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Nuleic Acids Res新技术:可编程的基因调控体系
生物通:科学家们开发了一个可编程的RNA转录激活系统,可以增加任意基因的表达水平。意大利SISSA的Antonello Mallamaci领导研究团队建立了一个可编程的蛋白-RNA复合体,该复合体可以促进目的基因的表达,进而引起表型改变。这一技术发表在近日的Nucleic Acids Research杂志上。“目前还需要进一步研究来认识和改进这一技术,该技术为我们提供了一个增加基因表达的新途径,很值得关注,”Duke大学的Charles Gersbach评论道。随着基因组编辑技术的突飞猛进,许多人在TALEN和CRISPR的基础上建立反式转录激活因子。Mallamaci等人却另辟蹊径,设计了一
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徐华强教授合作发表Cell Research文章 获遗传性病变研究突破
中国科学院上海药物研究所-美国温安洛研究所联合实验室的研究员徐华强团队与美国华盛顿大学教授许文清团队合作,共同解析了Wnt通路非经典配体Norrin和Wnt受体Frizzled 4(Fz4)富含半胱氨酸结构域(cysteine rich domain, CRD)复合物的晶体结构,该结构从分子水平揭示了Norrin信号通路激活的分子机制,并为防治视网膜病变提供了新思路。研究论文于7月31日发表在Cell Research 杂志上。 Norrin又被称为诺里病蛋白或X染色体相关的家族性渗出性玻璃体视网膜病变蛋白,是一种分泌型视网膜生长因子,具有血管生成和神经保护的功能,与诺里病等视网膜病变密切
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赛默飞发布食品组学辨别植物油分类方法
2015年8月7日,上海——科学服务领域的世界领导者赛默飞世尔科技(以下简称:赛默飞)近日发布了采用 Thermo Scientific™ Q Exactive™ 组合型四极杆 Orbitrap 质谱仪及相关组学软件,开发的基于脂质轮廓谱的食品组学辨别食用植物油分类的方法。在食品组学中,高分辨质谱为研究表征功能蛋白与活性小分子物质群提供了有力技术手段。食品组学(Foodomics)是以食品为研究对象,整合运用各种先进组学技术(-Omics)来研究食品科学与营养学中关键科学问题的一门新兴学科,可广泛应用于食品产地溯源/真实性判别、转基因分析、生产工艺优化等领域。食品组学的
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Cell:革命性技术再获新突破
生物通:微管是由微管蛋白tubulin聚合而成的中空纤维,这些纤维组成了细胞内的重要骨架,这一体系对于细胞的生长和分裂非常重要。细胞中的微管,处于不断组装和分解的动态平衡中。微管的动态不稳定性在细胞分裂过程中起到了至关重要的作用。加州大学的研究团队将高分辨率的冷冻电镜与独特的成像分析结合起来,获得了原子水平的微管图像,并由此鉴定了末端结合蛋白(EB)在调控微管动态中的关键作用。在有丝分裂过程中,微管通过解聚和重组形成纺锤体,拉动染色体使其平均分配给两个子细胞。这一过程出现问题会导致染色体数异常,进而引发癌症和其他疾病。染色体的移动依赖于微管的解聚,这种动态不稳定性是由GTP水解驱动的。“我们的
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Cell发布突破性基因组研究技术
生物通报道 来自美国麻省大学医学院的研究人员开发出了一项新技术,可以提供真核生物基因组的详细三维(3-D)图像,这有可能帮助科学家们解答一些有关染色质结构的关键问题。在发表于《细胞》(Cell)杂志上的研究论文中,这一称作为Micro-C的新技术使得研究人员能够以核小体分辨率来分析染色体折叠,填补了以往一些技术留下的分辨率缺口(延伸阅读:新技术分析单细胞的染色质构象 )。真核生物的基因组被包装成叫做染色质的DNA-蛋白质复合物,这使得DNA可以被压缩至较小的体积。核小体是染色质的基本重复单位,由DNA缠绕着8个组蛋白构成。在细胞分裂过程中,染色质进一步凝聚形成染色体。细胞可以通过改
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Nature子刊重要突破:全能细胞的诞生
生物通报道:多能细胞能够生成胚胎里所有类型的组织,从成体细胞获得多能细胞的技术已经相当成熟了。法国INSERM和德国马普所的研究团队日前获得了重大突破,成功诱导出了全能细胞。这一成果发表在八月三日的Nature Structural & Molecular Biology杂志上。在受精刚刚完成的时候胚胎只有一两个细胞,这些细胞是全能性的,可以生成完整的胚胎以及胎盘和脐带。在随后的细胞分裂中,胚胎细胞很快丧失了这种可塑性,成为了多能细胞。囊胚阶段(大约三十个细胞)的胚胎干细胞能够分化成为任何组织,但已经不能生成一个完整的胎儿。这些多能细胞会在发育过程中继续分化,形成机体内的各种组织。20
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Nature发布癌症研究突破性成果
生物通报道 在斯坦福Burnham Prebys医学研究所(SBP)与Argonne国家实验室的一项合作研究中,科学家们利用高度专业化的X-射线晶体学技术,解开了肿瘤低氧反应重要调控因子——低氧诱导因子(HIFs)的蛋白质结构。发表在今天《自然》(Nature)杂志上的研究结果,为找到一些新的药物通过切断氧气和营养物质供应来治疗肿瘤打开了大门。SBP代谢疾病项目教授Fraydoon Rastinejad博士说:“第一次,我们阐明了HIF1α和HIF2α与ARNT亚基形成的复合物的结构——这是HIF发挥功能必需的构型。通过显像这些多结构域结构,帮助我们了解了它们的药物结合能力,使得我
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清华大学Nature子刊发布mRNA研究新方法
生物通报道 来自清华大学、哥伦比亚大学的研究人员报告称,他们开发出了一种叫做mRIN的新方法,可用于直接评估来自大型RNA测序数据全基因组及基因特异性mRNA的完整性。这一重要的研究成果发布在8月3日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。哥伦比亚大学系统生物学系助理教授张朝林(Chaolin Zhang)是这篇论文的通讯作者。清华大学自动化系的张学工(Xuegong Zhang)教授及博士生冯会娟(Huijuan Feng)是这篇论文的合著作者。文章的第一研究机构为清华大学。mRNA测序(RNA-Seq)可以前所未有的深度、分辨率和覆盖度为我们提供数字
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Nature子刊发表干细胞重要突破
生物通报道:骨骼肌是人体内丰度最高的一种组织,但在实验室里却很难大量生产。近年来有许多人尝试过分化和培养骨骼肌,但成效均不显著。日前,布莱根妇女医院BWH的研究人员通过模拟重要的发育线索,成功用多能干细胞生成了肌纤维。他们在培养皿中获得了能够收缩的毫米级肌纤维,并对其进行了扩增。这一突破性成果发表在八月三日的Nature Biotechnology杂志上,为人们提供了研究肌病(比如肌营养不良症)和测试药物的理想模型。此前有研究者利用基因编辑技术在体外生成了少量的肌细胞,但BWH研究人员希望能够有效获得大量肌细胞以便将其用于临床。“我们选择了一条艰难的道路,在体外重建肌细胞发育的所有早期阶段,”
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一种降低外科手术风险的简单方法并不可靠
2007年和2008年,全球有8家医院的外科医生在一项试点研究中采用这份检查表。效果很明显,并发症如术后感染降低了超过1/3,而且死亡率下降了近一半。为此,WHO建议所有医院采用这份检查表或是类似的检查表,很多医院照做了。 英国国民医疗保健制度(NHS)在第一时间要求该国所有诊疗中心把检查表纳入日常医疗规范;到2012年,全球约有2000家医疗机构采用这份表格。在临床医学界,这份检查表作为一项简便且经济的挽救生命的方式已然站稳了脚跟。 事实上,这项检查表已经有许多积极拥护者,美国马萨诸塞州波士顿布莱根妇女医院医生Atul Gawande就是其中的一位。Gawande曾带领此
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Nature Methods发布新RNA测序技术
生物通报道:Santa Cruz公司和Rochester大学的研究人员开发了一种新的RNA测序技术。他们通过这一技术发现了许多此前未被检测到的调控性小RNA。这一成果发表在八月三日的Nature Methods杂志上。这个新技术可以在细胞中灵敏检测到带有化学修饰(甲基化)的小RNA。“tRNA是生物体内含量最丰富的小RNA之一,细胞里到处都是tRNA片段。但因为RNA修饰,标准的分析方法遗漏了许多tRNA,”文章的第一作者Aaron Cozen说。这一方法为人们打开了RNA研究的一块新天地,“我们检测到的tRNA比过去多三倍,”文章的资深作者,Todd Lowe教授说。早在数十年前人们就发现了
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Cell发布革命性成像技术
生物通报道 波士顿大学的科学家们开发出了一种新的成像工具,可以像探索太空的望远镜一样来探索大脑(延伸阅读:Cell重大飞跃:单细胞分辨率快速全脑成像 )。发布在7月30日《细胞》(Cell)杂志上的一篇论文,首次演示了这一技术是如何运作的,研究人员以从前无法实现的尺度观测了成年小鼠的大脑,生成了一些纳米级分辨率的图像。发明者表示他们的长期目标是,能够以一种国家大脑天文台的形式向科学界提供这一资源。论文的资深作者、哈佛大学Jeff Lichtman说:“我是自下而上科学的坚定信徒,我更倾向于通过数据推出假设,并检验它。对于从事成像工作的人而言,能够看见所有这些细节真是太美妙了,我们得
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技术变革:5分钟完成PCR!
生物通报道:最近,加州大学伯克利分校的生物工程学家,开发出一种新技术,通过用一种光开关,加速遗传学样本的加热和冷却,有望使PCR这种实验室主力工具更便宜、更方便,并将其速度提高很多倍。研究人员在七月三十一日的Nature子刊《Light: Science & Application》描述了这种涡轮增压热循环,其显著扩大了聚合酶链反应(PCR)试验的临床和研究应用,可在几分钟而不是一个小时或更多的时间内得出结果。相关研究结果:2014最受欢迎的PCR方法相关论文。PCR检测——扩增一段DNA序列的单拷贝以产生数千到数百万个拷贝,在基因组学应用中已经变得很重要,从克隆研究到法医分析到亲子鉴
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蒋华良、王明伟合作发表Nature子刊文章获突破性进展
《自然-通讯》于7月31日在线发表了中国科学院上海药物研究所蒋华良课题组和王明伟课题组与美国南加州大学Raymond C. Stevens、Scripps研究所Patrick Griffin和Bridget Carraghe、荷兰阿姆斯特丹自由大学Chris de Graaf和上海科技大学iHuman研究所宋高杰等实验室的合作研究成果。这项研究基于全长胰高血糖素受体的分子动力学模拟,提出了该受体胞外段与跨膜区的动态变化模式,通过配体结合和功能性实验验证了这种动态过程,并结合电子显微镜、氢氘交换、二硫键交联和质谱技术发现了该受体存在“开放”和“关闭”两种分子构象,从而为其本身以及其他B型G蛋白
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卫计委发布两份基因检测技术指南
国家卫生计生委医政医管局关于印发《药物代谢酶和药物作用靶点基因检测技术指南(试行)》和《肿瘤个体化治疗检测技术指南(试行)》的通知 国卫医医护便函〔2015〕240号 各省、自治区、直辖市卫生计生委医政医管(医政、医管)处(局),新疆生产建设兵团卫生局医政处: 为进一步提高临床实验室开展药物代谢酶和药物靶点基因检测技术,以及肿瘤个体化用药基因检测技术的规范化水平,国家卫生计生委个体化医学检测技术专家委员会,在广泛征求意见的基础上,制订了《药物代谢酶和药物作用靶点基因检测技术指南(试行)》和《肿瘤个体化治疗检测技术指南(试行)》。附件:1.药物代谢酶和
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艾滋病研究突破:唤醒潜伏的HIV
生物通报道:高效的抗逆转录病毒疗法(HAART)已经帮助数以百万计抵御人类免疫缺陷病毒(HIV)。不幸的是,艾滋病病毒具有一种内在的生存机制,可产生潜伏的、灭活的病毒库,其对HAART和免疫系统来说都是不可见的。但是现在,加州大学戴维斯分校(UC Davis)的研究人员已经鉴定出一种化合物,可激活潜伏的HIV,从而提供一种诱人的可能性:病毒可以被从沉默的病毒库驱逐出去,并完全治愈。更理想的情况是,这种化合物(PEP005)已经通过FDA批准。相关研究结果发表在最近的国际著名学术期刊《PLOS Pathogens》。延伸阅读:华裔科学家《PNAS》艾滋病研究新突破。本文主要作者、医学微生物学与免
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Cell: 亨廷顿氏舞蹈病研究新突破
生物通报道 研究人员采取一种新方法来调查影响亨廷顿氏病(HD)症状出现的因素,鉴别出了两个基因组位点存在可以加速或延缓症状出现的变异。在发表于7月30日《细胞》(Cell)杂志上的研究报告中这一多机构研究小组描述,他们通过全基因组关联分析来自4000多名亨廷顿氏病患者的样本发现了存在于两条染色体上的一些特殊变异,这些变异在比本来预期要更早或更晚的时间首次显示出亨廷顿氏病相关运动障碍的个体中更为常见(延伸阅读:Neuron:亨廷顿病研究取得进展 )。论文的通讯作者、麻省总医院(MGH)人类遗传研究中心主任James Gusella博士说:“以往大多数研究在探讨延缓亨廷顿氏病症状出现的
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盘点生物技术:收入最多的十大药物
生物通报道:7月Nature Biotechnology杂志盘点了过去一年里生物技术产业发展的方方面面,虽然在这一年里生物技术产业界发生了震荡,但是包括股票市场表现,药物获批,新公司出现等多项数据均表明,生物技术产业依然在蓬勃发展中。同时,这一年也见证了不少并购案,比如罗氏3.5亿美元收购DNA测序公司Genia。十大最赚钱的生物技术药物药物名称公司名称分子类型批准说明2014全球销售额($ millions) USWorldwideHumiraAbbViemAbRA, juvenile RA, Crohn's disease, PA, psori
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各大研究机构生物技术专利最新排名
生物通报道:最新一期(7月)Nature Biotechnology杂志上公布了各大学术机构与研究中心2010年-2014年间获批生物技术专利的最新排名,其中排在第一位的是加州大学系统(即包括加州大学的多个分校),其次是威斯康星校友研究基金会和斯坦福大学。具体列表见下:大学名称专利总数2011-2014年平均数目美国专利总数欧盟专利综述20142014专利第一发明人来自地区 USEU加州大学系统599119.85118816533威斯康星校友研究基金会29959.826732673斯坦福大学29358.6255388316德州大学系统2855724
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纳米生物技术可帮助快速诊断白血病 为挽救患者生命争取时间
新华社里约热内卢7月27日电 (记者刘隆)据巴西媒体报道,巴西科研人员最近利用纳米生物复合材料研制出一种新型电子设备,可以像测血糖一样快速诊断白血病,为挽救患者生命争取时间。据介绍,这种新设备可在一个小时之内检测出患者是否携带癌细胞,而现行的诊断方法最长要三个星期才能有结果。鉴于某些白血病的癌细胞扩展速度极快,快速确诊有着重要意义。巴西圣保罗大学等机构的研究人员报告说,他们将纳米金粒子与一种称为菠萝蜜凝集素的物质结合,并加入荧光染料,制成纳米生物复合材料传感器,以此为基础研制出新的检测设备。菠萝蜜凝集素是一种从菠萝蜜中提取的蛋白质,能够识别人体癌细胞里大量存在的特定糖类物质,进而确认癌细胞的存