• 癌症的“长读”:一个新的，更广泛的基因组观点

  研究人员试图通过基因组测序更深入地了解DNA突变和癌症之间的关系，利用长读方法获得更全面的基因组视图。新的EMBL研究表明，长读基因组测序似乎比短读基因组测序更好地检测一些DNA突变。利用牛津纳米孔长读测序技术，科学家们对一种被称为成神经管细胞瘤的儿童原发性脑肿瘤进行了测序，发现了一种新的突变模式。EMBL的生物信息学家、基因组生物学家和来自德国癌症研究中心(DKFZ)的临床医生之间的合作，使他们能够设计出识别和描述数据中的DNA突变和表观遗传模式的方法。就像在黑暗的道路上，手电筒比最亮的蜡烛照亮的区域更广一样，与短读测序相比，长读基因组测序提供了更清晰、更广泛的DNA突变基因组图谱。最近发表

  来源：Cell Genomics

  时间：2023-04-13

• 挑战“植物分枝起源”

  在传统的植物学教材和植物形态学文献中，茎的分枝方式被区分为二叉分枝、单轴分枝、合轴分枝、假二叉分枝以及禾本科的分蘖。另外，也有一些非典型分枝方式，例如茄科植物的二歧分枝。二叉分枝这是比较原始的分枝方式，分枝时顶端分生组织平分为两半，每半各形成一小枝，并且在一定时候又进行同样的分枝，因此这种分枝统称二叉分枝。苔藓植物和蕨类这类低等植物具这种分枝方式。有些同学可能会问：低等植物多为叶状体，无茎与叶的分化，无茎植物为什么也有分枝概念呢？这要从维管植物的定义和分类说起，凡是有维管系统（vascularsystem）的植物都称维管植物，包括极少部分苔藓植物、蕨类植物（松叶兰类、石松类、木贼类、真蕨类）、

  来源：Development

  时间：2023-04-13

• 对抗乳腺癌耐药的一个意外发现：n-乙酰半胱氨酸有助于恢复癌细胞对药物敏感性

  许多癌症疗法并没有产生预期的效果。一个常见的原因是肿瘤对药物产生了耐药性。例如，Alpelisib是一种过去几年在瑞士被批准用于治疗晚期乳腺癌的药物——晚期和转移性乳腺癌患者通常缺乏有效的治疗方案，由于突变促进肿瘤发展，PI3K信号通路在乳腺癌中经常过度活跃，而Alpelisib是PI3K抑制剂。“不幸的是，这种药物的成功严重受到耐药性的限制。”“因此，我们迫切需要更多地了解耐药性是如何产生的。”巴塞尔大学生物医学系的一个研究小组现在发现，神经纤维蛋白1 (NF1)基因的缺失导致对alpelisib的反应降低。研究人员还发现，膳食补充剂n -乙酰半胱氨酸可以恢复癌细胞对这种治疗的敏感性。该研究

  来源：AAAS

  时间：2023-04-13

• MAPLE:用于大规模基因组数据的系统发育工具

                 用于大流行尺度基因组数据的系统发育工具。图源:Karen Arnott/EMBL-EBI随着生命科学实验产生的大量基因组数据，处理大型数据集仍然是生物信息学领域的一个挑战。在COVID-19大流行期间，现有生物信息学工具的有限功能意味着无法一次性分析大量数据，限制了进化和流行病学分析的范围。为了解决这一问题，EMBL欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)的研究人员领导的团队开发了一种新的生物信息学工具，可以处理大规模的基因组数据集，使科学家能够一次性分析数百万个病毒基因组。这项研究

  来源：Nature Genetics

  时间：2023-04-13

• 革命性的模块化类器官，更好地再现器官发育

  日本理化学研究所（RIKEN）Masaya Hagiwara领导的团队近日开发出一种巧妙的设备，利用立方体结构中的水凝胶层，研究人员无需复杂的技术就能构建复杂的3D类器官。这项成果于3月下旬发表在《Communications Biology》杂志上。研究团队还展示了使用这种设备构建类器官的能力，这些类器官忠实地再现了生物实际发育的特征——不对称基因表达。这种设备有望彻底改变我们测试药物的方式，也可以帮助人们了解组织如何发育，从而培育出更好的人造器官。长期以来，科学家们一直在努力培育类器官（也就是在实验室中生长的类似器官的组织），以复制真正的生物发育。类器官的培育对于药物开发非常重要，因为有必

  来源：AAAS

  时间：2023-04-13

• 血液中的糖分子可以预测老年痴呆症

  阿尔茨海默病的早期诊断和治疗需要可靠和具有成本效益的筛查方法。卡罗林斯卡学院的研究人员现在发现，血液中的一种糖分子与tau蛋白的水平有关，tau蛋白在严重痴呆症的发展中起着关键作用。这项发表在《Alzheimer's & Dementia》杂志上的研究，可以为一种简单的筛查程序铺平道路，这种程序可以提前十年预测发病。在阿尔茨海默病中，大脑的神经元死亡，这被认为是β淀粉样蛋白和tau蛋白异常积累的结果。阿尔茨海默氏症药物的临床试验表明，治疗应该在病理过程的早期开始，在太多神经元死亡之前，在太晚之前逆转这一过程。对阿尔茨海默氏症的非侵入性筛查方法既有实际需求，也有经济需求。血液中的

  来源：Alzheimer's & Dementia

  时间：2023-04-13

• 为什么有的人很能吃？水母和果蝇揭示了饥饿调节的起源

  几十年的研究表明，进食的动机，即饥饿感和饱腹感，是由激素和称为神经肽的小蛋白质控制的。它们存在于人类、小鼠和果蝇等广泛的生物体内。如此广泛的现象表明有一个共同的进化起源。为了探索这一现象，一个研究小组转向了水母和果蝇，发现了一些令人惊讶的结果。尽管水母至少在6亿年前与哺乳动物有共同的祖先，但它们的身体更简单;它们拥有被称为神经网络的弥散神经系统，不像哺乳动物有更具体的结构，如大脑或神经节。尽管如此，水母拥有丰富的行为储备，包括精心设计的觅食策略、交配仪式、睡眠甚至学习。尽管它们在生命之树中占有重要的地位，但这些迷人的生物仍然没有得到充分的研究，关于它们如何控制食物摄入量，我们几乎一无所知。该小

  来源：PNAS

  时间：2023-04-13

• 丁思远教授：通过利用轮状病毒来制造针对诺如病毒的疫苗

          肠道细胞(蓝色部分的细胞核)感染了一种轮状病毒，这种轮状病毒经过基因改造，携带了来自诺如病毒(绿色部分)的基因。华盛顿大学医学院的研究人员发现了一种创造性的方法，通过利用轮状病毒来制造针对诺如病毒的疫苗。诺如病毒是食源性感染的主要原因，轮状病毒是一种与诺如病毒无关的病毒，目前已经有几种高效疫苗。图源:Takahiro Kawagishi/华盛顿大学每年，诺如病毒导致数亿例食物中毒，至少5万名儿童死亡，但目前还没有真正的方法来控制它。事实证明，在实验室研究这种病毒异常困难，科学家们一直在努力开发有效的疫苗和药物。华盛顿大学医学院的一项

  来源：AAAS

  时间：2023-04-13

• PNAS：基因组中的偷渡者

          图片:科学家分析了几十亿字节的微生物DNA序列。图源:Fabian Oswald科学家们通过使用高性能计算机集群“Leo”和复杂的探测工作，发现了3万多种病毒。病毒隐藏在单细胞生物的DNA中。在某些情况下，高达10%的微生物DNA由内置病毒组成。在对复杂单细胞微生物的大规模研究中，因斯布鲁克大学生态系的克里斯托弗·贝拉斯博士、玛丽-索菲·普拉科尔布和鲁本·索马鲁加教授有了一个意想不到的发现。在微生物的基因组中，他们发现了超过3万种以前未知的病毒的DNA。这种“隐藏的”DNA可能允许在宿主细胞中复制完整的功能病毒。贝拉斯说:“通过这种

  来源：AAAS

  时间：2023-04-13

• 植物控氮，育种新位点

          解释植物利用氮肥的工作机制的图表深入了解调节植物根系氮利用的基因和蛋白质控制系统，有助于开发需要较少氮肥以获得可接受产量的作物。日本东北大学的植物生物化学家Soichi Kojima和他的同事在《Frontiers in Plant Science》杂志上发表了一篇文章，讨论了他们的发现和未来的计划。氮对植物来说是一种至关重要的营养物质，因此世界各地的农田上都撒有大量的含氮肥料。这些肥料主要以铵离子(NH4 +)的形式含有氮，这种化学形式的氮最容易被植物根部吸收。然而，土壤和流入湖泊和河流的排水中过量的氮会导致严重的生态失衡，包括藻

  来源：Frontiers in Plant Science

  时间：2023-04-13

• 探索肌肉萎缩的原因：TWEAK/Fn14？

          图片：Ashok Kumar教授，休斯敦大学药学院药理学和药学系主任，正在研究肌肉萎缩，希望开发一种药物预防肌肉萎缩。资料来源:休斯顿大学在衰老过程中和晚期癌症患者中，骨骼肌萎缩是一种破坏性的，通常不可逆的症状。当蛋白质的降解速度快于新蛋白质的形成速度时，肌肉质量就会减少。休斯顿大学的一名研究人员Ashok Kumar认为，肌肉萎缩实际上可能是由一种叫做TWEAK的促炎蛋白或细胞因子与其受体Fn14基因之间的关系引起的。一旦结合在一起，它们就会激活多种细胞内信号通路。Kumar之前发现，TWEAK在体内和体外都能抑制骨骼肌中蛋白质合

  来源：AAAS

  时间：2023-04-13

• 艾滋病毒基因组的新发现——消除感染新靶点

  为了寻求有可能彻底消除艾滋病毒感染的治疗方法，科学家们一直在寻找病毒可以隐藏其遗传物质的所有位置。在最近的一项研究中，来自约翰霍普金斯大学医学院的一组科学家使用了接受长期抑制治疗的艾滋病毒感染者的血液样本，并发现了新的证据，表明艾滋病毒基因组可以持续存在于循环白细胞(称为单核细胞)的稳定储存库中。科学家们表示，这一发现可能为改善治疗并最终治愈艾滋病毒提供了新的方向。根据世界卫生组织的数据，艾滋病影响着全球3400多万人。目前的抗逆转录病毒药物可以成功地将艾滋病毒抑制到几乎无法检测到的水平，但并没有导致完全根除该病毒。单核细胞是一种寿命较短的循环免疫细胞，最终发育为巨噬细胞。巨噬细胞是免疫细胞，

  来源：Nature Microbiology

  时间：2023-04-13

• 不明原因儿童肝炎，或与这种病毒有关

  不明原因儿童严重急性肝炎，顾名思义，其病因和发病机制一直未明且在研究中。现在3项独立研究指出，2022年以来的不明原因儿童肝炎病例增加，与Ⅱ型腺相关病毒（AAV2）这种常见的儿童病毒有关。但遗憾的是，目前依然不能确定AAV2究竟为肝炎的致病原因，抑或仅仅是对另一种病毒感染的提示。“元凶”隐匿的神秘病症去年至今，英美等35个国家一共报告了1000多例不明原因小儿肝炎。部分病例很重，需开展肝脏移植；其中少数病例有生命危险。去年4月以来，欧洲疾病预防控制中心和世界卫生组织（WHO）官方网站多次公布此病相关信息。WHO也发布了诊断建议，但由于“元凶”的隐匿，对治疗方案并无推荐意见。此前开展的分析发现，

  来源：中国科技网

  时间：2023-04-13

• 限时禁食会导致生育问题

  根据东安格利亚大学的最新研究，有时间限制的禁食饮食可能会导致生育问题。今天发表的一项新研究表明，有时间限制的禁食对雄性和雌性斑马鱼的繁殖影响不同。重要的是，在鱼恢复正常进食水平后，可以看到对卵子和精子质量的一些负面影响。研究小组表示，虽然这项研究是在鱼类中进行的，但他们的发现强调了考虑禁食对体重和健康影响的重要性，还有对生育能力的影响。东英吉利大学生物科学学院的阿列克谢·马克拉科夫教授说:“限时禁食是一种饮食模式，人们将食物摄入限制在一天中的特定时间。这是一种流行的健康和健身趋势，人们这样做是为了减肥和改善健康。“但生物体对食物短缺的反应方式会影响卵子和精子的质量，这种影响可能在禁食期结束后继

  来源：AAAS

  时间：2023-04-13

• 解开睡眠之谜：一种肠道分泌的肽抑制睡眠唤醒能力

  摘要：Dragana Rogulja正在用果蝇和老鼠来探索有关睡眠的诱人问题。她的研究深入探究了为什么睡眠对生存是必要的，以及睡眠中的大脑是如何与世界脱节的。Rogulja的研究已经确定了大脑和肠道之间的关键联系。如果转化为人类，她的研究结果可能会为改善睡眠和减少睡眠剥夺造成的损害提供新的方法。睡眠是人类最重要的活动之一——事实上，如果我们一个晚上没有得到足够的睡眠，我们可能会难以思考、反应，或者以其他方式度过一天。然而，尽管睡眠对功能和生存很重要，科学家们仍然没有完全理解睡眠是如何工作的。神经生物学家Dragana Rogulja正在探索睡眠的基本生物学。作为一个自称是科学的后来者，Rogu

  来源：AAAS

  时间：2023-04-13

• Nature子刊：SKD3酶的突变如何导致MGCA7疾病

  贝勒医学院及其合作机构的研究人员在《自然通讯》杂志上报告了SKD3酶的突变如何导致一种被称为3-甲基谷氨酸酸尿症(MGCA7)的遗传疾病。MGCA7是一种先天性代谢错误，与可变的神经缺陷和血液中称为中性粒细胞的免疫细胞数量异常低有关。后一种情况被称为中性粒细胞减少症，可导致对感染的易感性增加，也可发展为白血病，以及婴儿过早死亡。SKD3对动物细胞中的蛋白质质量控制至关重要。贝勒大学生物化学和分子生物学、分子和细胞生物学、分子病毒学和微生物学教授弗朗西斯·蔡博士说:“它可以去除细胞内称为线粒体的结构或细胞器中受损的蛋白质，从而保持这些细胞器的完整性，这对正常细胞功能至关重要。”“例如，蛋白质质量

  来源：AAAS

  时间：2023-04-13

• 以前被忽视的酶是如何帮助调节溶酶体和细胞功能的

          图片:Atsuo Sasaki博士在他的实验室工作。曾经被认为在细胞内只有一项简单的工作，研究人员继续了解被称为溶酶体的细胞器的重要性。细胞器是细胞中被膜包围的小结构，具有特定的功能。溶酶体有助于许多细胞功能，包括在自噬过程中帮助将物质分解成更有用的能量来源，类似于肠道在整个身体层面上将食物分解成可用的营养物质。这一过程有助于细胞再生和更新，而且还发现了溶酶体途径来保护细胞免受病原体和病毒的侵害。但当溶酶体不能正常工作时，就会导致神经退行性疾病，如阿尔茨海默病、帕金森病和癌症。由辛辛那提大学的Atsuo Sasaki博士领导的一个研

  来源：AAAS

  时间：2023-04-13

• 宝宝的肠道里爬满了未知的病毒

  婴儿的肠道里有超过200个以前不为人知的病毒家族。这个庞大的数字让哥本哈根大学和COPSAC的研究人员感到惊讶，他们仔细研究了647名丹麦婴儿的尿布，并绘制了第一张此类地图。这些病毒很可能在保护儿童远离慢性疾病方面发挥重要作用。病毒通常与疾病有关。但我们的身体充满了细菌和病毒，它们在我们的胃肠道中不断增殖并相互作用。虽然几十年来我们已经知道，幼儿体内的肠道细菌对于保护他们在以后的生活中免受慢性疾病的影响至关重要，但我们对其中发现的许多病毒的了解却很少。几年前，这让哥本哈根大学教授Dennis Sandris Nielsen萌生了深入研究这个问题的想法。因此，来自COPSAC(哥本哈根儿童哮喘前

  来源：Nature Microbiology

  时间：2023-04-12

• 新发现两类与治疗有关的调节性T细胞

  费城儿童医院(CHOP)研究人员的一项研究发现，一类人类调节性T细胞来自两个不同的来源，一个与自身免疫有关，另一个与保护性免疫有关。他们认为，这一发现可能为选择性靶向免疫系统T滤泡调节细胞(Tfr)的这些不同亚群的自身免疫性疾病的新治疗铺平道路。“当涉及到自身免疫时，普遍的观点是，阻止炎症的唯一方法是广泛地抑制免疫系统，使患者更容易感染，”CHOP过敏和免疫部门的主治医生Neil D. Romberg医学博士说。“然而，只有当所有T细胞都来自同一个地方时，这才成立。这项研究表明，有两种不同的T细胞谱系，这意味着你可能可以鱼与熊掌兼得，因为自身免疫抑制炎症，同时让对抗感染的T细胞茁壮成长。”Ro

  来源：Science Immunology

  时间：2023-04-12

• 抵消高脂肪饮食影响，仅需拨动SAPS3开关

  加州大学欧文分校的生物学家发现，通过消除AMPK蛋白复合体的SAPS3成分，小鼠即使在食用高脂肪饮食时也能保持正常的能量平衡。这一发现发表在《Nature Communications》杂志上，揭示了开发抑制SAPS3的分子以帮助恢复代谢平衡并对抗肥胖、糖尿病和脂肪肝等代谢疾病的潜力。随着代谢相关疾病在全球范围内的持续增加，这项研究可能会导致一种治疗这些疾病的新方法。生物学家发现去除蛋白质抑制剂可以恢复代谢平衡。               &n

  来源：Nature Communications

  时间：2023-04-12

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