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Nature子刊开创细胞发育动力学研究新技术
生物通报道:当细胞被激活,或者对其环境变化进行响应的时候,细胞内部会发生什么呢?来自VIB-UGent炎症研究中心的研究人员开发了一种能模拟这些细胞动力学的新技术。这不仅能在整个细胞生长和生命周期中追踪细胞,而且还可以评估计算生物学方法效果。这一研究成果公布在Nature Biotechnology杂志上。识别单个细胞的轨迹细胞在不断变化,它们经历着分裂,变化,被环境激活。细胞会在这些每个过程中选择数千途径中的一种,如果能追踪它们的轨迹,就能更清楚明了的理解细胞的机制。由于单细胞技术的进步,研究这些细胞轨迹最近变得越来越容易,科学家可以以前所未有的细节分析单个细胞。结合计算方法,看到细胞在生物
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单细胞测序方法这么多,用户该如何选择?
生物分子资源实验室协会(ABRF)是一个独特的会员协会,由700多名在资源和科研生物技术实验室工作的科学家组成。近日,ABRF 2019年会在美国圣安东尼奥市举行。与会人员称,研究人员目前有越来越多的单细胞测序方法可供选择。去年,ABRF的基因组学研究小组以乳腺癌细胞系为研究对象,报告了多个单细胞RNA测序平台的优缺点,希望能够帮助研究人员找到最合适的平台。在今年的会议上,发言者讨论了一些系统的优缺点,以及单细胞技术与其他组学技术如何互补。苏黎世联邦理工学院的EmilioYángüez在会上表示:“单细胞测序正在改变我们对生物过程的了解。”他指出,现在有许多不同的方案,可用于单细胞的分离和分析
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比传统方法高出10倍!Nature Methods发布一种可以识别未知代谢物的新技术
生物通报道:日本RIKEN可持续资源科学中心(CSRS)的研究人员开发了一种新质谱系统,可以识别代谢组(不同生物体的整套代谢物)。研究证实,当对来自12种植物物种的组织进行检测时,这种方法能够记录超过一千种代谢物。其中包括以前从未发现的数十种,而且还有那些具有抗生素和抗癌潜力的一些代谢物。这一研究发现公布在Nature Methods杂志上。常见的止痛药阿司匹林(乙酰水杨酸)最初是在19世纪制造出来的,这种药物其实在几千年前的粘土中就有描述过,然而在发现了一种新的合成方法之后,在世界各地使用了这种药物近70年之后,科学家才终于能够理解了它是如何工作的。这是一个漫长的历史过程,这也告诉我们植物虽
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无需多组学,肿瘤研究新突破
在癌症基因组序列的突变信息被广泛研究之后,研究热点逐渐转向基因组的三维结构如何参与癌症的发生和发展。一直以来Hi-C技术在肿瘤三维基因组研究中功不可没。2015年乳腺癌[1]三维基因组学研究发现,肿瘤样本的染色体中部分A/B compartment结构发生转化,这些转化区域中的很多基因和癌症重要通路WNT相关;同年,前列腺癌[2]Hi-C研究发现,癌细胞中TADs结构增多,包含TP53基因座的片段缺失促进形成了新的TAD结构;2017年多发性骨髓瘤[3]Hi-C研究发现,癌症基因组上存在大量染色体之间的相互作用的热点,Hi-C数据可用于检测基因组拷贝数变异和推测染色质易位事件。由于癌症基因组变
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Cell Discovery:优化基因编辑和追踪DNA修复的新方法
CRISPR/Cas9 (clustered regularly interspaced short palindromic repeats and CRISPR-associated proteins)是目前最常用的基因编辑工具酶,在科研领域被广泛应用,而在临床方面的应用因为其脱靶活性一度停滞不前。它通过guide RNA(gRNA)与靶向DNA序列的配对,从而将Cas9锚定在靶向基因并诱导产生DNA双链断裂(DSB)。在基因编辑诱发的DSB的修复过程中,一定几率会产生基因突变或者外源DNA片段的插入,从而达到基因编辑的目的。在实际应用过程中,一个好的基因编辑酶Cas9需要同时满足高效切割
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2019年度国家科学技术奖受理项目公示(生物类)
国家科学技术奖励工作办公室公告第92号 2019年度国家科学技术奖提名工作已结束,我办共收到有关单位和专家提名的国家自然科学奖项目295项,国家技术发明奖项目298项(通用项目239项,专用项目59项),国家科学技术进步奖项目956项(通用项目784项,专用项目172项)。根据《国家科学技术奖励条例实施细则》的规定,对形式审查合格的2019年度国家自然科学奖项目290项、国家技术发明奖通用项目234项以及国家科学技术进步奖通用项目767项予以受理,在科技部网站(http://www.most.gov.cn)和我办网站(http://www.nosta.gov.cn)同时公布。专用项目
来源:国家科学技术奖励工作办公室
时间:2019-03-27
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从表观遗传学下手,取得植物病害防治的一大突破
由英国谢菲尔德大学领导,研究小组首次确定了植物染色体特定“座(loci)”,通过进行可逆的生化修饰(DNA甲基化),以应对病原体攻击,从而将抗病性传递给后代。这项研究发表在eLife杂志,确定了四个对霜霉病(downy mildew)有抗病性的DNA loci。重要的是,这种抵抗与其他任何负面生长影响或环境胁迫抗性无关。Ritushree Jain博士说,当植物反复受到病原体攻击时,它们就会形成一种“记忆”,使它们在再次受到攻击时能有效地战斗。“通过种子,将这种‘记忆’传递给下一代的机制之一,是DNA甲基化,”Jain博士说。“这是一种表观遗传现象——意味着DNA序列没有变化。”“这一重大发现
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郭鹏:一种新颖的癌症精准治疗新方法,遏制癌细胞生长
生物通报道:所有乳腺癌中约有15%至20%是三阴性,这意味着这些患者缺乏雌激素,黄体酮和2型人表皮生长因子的受体,因此是所有乳腺癌中预后最差的,可以选择的治疗方法非常有限。为了寻找能区分癌细胞和正常细胞的治疗方法,波士顿儿童医院的一组研究人员提出了一种新颖的精准医疗方法,通过双重靶向,抗体引导的纳米颗粒,进行现有的化疗药物治疗,能显著肿瘤靶向,减少癌细胞生长,以及转移,实验证明这能改善患有三阴性乳腺癌的小鼠模型的存活率,而且没有观察到副作用。这一研究成果公布在今天的Science Advances杂志上。这项研究由波士顿儿童医院Moses实验室华人学者郭鹏(Peng Guo)和杨江(Jiang
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历史性突破,K-Ras突变引发的癌症不再“无药可治”
在Ras基因家族中,与人类癌症相关的有三种:H-Ras、N-Ras和K-Ras。其中K-Ras对肿瘤的影响最大,它就像体内的一个基因“开关”,正常情况下,对肿瘤细胞生长及血管生成等过程的信号传导起着重要调控作用,可以抑制肿瘤细胞生长;但是K-Ras基因发生突变,就会使细胞持续生长,并抑制细胞自噬,使细胞内细胞转导紊乱,细胞增殖失控而发生癌变。很多癌症都与K-Ras突变有关,如肺癌、胰腺癌、结直肠癌等,并且现有药物不能通过抑制RAS蛋白达到治疗癌症的效果。因此,提出替代治疗策略,通过使用MAPK激酶(MEK)抑制剂阻断MAPK信号传导,靶向K-Ras的下游效应物,但是由于耐药性,使得MEK抑制剂
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PNAS:一种高敏感和高特异性的细胞死亡检测方法
生物通报道:细胞死亡是健康和疾病状态下人类生物学的一个重要特征。它可以预示病理早期阶段(例如形成中的肿瘤或自身免疫疾病/神经退行性疾病的开始),标志疾病进展,反映治疗的成功(如抗癌药物),鉴别治疗意外的毒性作用等等。然而直到现在,都不大可能在特定人类组织中非侵入性地检测细胞死亡。来自耶路撒冷希伯来大学的一组研究人员研发出了一种可以高度敏感和特异的方式检测多种病理过程,包括糖尿病、癌症、外伤和神经退行性变的血液测试方法。这种新方法是根据濒死细胞释放的循环DNA的甲基化模式来推测特定组织中的细胞死亡。这一研究成果公布在PNAS杂志上。在这篇文章中,研究人员聚集了320名患者和对照者,新的血液测试通
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山东大学两位教授今日发表Cell文章 获减数分裂研究重大突破
减数分裂是有性生殖的必经过程。精子和卵细胞必须经过减数分裂才能产生。减数分裂过程要发生同源染色体配对、联会和重组等复杂的事件。交叉重组(crossover)是减数分裂的核心事件。交叉重组建立同源染色体之间的物理连接,保证染色体正确分离;同时会引起双亲遗传物质相互交换,增加物种的遗传多样性。如果交叉重组不能形成或者其数目/分布异常,则会导致配子无法形成或产生异常配子。但是,人们对减数分裂交叉重组调控的分子机制,及其在生物进化适应中的意义,还缺乏深入了解。来自山东大学生殖医学研究中心,哈佛大学的研究人员发表了题为“Per-nucleus crossover covariation and impl
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最新研究:RNA表观遗传修饰化学调控的新研究方法
RNA的表观遗传修饰是RNA调节基因表达的化学基础,利用新反应技术和新分子工具对RNA修饰进行精准调控对揭示RNA介导的遗传信息表达网络具有重要意义。然而由于RNA本身的不稳定性,使得在活细胞水平进行化学调控变得异常艰难。N6-甲基腺嘌呤(m6A)是真核生物最常见和最丰富的一种修饰,占甲基化修饰的80%以上。m6A修饰广泛参与调控mRNA的剪接、运输、稳定性和翻译效率等,并且与肥胖和肿瘤等多种生理功能异常及疾病相关。发展能够直接与m6A修饰进行相互作用的小分子化合物,以此实现在细胞水平上特异性识别m6A修饰并且进行选择性调控,更加精确地描绘RNA的修饰动态过程及其效应,具有十分重要的生物学意义
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2019何梁何利基金科学技术奖候选人开始提名
教技厅函〔2019〕30号部属各高等学校、部省合建各高等学校:根据《关于提名2019年度何梁何利基金科学与技术奖候选人的通知》〔(2019)HLHL003号,以下简称《通知》,网址 http://www.hlhl.org.cn/〕要求,为做好教育部提名工作,现将有关事项通知如下:1.请各高校仔细阅读《通知》要求,按照基金评选条件和标准,认真组织遴选。各高校可提名“科学与技术进步奖”或“科学与技术创新奖”候选人不超过1名。2.各提名高校需按照《通知》要求,于2019年3月14日(周四)前提交电子版提名材料(光盘),逾期恕不受理。光盘内容为提名系统软件生成的上报数据文件(hnf后缀文件)和提名书w
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Nature Communications:第二代的锌指核酸酶技术
Sangamo Therapeutics公司的研究人员上周五在《Nature Communications》杂志上发表题为“Diversifying the Structure of Zinc Finger Nucleases for High-Precision Genome Editing”的文章,展示了其第二代的锌指核酸酶(ZFN)技术。据Sangamo介绍,这些改进使得ZFN的多样性增加到64倍,从而有望对特定基因组位点进行高度精确的编辑。文章的通讯作者Edward J. Rebar博士是Sangamo的高级副总裁兼首席技术官,第一作者是David Paschon博士。Paschon博
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诚聘科学家!赛默飞诚聘技术应用专家
【热招职位】Technical Applications Scientist 技术应用科学家-北京Objective:To provide quality technical support to ensure that customers receive accurate advice on product use, guidance on product selection, and resolution of technical complaints.Main Responsibilities:Respond to customers' inquiries regarding the p
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华大智造AGBT会议上发布最新技术CoolNGS,提供更高质量测序
当地时间3月2日,美国佛罗里达州,华大智造在2019年基因组生物学技术进展大会(Advances in Genome Biology and Technology, AGBT)上,发布了最新的碱基识别技术CoolNGS。华大智造首席科学家Radoje Drmanac博士、美国分公司总经理谭宏东博士受邀出席会议,并发表主题演讲。AGBT大会每年年初在美国佛罗里达州马可岛举办,主要交流探讨全球领先的测序方法及技术应用等方面进展,也被认为是基因测序技术领域最高规格全球盛会之一。识别无损碱基,加速突破读长极限华大智造作为全球领先的基因测序设备提供商,致力于基因测序技术突破和创新,为行业注入新生力量。自
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MIT Technology Review:2019年十大突破技术
《麻省理工商业评论》(MIT Technology Review)杂志于近日评出了2019年度十大突破技术(10 Breakthrough Technologies 2019)。与以往不同的是,本次活动邀请了比尔•盖茨作为评委。“当MIT Technology Review邀请我成为十大突破技术的首位客座评选人时,我感到很荣幸。缩小这份列表是一件困难的事。我想选择那些不仅在2019年成为头条新闻,而且在技术史上拥有一瞬间的技术,”他谈道。比尔•盖茨挑选出的“十大突破技术”分别是:灵巧机器人、核能新浪潮、早产预测、肠道探测药片、定制癌症疫苗、人造肉汉堡、二氧化碳捕集器、可
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液体核磁共振波谱技术解析癌基因蛋白Ras活性态変构动力学
作为细胞内关键的信号转导分子,Ras蛋白的活性改变与人类恶性肿瘤的发生密切相关,也因此成为抗癌药物研制的重要靶标。 近日,中国科学技术大学龙冬教授课题组运用液体核磁共振波谱方法在癌基因蛋白Ras活性态変构动力学研究领域取得重要新进展,相关成果以“Extending the Lifetime of Native GTP-Bound Ras for Site-Resolved NMR Measurements: Quantifying the Allosteric Dynamics”为题发表于著名学术期刊《Angewandte Chemie International Edition》。
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Nature发布CAR-T细胞疗法突破性进展:解决T细胞衰竭问题
生物通报道:越来越多的癌症患者选择了CAR-T细胞疗法,这是一种颇有前途的新疗法,采用患者自身的T细胞进行基因工程,更好地识别癌细胞,然后将细胞送回患者体内,发起免疫反应摧毁癌症。CAR-T细胞疗法已经成功挽救了不少患有血癌的患者生命,但是这种疗法存在一个缺点:由于存在T细胞衰竭的现象,进入实体瘤的T细胞可能停止工作。来自拉霍亚免疫学研究所(LJI)的科学家发布了一项最新研究,找到了一种抵抗T细胞衰竭并使CAR-T细胞疗法更有效的方法。他们指出一个名为Nr4a转录因子的蛋白质家族在调节与T细胞衰竭相关的基因方面具有突出作用。科学家们利用小鼠模型证明,用缺乏这些Nr4a转录因子的CAR-T细胞治
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基于数字PCR技术的胎儿染色体非整倍体无创产前检测新方法
胎儿染色体非整倍体异常是严重的出生缺陷,最常见的包括21-三体综合征(即唐氏综合征,其未干预的综合发病率高达1/750,且随着孕妇年龄增加风险急剧增大)、18-三体综合征和13-三体综合征等。这类疾病将导致新生儿出现智力低下、生长发育迟缓、多发畸形乃至死亡,且尚无有效治疗手段,而产前筛查和诊断可最有效的避免此类患儿的出生。自孕妇外周血中发现游离胎儿DNA以来,研究人员对其展开大量研究,发展出基于二代测序技术的无创产前检测技术(NIPT),此技术比传统唐氏综合征血清学筛查更准确,比羊水穿刺更安全。因为其无创、安全、准确的特点,受到医生和孕妇的认可并被临床快速接受,是目前二代测序技术最为成功的临床