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尿液和血液中的某些物质可以预测肾脏疾病的进展
在一项针对急性肾损伤(AKI)住院患者的长期影响的新研究中，约翰霍普金斯大学医学研究人员发现，尿液和血液中某些生物标志物的较高水平可以预测患者患慢性肾脏疾病(CKD)的风险。这项研究结果发表在3月23日的《临床研究杂志》上，可以帮助医生更好地了解肾脏损伤后身体是否正在正常愈合，并有可能防止AKI向CKD的发展。肾脏是一对豆状器官，有助于清洁血液和清除体内废物。当你的肾脏停止正常工作时，就会发生AKI，这可能会导致废物在血液中堆积，使身体难以平衡液体。虽然AKI可以治疗，但它可能导致CKD，一种更严重的潜在致命疾病，以及其他心脏问题。AKI最常见于肾脏受到医疗和手术压力及并发症影响的住院患者，这
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癌症长期幸存者粪便宏基因组分析：微生物组如何影响胰腺癌？
图片来源:医学博士Jordan Kharofa图片来源:辛辛那提大学尽管胰腺癌的治疗方法有所改善，但只有9%的患者能活过5年。研究人员一直未能成功地寻找基因差异，以解释为什么有些患者长期存活，有些则不能，现在他们已将研究重点转移到肠道微生物组上。微生物组是一个术语，用于微生物的集合，包括生活在人体上或体内的微生物，如细菌。医学博士Jordan Kharofa说，人们对胰腺癌长期幸存者的微生物群知之甚少。辛辛那提大学癌症中心医师研究员、加州大学医学院放射肿瘤系副教授Kharofa说:“有新兴科学表明，胰腺癌幸存者在他们的肿瘤中有强大的
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Wt1基因可能是内皮细胞在冠状动脉新血管形成过程中的关键因素
图片:从左到右分别是来自巴塞罗那大学生物学院和IBUB的专家Ofelia Martínez Estrada和Marina Ramiro Pareta。资料来源:巴塞罗那大学哺乳动物的心脏是如何形成的?内皮细胞起什么作用?参与胚胎心脏形成的相同途径和基因是否也在修复过程中发挥作用?UB生物学院和生物医学研究所(IBUB)的一个团队进行的一项新研究表明，在冠状血管形成的早期阶段，内皮细胞中Wt1基因的缺失会影响心脏在胚胎阶段的正确发育。这项研究发表在《发展》杂志的研究亮点部分，由生物学院细胞生物学、免疫学和生理学系的Ofelia教授Ma
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Nature Genetics：癌细胞中的跳跃基因为新的免疫疗法打开了大门
跳跃基因是DNA的一小部分，在漫长的进化过程中被随机纳入人类基因组。这些DNA片段也被称为转座因子，与癌症的发生有关。但圣路易斯华盛顿大学医学院的一项新研究表明，各种癌症中的转座因子可能被用于指导新型免疫疗法，以治疗通常对免疫疗法没有反应的肿瘤。这项研究发表在《自然遗传学》杂志的网络版上。免疫疗法通常对具有大量突变的肿瘤最有效，如皮肤癌和肺癌。DNA突变导致癌细胞产生不寻常的蛋白质，这些蛋白质将肿瘤细胞与正常细胞区分开，并作为免疫疗法的靶点——称为肿瘤抗原——如抗体、疫苗和基因工程CAR-T细胞疗法。但许多肿瘤类型并不含有大量突变，因此免疫系统更难将其识别为威胁。Ting Wang博士说，“免
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Nature子刊：细菌也有“饿怒症”
你是否曾经因为太饿而变得愤怒，或者被称为“饿怒症”?微生物学和免疫学系助理教授Adam Rosenthal博士的新研究发现，一些细菌细胞也会饿怒，向我们的身体释放有害毒素，让我们生病。Rosenthal和他来自哈佛大学、普林斯顿大学和丹尼斯科动物营养学院的同事们使用最近开发的技术发现，细菌群落中基因相同的细胞具有不同的功能，一些成员表现得更温顺，而另一些成员产生的毒素正是让我们感到不适的毒素。Rosenthal说:“细菌的行为与我们传统上认为的大不相同。即使我们研究一个基因完全相同的细菌群落，它们的行为也不尽相同。我们想找出原因。”发表在《Nature Microbiology》杂志上的这一发
来源：Nature Microbiology
时间：2023-04-04
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听！植物发出的声音！原来我们周围的世界充满了植物的声音！
受到压力的植物会表现出表型的改变，包括颜色、气味和形状的变化，已有研究表明植物能产生视觉、化学和触觉信号，而其他生物也能对这些信号做出反应。然而，植物是否能发出空气传播的声音——能被其他生物听到的声音——还不甚了解。特拉维夫大学的研究人员的一项新研究展示了受到压力的植物会发出空气中的声音，这些声音可以从远处记录下来并分类。他们在一个声室和温室中记录了番茄和烟草植物发出的超声波，同时监测了植物的生理参数，并开发了机器学习模型，仅根据发出的声音就成功地识别了植物的状况，包括脱水程度和伤害。这些有信息的声音也可能被其他生物探测到。这项工作为了解植物及其与环境的相互作用开辟了途径，并可能对农业产生重大
来源：Tel-Aviv University
时间：2023-04-04
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Molecular Cell令人惊讶的发现：导致抗生素耐药性的第一步
抗生素耐药性是一个全球性的健康威胁。仅在2019年，全球估计就有130万人死于耐抗生素细菌感染。为了解决这一日益严重的问题，贝勒医学院的研究人员一直在分子水平上研究导致抗生素耐药性的过程。他们在《分子细胞》杂志上报告了促进对环丙沙星(或简称环丙沙星)耐药的关键而令人惊讶的第一步，环丙沙星是最常用的抗生素之一。这些发现指出了潜在的策略，可以防止细菌产生耐药性，扩大新旧抗生素的有效性。文章通讯作者Susan M. Rosenberg说，“在我们实验室以前的工作表明,当细菌暴露在一个充满压力的环境,如环丙沙星的存在，它们会启动一系列反应，试图在抗生素的毒性作用下生存下来。 我们发现环丙沙星
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Nature子刊：细菌遗产“SIG5”帮助植物免受低温伤害
在明亮寒冷的早晨，你可以蜷缩在羽绒被下，也可以跳起来抓住这一天。然而，对于进行光合作用的植物来说，这样的黎明意味着危险，所以它们进化出了自己的方式，让寒冷的早晨变得可以忍受。约翰·英纳斯中心(John Innes Centre)领导的研究发现了一种受植物生物钟控制的寒冷“应对”机制，可以为不适应寒冷气候的作物培育更强的适应力提供解决方案。“我们已经确定了一种帮助植物耐受寒冷的新过程。这是由植物的生物钟控制的，我们认为这在寒冷明亮的早晨尤其重要，”约翰·英尼斯中心的小组负责人Antony Dodd教授说。“像冬小麦和冬油菜这样的作物在种植期间会经历低温。我们认为，我们发现的机制可以为光合作用提供
来源：John Innes Centre
时间：2023-04-04
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Nature Biotech：MIT学者首次将mRNA高效递送至肺部
麻省理工学院和马萨诸塞大学医学院的工程师近日设计出一种新型的纳米颗粒，它可以被吸入肺部，从而递送编码特定蛋白质的mRNA。这项研究成果于3月30日发表在《Nature Biotechnology》杂志上，有望为囊性纤维化及其他肺部疾病的治疗提供一种吸入式疗法。共同通讯作者、麻省理工学院的化学工程系教授Daniel Anderson指出：“我们首次展示了将RNA高效递送至小鼠肺部。我们希望用它来治疗或修复一系列遗传疾病，包括囊性纤维化。”以肺部为目标在治疗因缺陷基因引起的各种疾病上，mRNA拥有巨大的潜力。到目前为止，人们面临的一个主要障碍是难以将其递送到正确的身体部位。注射的纳米颗粒通常会积累
来源：Massachusetts Institute of Technology
时间：2023-04-04
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新形式的DHA可预防与阿尔茨海默病相关的视力衰退
研究人员首次开发出一种新形式的DHA（二十二碳六烯酸）不饱和脂肪酸，它能够进入眼睛的视网膜，以抵御与阿尔茨海默病、糖尿病和其他疾病相关的视力衰退。鱼油胶囊等补充剂中含有DHA，但这种DHA大多以甘油三酯（TAG）DHA的形式存在。虽然TAG-DHA对身体的多个部位有好处，但它不能到达眼睛，因为无法从血液进入视网膜。在这项研究中，研究人员开发出一种新的溶血磷脂形式的DHA，也就是LPC-DHA。在基于小鼠的研究中，LPC-DHA成功增加了视网膜中的DHA，并减少了与阿尔茨海默病相关的眼部问题。伊利诺伊大学芝加哥分校医学系研究助理教授Sugasini Dhavamani表示：“ LPC-DHA在丰
来源：American Society for Biochemistry and Molecular Biology
时间：2023-04-04
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德国科学家抗议博士后“新规”
近日，数百名研究人员聚集在柏林的德国联邦教育和研究部前，要求改善学术界的工作条件。这场抗议活动是一项备受争议的法律的最新爆发点。该法律要求博士后在完成博士学位后，最多只能以定期合同的形式工作6年。“这是我们组织过的最大规模的抗议活动。”“学术界体面劳动网络”成员、抗议活动联合组织者Sandra Janssen说。据《自然》报道，除了呼吁废除上述《学术界固定期限雇佣合同法》外，研究人员还呼吁为博士后引入永久合同，并废除以论文为基础的教授资格要求。和许多国家一样，在德国，博士后在有限的教职岗位上面临着激烈竞争。但那些在6年期限内无法获得永久工作的人可能会被迫离开学术界或这个国家。柏林莱布尼茨淡水生
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iScience：极其罕见的基因变异指出了老年性黄斑变性的潜在原因
图片:补体膜攻击复合体是一个插入细胞膜的孔。复合物由多达18个C9亚基(紫色)、C5、C6和C7亚基(各种深浅的绿色)以及c8 - α、c8 - β和c8 - γ亚基(深浅的红色)组成。侧面(左)和顶部(中)视图显示了该综合体的分流垫圈配置。C8亚基将C9环与复合物的剩余部分结合。在精氨酸444位点的c8 - α和在残基天冬氨酸382位点的c8 - β的超罕见突变(右，黄色所示)似乎可以稳定或破坏膜攻击复合体。膜攻击复合体稳定性的改变可能导致视网膜的慢性炎症。图片来源:美国国家眼科研究所美国国家眼科研究所(NEI)的一项研究发现了罕
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二甲双胍和亮氨酸可防止细胞衰老和破坏蛋白质平衡
SD期间MET+LEU对肌肉细胞影响的概要示意图。小剂量二甲双胍和亮氨酸鸡尾酒可预防肌管萎缩引起的细胞衰老和蛋白质平衡紊乱。一篇新的研究论文发表在《Aging》杂志封面(由MEDLINE/PubMed列为“Aging (Albany NY)”和Web of Science的“Aging- us”)第15卷第6期，题为“低剂量二甲双胍和leucine鸡尾酒预防肌管萎缩引起的细胞衰老和破坏的蛋白质平衡”。衰老与骨骼肌中产生炎症产物的衰老细胞的积累相一致，被称为衰老相关的分泌表型，但衰老细胞与肌肉萎缩的关系尚不清楚。此前，研究人员发现二甲
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Nature子刊鉴定隐藏在其他白细胞中的HIV基因组
长期以来，科学家们一直在寻找艾滋病毒隐藏其遗传密码的所有地方，以开发出有朝一日可能完全消除人体艾滋病毒感染的治疗方法。现在，在一项使用长期抑制治疗的男性和女性艾滋病毒感染者血液样本的研究中，由约翰霍普金斯大学医学院的科学家领导的团队报告了新的证据，即在循环白细胞中发现了一种稳定的艾滋病毒基因组库，这种白细胞被称为单核细胞。单核细胞是短命循环免疫细胞，是巨噬细胞的前体，巨噬细胞是免疫细胞，能够吞噬并摧毁病毒、细菌和宿主外来的其他细胞。在3月27日发表在《自然微生物学》(Nature Microbiology)杂志上的最新研究中，科学家们发现证据表明，接受长期标准抗逆转录病毒治疗的艾滋病毒感染者的
来源：Nature Microbiology
时间：2023-04-03
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长达20年的研究颠覆长期以来关于染色体和癌症的理论
端粒短和鳞状癌之间的联系。资料来源:Jennifer Fairman约翰霍普金斯大学医学院的科学家们说，他们对200多名因端粒异常短(或染色体末端重复DNA序列缩短)引起的早衰综合征患者进行了20年的研究，可能会颠覆长期以来的科学教条，并解决有关端粒短如何以及是否会导致癌症风险的相互矛盾的研究。这项研究有可能指导短端粒综合征患者的治疗和癌症筛查，发表在4月10日的《癌症细胞》杂志上。几十年来，对动物模型和细胞的一些研究已经将极短端粒的存在与染色体的不稳定性联系起来，染色体是容纳基因的x型结构。这种不稳定性是癌细胞的共同特征。这项新的
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Science：相比主流工具，人工智能将更好的预测酶功能
一种新的人工智能工具可以根据酶的氨基酸序列预测酶的功能，即使这些酶尚未被研究或了解甚少。研究人员表示，这款名为CLEAN的人工智能工具在准确性、可靠性和灵敏度方面超过了最先进的工具。更好地理解酶及其功能将有利于基因组学、化学、工业材料、医学、制药等领域的研究。“就像ChatGPT使用书面语言的数据来创建预测文本一样，我们正在利用蛋白质的语言来预测它们的活动，”研究负责人Huimin Zhao说，他是伊利诺伊大学香槟分校的化学和生物分子工程教授。“几乎每个研究人员在研究一个新的蛋白质序列时，都想马上知道蛋白质的功能。此外，在为生物学、医学、工业等任何应用制造化学品时，该工具将帮助研究人员快速确定
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Nature Genetics：翻译“跳跃基因”创造癌症治疗靶点
新的研究表明，转座因子——或所谓的“跳跃基因”——可以帮助科学家识别肿瘤靶向蛋白。3月27日发表在《Nature Genetics》杂志上的这项研究表明，在癌症过程中，转座因子进入基因，然后可以转化为肿瘤特异性抗原，这是肿瘤表面的蛋白质，标志着细胞的免疫破坏。该研究的作者表示，这些发现可能有助于研究人员设计出对患有特定癌症类型的患者更普遍的癌症治疗方法，而不是目前的治疗方法。转座元件(TEs)是短而重复的序列，可以将自己复制到基因组的其他区域。正常情况下，TEs在表观遗传上是沉默的。但是当一个细胞癌变时，它们可以开始跳到基因组的不同区域。根据这项研究，许多肿瘤特异性抗原源于转座元件插入到基因的
来源：Nature Genetics
时间：2023-04-03
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ZBTB12是阻止人类多能干细胞分化的分子屏障
细胞分化的过程，其中人类多能干细胞(hPCSs)从原始发展到先进的状态，是生命的一个基本方面。理解这一过程不仅有助于理解生命的基本原理，而且为各种疾病的治疗方法的发展带来了巨大的希望。最近，浦项理工大学和加州大学圣巴巴拉分校(UCSB)的研究人员发现了这种核心分化机制。由Jiwon Jang教授和Yujeong Oh领导的浦项科技大学团队与UCSB研究团队合作绘制了转录起始位点，并发现了ZBTB12，一种含有BTB (BR-C, ttk和bab)结构域的锌指蛋白。研究人员发现ZBTB12作为一种分子屏障来阻止hPSCs的去分化。他们
来源：Nature Communications
时间：2023-04-03
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Cell发布新资源，有助于了解基因变异的功能影响
了解基因变异如何影响分子表型是功能基因组学的主要目标之一。一个由近百名科学家组成的国际团队近日以四名欧洲裔个体为研究对象，确定了基因变异在20多种组织类型中的功能。这些个体之前参与了基因型组织表达（GTEx）项目。耶鲁大学的Mark Gerstein及其同事利用PacBio的长读长序列、Oxford Nanopore的长读长序列、10x Genomics的分析数据及Illumina的短读长序列生成了代表母系和父系单倍型的基因组序列。之后再结合约30种组织的功能基因组学分析结果对序列数据进行分析。研究团队于3月30日在《Cell》杂志上发表了由此产生的EN-TEx数据集。与相应的统计和深度学习模
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也许我们对中性粒细胞有误解？它们其实也是抗癌斗士
威尔康奈尔医学院领导的团队近日惊人地发现，中性粒细胞在清除实体瘤方面具有不为人知的作用。他们于3月30日在《Cell》杂志上发表了这一成果。研究人员在分析黑色素瘤的T细胞免疫疗法时，发现许多肿瘤细胞即使缺乏T细胞靶向的抗原也能被摧毁。他们注意到，T细胞在攻击肿瘤时，激活了一群中性粒细胞，这反过来又杀死了T细胞无法清除的肿瘤细胞。这一发现也许会带来新的免疫疗法。共同资深作者、威尔康奈尔医学院的药理学教授Taha Merghoub表示：“我们倾向于认为先天免疫细胞充其量是帮助刺激T细胞对肿瘤的初始反应。此外，许多研究表明，中性粒细胞支持肿瘤进展，不过在这项研究中，我们发现它们在消除肿瘤方面发挥了关
来源：Weill Cornell Medicine
时间：2023-04-03
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