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浙江大学Nature子刊聚焦CRISPR–Cas的抑制系统
生物通报道 来自浙江大学生命科学研究院的研究人员揭示出了,噬菌体蛋白AcrF3抑制Cas3的结构基础。他们的研究结果发布在7月25日的《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。浙江大学生命科学研究院的朱永群(Yongqun Zhu)教授及其课题组的周艳(Yan Zhou)博士是这篇论文的共同通讯作者。朱永群教授实验室的主要研究方向是肠道细菌与宿主免疫相互作用分子机制以及结构基础。相关的研究成果以通讯作者/共同通讯作者发表在Cell、Nature Structural & Molecular Biol
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同济大学刘琦教授Cell子刊探讨CRISPR的in-silico sgRNA设计
CRISPR/Cas9系统是目前进行基因编辑的有效技术。实现CRISPR/Cas9系统的核心问题之一是进行高效以及特异性的sgRNA设计。近日,同济大学生命科学与技术学院刘琦教授课题组受邀在Cell子刊,Trends系列著名杂志《Trends in Biotechnology》(影响因子:12)发表论文,系统探讨了CRISPR基因编辑系统中的in-silico sgRNA设计问题。刘琦教授课题组以数据挖掘和机器学习计算技术为基础,重点关注于生物医药大数据挖掘领域的交叉问题研究,在基因编辑的小RNA设计以及肿瘤精准医疗,多组学数据分析以及药物基因组学、药物信息学领域进行了一系列的研究工作。这工作
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中科院团队解析新一代CRISPR系统
生物通报道:CRISPR是规律成簇的间隔短回文重复(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)的缩写。CRISPR与内切酶Cas9是一对好基友,细菌依靠它们组成的防御系统对抗外来侵略者。CRISPR-Cas9能够在引导RNA的指引下,靶标并切割入侵者的遗传物质。2012年研究者们利用这一特点,将CRISPR系统发展成了强大的基因组编辑工具。该系统使用简单而且扩展性强,很快便成为了生物学领域最耀眼的明星。2015年人们发现,CRISPR还有一个好朋友——Cpf1。CRISPR-Cpf1也能在crRNA的引导下在人类细胞中剪
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Cell Stem Cell八大热点文章(7月)
生物通报道:《Cell Stem Cell》杂志是2007年Cell出版社新增两名新成员之一(另外一个杂志是Cell Host & Microbe),这一杂志内容涵盖了从最基本的细胞和发育机制到医疗软件临床应用等整个干细胞生物学研究内容。这一杂志特别关注胚胎干细胞、组织特异性和癌症干细胞的最新成果。《Cell Stem Cell》自创刊以来就倍受关注,影响因子迅速提升,从0一冲至16.826,又达到了22.387。其中最受关注的文章包括:Molecular Criteria for Defining the Naive Human Pluripotent State瑞士洛桑联邦理工学院
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Nature:中国率先开展世界首个人类CRISPR临床试验
生物通报道 根据Nature网站的报道,中国科学家将在世界上率先把采用CRISPR–Cas9基因编辑技术改造的细胞注入到人体内。由四川大学华西华西医院的肿瘤学家卢铀(Lu You)领导的一个研究小组,计划在下个月开始在肺癌患者中测试这些细胞。这一临床试验已在7月6日获得了华西医院审查委员会的伦理批准。宾夕法尼亚大学免疫治疗临床研究人员Carl June说:“这是向前迈出的令人兴奋的一步。”索取Life Tech CRISPR产品的详细技术资料请填写联系方式 当前已有一些人类临床试验采用了基因编辑技术帮助患者对抗HIV,其中包括June领导的一项试验。June还是美国一项已计划好的临
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深圳大学Nature子刊CRISPR研究成果
生物通报道:最近,有研究报道CRISPR-Cas9系统能够靶定病毒RNA,因此这种现象提出了一个有趣的问题:Cas9是否也可能影响细胞mRNAs的翻译。7月13日,来自深圳大学第一附属医院的研究人员,在Nature子刊《Scientific Reports》上发表题为“Targeting cellular mRNAs translation by CRISPR-Cas9”的研究成果,对这个问题进行了探讨。点击阅读该研究小组的相关成果:973首席科学家Nature子刊发表CRISPR新文章;深圳大学最新文章:端粒酶基因突变与癌症发生。这项研究的通讯作者是深圳大学第一附属医院中心实验室副研究员黄卫
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刘小乐教授发布CRISPR研究新工具
生物通报道:尽管使用CRISPR/Cas9技术用于基因组编辑和基因敲除的日益普及,其性能仍然依赖于精心设计的单向导RNAs(sgRNA)。7月10日,同济大学、哈佛大学公共卫生学院和浙江大学等处的研究人员,在国际权威杂志《Bioinformatics》发表题为“CRISPR-DO for genome-wide CRISPR design and optimization”的学术成果。同济大学讲座教授、哈佛大学公共卫生学院教授、Dana-Farber肿瘤研究所的刘小乐(Xiaole Shirley Liu)博士、同济大学生命科学与技术学院博士生导师刘琦(Qi Liu)教授和哈佛大学公共卫生学院
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南京农大用CRISPR制备基因敲除兔和山羊
生物通报道:肌生成抑制蛋白(Mstn)是哺乳动物骨骼肌质量的一个保守的负调节因子。然而,在家畜中是否能够实现Mstn的精确敲除,能否被安全地用来提高产肉性能,尚未得到证实。近期,来自南京农业大学、斯坦福大学等处的研究人员,在Nature子刊《Scientific Reports》发表题为“Generation and evaluation of Myostatin knock-out rabbits and goats using CRISPR/Cas9 system”的研究成果,该研究利用CRISPR/Cas9来制备Mstn基因敲除家兔和山羊,然后分析了它们的表型变化,对上述问题进行了探讨。
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遗传学大牛用CRISPR/Cas识别SNPs
生物通报道:随着基因组编辑系统的发展,没有什么比CRISPR/Cas更简单的了。然而,在实践中,将该系统限定于预期的位点可能是具有挑战性的,尤其是两个或两个以上的位点只有一个单碱基差异的情况。哈佛大学Wyss生物启发工程研究所的Benjamin Pruitt指出:“Cas9是杂乱的。在许多情况下,它将高效地切割两个等位基因。”这是生物医学中的一个问题,因为研究人员设想修复受损的基因拷贝,而单独留下野生型基因。现在,Pruitt与哈佛大学医学院著名遗传学家George Church实验室的临床研究员Alejandro Chavez合作,为这个问题设计了一个潜在的解决方案,发表在生命科学预印本网站
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川大等病理学研究刊登国际期刊
生物通报道:7月7日,来自四川大学、美国北达科他大学和南京大学的研究人员,在国际著名病原学期刊《PLOS Pathogens》在线发表了一项研究成果,题为“Annexin A2 Modulates ROS and Impacts Inflammatory Response via IL-17 Signaling in Polymicrobial Sepsis Mice”。美国北达科他大学的华人学者Min Wu和四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室的Yongsheng Wang是本文共同通讯作者。点击阅读四川大学更多研究成果:川大院士发表CRISPR/Cas综述文章;四川大学国际期刊发表CRI
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Nature新型CRISPR样系统研究遭质疑
生物通报道 存在于许多细菌中的CRISPR/Cas防御系统,采用了一种简单而绝妙的方法来编辑宿主基因组,已成为当下一种重要的生物学技术,促成了近期一大批的研究发现(张锋Science文章:靶向RNA的新型CRISPR系统 ,三篇Nature文章:CRISPR研究重大进展 )。索取Life Tech CRISPR载体的详细技术资料,请填写联系方式 今年3月,法国艾克斯-马赛大学的Didier Raoult和同事们在《自然》(Nature)杂志上发表论文, 提出一种巨病毒:巨型拟菌病毒(mimiviruses)具有一种噬病毒体(virophage)抵抗机制——叫做巨型拟菌病毒噬病毒体抵
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同济教授用CRISPR制备瘦素缺陷大鼠
生物通报道:Leptin(LEP)是由脂肪细胞分泌的蛋白质类激素,主要由白色脂肪组织产生。其前体由167个氨基酸残基组成,N末端有21个氨基酸残基信号肽,该前体的信号肽在血液中被切掉而成为146氨基酸,分子量为16KD,形成Leptin。Leptin具有广泛的生物学效应,其中较重要的是作用于下丘脑的代谢调节中枢,发挥抑制食欲,减少能量摄取,增加能量消耗,抑制脂肪合成的作用。6月5日,Nature子刊《Scientific Reports》在线刊登了同济大学、中科院上海生命科学研究院、上海交通大学以及加州大学洛杉矶分校的一项研究成果,题为“The 14th Ile residue is esse
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华南农大Cell子刊发表CRISPR/Cas9新综述
生物通报道 来自华南农业大学的研究人员在7月6日的《Molecular Plant》杂志上,发表了一篇题为“CRISPR/Cas9 Platforms for Genome Editing in Plants: Developments and Applications”的综述文章,探讨了用于植物基因组编辑的CRISPR/Cas9平台其发展与应用。索取Life Tech CRISPR产品的详细技术资料请填写联系方式 这篇论文的通讯作者是华南农业大学生命学院长江特聘教授刘耀光(Yao-Guang Liu)。其主要研究领域为植物基因工程、水稻基因的定位与克隆、水稻分子生物学。2008年
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韩春雨NgAgo基因编辑技术可重复性引质疑
该领域专家认为“不能重复不意味着是假的” 近日,有关NgAgo基因编辑技术首篇论文实验的可重复性受到相关研究者质疑,该论文作者、河北科技大学副教授韩春雨在各类报告上回应这需要“高超的实验技巧”。对此,《中国科学报》记者在采访该领域专家时了解到,所谓“高超的实验技巧”实为实验“标准化”,目前多个实验室的重复实验结果即将出炉。最近一个月,许多研究者在网络平台上声称无法重复韩春雨发表论文中的实验。科学网上,多名博主转发研究者的评论,参与了对此事的关注。截至发稿前,韩春雨本人并未就此事细节向媒体进行回应。不过,据《中国科学报》记者了解,世界范围内有几家实验室正在对NgAgo-gDNA基因编
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Genome Biology:为CRISPR选择最佳向导
生物通报道:细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争,为此它们演化出了多种防御机制,CRISPR-Cas9适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合,可以在引导RNA的指引下,靶标并切割入侵者的遗传物质。2012年研究者们利用这一特点,将CRISPR系统发展成了强大的基因组编辑工具。该系统使用简单而且扩展性强,很快便成为了生物学领域的香饽饽。CRISPR/Cas9基因组编辑的成功取决于向导RNA序列的选择。正因如此,预测向导RNA脱靶和打靶情况的计算工具很受欢迎。不过,人们还不清楚这些算法的准确程度。法国INSERM和美国加州大学的研究人员首次对一些常用算
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7月生命科学界名人名言
本月值得关注的研究点评与名人名言:要做出这些选择其实非常困难,还有许多非常优秀的科学家、政策制定者以及来自学术界的人士,他们的名字也应该出现在名单上。——Nature杂志特刊编辑理查德·莫纳斯捷尔斯基针对Nature杂志特刊内容“Science stars of China ”表示。注:全球顶级科学杂志英国Nature杂志网站近期密集刊文,关注中国科技,并制作了“中国的科学特辑”,罕见地仅以一个国家的科研进步,作为探讨和介绍的重点。这一特辑发表了多篇文章,其中“中国科学之星”包括中国科学院遗传与发育生物学研究所植物生物学家高彩霞,她所在的实验室最先在农作物上使用CRISPR-Cas9基因编辑技
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方舟子发文质疑韩春雨“诺奖级”实验成果
网易科技讯消息,近日,方舟子公开发文质疑河北科技大学韩春雨“诺贝尔奖级”实验成果存在“不可重复复制操作”的问题,暗指韩春雨科研成果的真实性,并批评韩春雨对质疑的回应态度。今年5月2日,《自然》系列顶级刊物《Nature Biotechnology》(中文名《自然生物技术》)在线发表了来自中国河北科技大学生物科学与工程学院青年教师韩春雨副教授题为《DNA-guided genome editing using the Natronobacteriumgregoryi Argonaute》的重大原创性成果。韩春雨的团队发明了一种新的基因编辑技术NgAgo-gDNA,向已有的最时兴技术CRISPR-
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新华社:中国科技为何引起《自然》强烈关注
新华社记者张家伟 杨骏从中国科学家的基因编辑技术到中国科技创新发展,从中国科研之星到中国基础研究态势,全球顶级科学杂志英国《自然》杂志网站近期密集刊文,关注中国科技,并制作了“中国的科学特辑”,罕见地仅以一个国家的科研进步,作为探讨和介绍的重点。《自然》杂志网站6月22日刊文认为,作为全球第二大科研国家,在过去数十年的持续投入下,中国越来越多的基础科学研究跻身世界前列。褒奖固然让人欣喜,但这还是那个在科研上曾一直跟跑、并跑的中国吗?到底是什么吸引了《自然》如此关注中国科研?新华社记者为此采访了《自然》杂志的相关编辑。为何在近期密集关注中国科技?“过去10年里,中国的科研产出一直在增长”,《自然
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基因编辑食品,你敢吃吗?
如果你不能接受转基因,那基因编辑食物呢,你愿意让它们出现在你的餐桌上吗?在美国宾夕法尼亚州切斯特县一家酒店的会议大厅中,一百多位农业生产者齐聚一堂,他们或许没有基因编辑的相关知识背景,但都对蘑菇了若指掌。在宾夕法尼亚州,蘑菇的平均日产量近500吨,雄霸美国12亿美元的蘑菇市场。然而,他们生产的蘑菇有些还没来得及卖出去,就在货架上变成褐色,腐败了。蘑菇对于物理碰撞十分敏感,即便是小心谨慎的“一触式”采摘法和精心的包装,也可能激活那些加速蘑菇变质的酶。去年秋天一个有雾的清晨,在与蘑菇相关的继续教育讲座上,一位名叫杨亦农(Yinong Yang)的生物学家走上讲台,向大家宣布他已找到了有望解决蘑菇变
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用CRISPR对抗疱疹病毒感染
生物通报道:大多数成年人都携带多种疱疹病毒。在最初的急性感染之后,这些病毒在它们的宿主体内建立起了终身感染,并引起唇疱疹、角膜炎、生殖器疱疹、带状疱疹、传染性单核细胞增多症和其它疾病。一些疱疹病毒能导致癌症。在感染的潜伏期,病毒能够潜伏很长一段时间,但仍然保留引起偶发性再激活的能力,这可能会导致疾病。6月30日在《PLOS Pathogens》发表的一项研究表明,用CRISPR / Cas9基因组编辑技术攻击疱疹病毒DNA,可以抑制病毒复制,并且在某些情况下可消除病毒。CRISPR / Cas9系统可靶定特定的DNA序列,并诱发双链DNA的精确切割。在哺乳动物细胞中,这种切割是被标记的,并通过