合成细胞

    五年前,科学家创造了一种只有473个基因的单细胞合成生物,是当时已知的最简单的活细胞。但是,这种细菌样生物在生长和分裂时表现异常,产生形状和大小完全不同的细胞。现在,科学家们已经鉴定出七个可以添加的基因,可以驯服细胞的不守规矩,使它们整齐地分裂均匀的细胞。这项成就是由J. Craig Venter研究所(JCVI),美国国家标准技术研究院(NIST)和麻省理工学院(MIT)等处合作完成的,发布在Cell杂志上。鉴定这些基因是工程合成有用细胞的重要一步。这种细胞可以充当生产药物,食品和燃料的小型工厂。文章作者Elizabeth Strychalski说:“我们想了解细胞的基本设计规则。” “如果

    来源:生物通

    时间:2021-03-30

  • 新冠病毒疫苗接种技术指南(第一版)

    目前,我国已有5个生产企业的新冠病毒疫苗批准附条件上市或紧急使用。附条件批准上市的3个灭活疫苗和腺病毒载体疫苗Ⅲ期临床试验期中分析结果显示,疫苗保护效力均达到国家药品监督管理局《新型冠状病毒预防用疫苗临床评价指导原则(试行)》的要求,也符合世界卫生组织《新冠病毒疫苗目标产品特性》推荐的指标要求。临床试验和紧急使用阶段及前期重点人群较大规模接种后疑似预防接种异常反应监测数据表明,新冠病毒疫苗安全性良好。获批紧急使用的重组新冠病毒疫苗(CHO细胞)Ⅱ期临床试验结果显示具有良好的免疫原性和安全性。基于我国获批疫苗的临床试验研究数据和新冠肺炎的流行病学特征,中国疾病预防控制中心新冠病毒疫苗工作组起草了

    来源:国家卫健委

    时间:2021-03-30

  • 新纳米技术促进了癌症和疾病的检测

    在癌症和疾病诊断中,早期筛查意味着生与死的区别。这就是为什么中佛罗里达大学(University of Central Florida)的研究人员正在努力开发一种新的筛查技术,它在检测癌症等疾病的生物标志物方面的有效性是目前方法的300多倍。这项技术最近发表在《美国化学学会杂志》上,它使用具有富镍核和富铂壳的纳米颗粒来增加酶联免疫吸附试验(ELISA)的敏感性。酶联免疫吸附法(ELISA)是一种检测样本中生化物质的测试方法,如抗体和蛋白质,可以检测出是否有癌症、艾滋病毒、怀孕等。当一种生化物质被检测到时,该测试产生一种颜色输出,可用于量化其浓度。颜色越浓,浓度越高。检测必须敏感,以防止可能延误

    来源:Journal of American Chemical Society

    时间:2021-03-29


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