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常兴团队Nature Methods发布CRISPR新工具
生物通报道:人们已经发现了大量与人类疾病有关的单核苷酸变异,其中许多是功能获得性突变,会导致蛋白质的氨基酸置换或者形成转录因子的新结合位点。然而现有筛选方法(包括CRISPR、CRISPRi和RNAi)只能破坏一个基因或者改变其表达水平,难以引入一系列功能获得性突变进行高通量筛选,亟需能有效作用于哺乳动物细胞的遗传多样化工具。中科院上海生命科学院/上海交大医学院健康科学研究所的研究团队十月十日在Nature Methods杂志上发表了一项重要研究成果。他们将活化诱导胞嘧啶核苷脱氨酶(AID)与CRISPR-dCas9融合起来,打造了有效的遗传多样化工具,以便对功能性变异进行高通量筛选。这篇文章
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George Church:好奇宝宝的巅峰之路
生物通报道:著名遗传学George Church是哈佛医学院的遗传学教授、Wyss研究所的核心成员。他开发了首个直接基因组测序和DNA多重化方法,为1994年破译首个细菌基因组合2003年的二代测序技术奠定基础。他领导个人基因组项目,让公众参与进来分享基因组和健康数据。他想办法用DNA编码数据,暂时记录了活细胞中的事件。他将基因组读写技术结合起来,对细菌基因组进行迄今最大规模的重写。他还率先将CRISPR用于器官移植、逆转衰老和gene drive。虽然声名赫赫、成果丰硕,但Church并不是一个天才,甚至曾患轻度阅读障碍。那么,这位沉默寡言的腼腆少年是如何走到基因组前沿成为技术先锋的呢?被退
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清华大学谢震Nature子刊:控制Cas9活性的新策略
生物通报道:使用人工合成的基因线路,对dCas9功能进行可编程的和精确的调控,以响应多个分子信号,将扩大CRISPR-Cas技术的应用范围。然而,由于现有病毒传递载体的包装限制,CRISPR-Cas治疗性基因回路的应用仍然是一种挑战。10月3日,清华信息科学与技术国家实验室谢震课题组在《Nature Communications》发表了题为“Integration and exchange of split dCas9 domains for transcriptional controls in mammalian cells”的研究论文,首次报道了在哺乳动物细胞中,通过合理拆分Cas9/d
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CRISPR专利之争出现神逆转
生物通报道:有着巨大商业价值的基因组编辑工具CRISPR历时9个月的专利大战,出现了两个令人惊讶的曲折。上周,争夺CRISPR专利的研究机构之一——Broad研究所的律师,提交了可能使其获胜的议案。10月4日,这场战争的新参与者——法国一家称为Cellectis的生物制药公司,可能使整场战争变得悬而未决,它刚刚颁发的专利,大致覆盖基因组的编辑方法,也包括CRISPR。延伸阅读:CRISPR专利之争愈演愈烈 或将鱼死网破;CRISPR专利之争再起硝烟;CRISPR发明专利究竟花落谁手?。Broad研究所是哈佛大学和麻省理工学院之间的联姻机构,拥有13项CRISPR专利,受到了来自加州大
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韩春雨基因编辑技术在数百个基因中均重复失败
因为大面积无法重复实验,作者和所在单位又不出面应对质疑声,河北科技大学副教授韩春雨领衔的NgAgo基因编辑技术的重复工作已经遇冷。自2016年5月2日在《自然-生物技术》在线发表论文,NgAgo已经问世5个月,韩春雨在论文中描述的NgAgo是一项和目前主流的“基因魔剪”CRISPR拥有同样效率的基因编辑技术,能高效地实现对特定DNA片段的敲除、加入。但在近日哥本哈根举办的“CRISPR Genome Editing(CRISPR基因编辑)”大会上,美国、丹麦、德国在基因编辑领域顶尖的实验室参会,却无人提及NgAgo。美国生物学家张锋、詹妮弗·杜德娜(Jennifer Doudna)、乔治·丘奇
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Science:张锋再发CRISPR新突破发现
——两个独立的研究小组分别证明了基于 CRISPR 的技术可以用于识别疾病相关基因的关键调控元件生物通报道:来自麻省理工学院,Broad研究院等处的研究人员利用一个大型单导向RNA(sgRNA)文库,发现了影响癌症患者耐药性的基因的非编码调控元件,这一重要的发现公布在9月29日的Science杂志上,同期杂志的另外一项独立研究采用了一种高通量 CRISPRi 筛选技术,也在距离两种疾病相关基因1Mb(兆碱基)处发现了非编码元件。这两项研究延伸了CRISPR在基础研究中的应用,分别扩展了 CRISPRi和 CRISPR/Cas9 非编码基因组筛选的应用范畴。各家点评虽然之前研究人员曾利用 CRI
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设计婴儿和CRISPR牛引发生物伦理学家关注
生物通报道:从“设计婴儿”到转基因蚊子,基因组编辑技术(如CRISPR–Cas9)的进展带来了巨大的科学进步,同时也引发了严重的伦理问题。相关阅读:世界首个三亲宝宝诞生华裔医生之手;用CRISPR使蚊子变性 对抗病毒传播。在9月30日发布的一项130页的初步报告中,颇有影响力的伦敦Nuffield生物伦理学委员会宣布,这种技术的两个应用:在人类胚胎和畜牧业中应用基因组编辑,需要进一步关注。在9月29日的新闻发布会上,Nuffield委员会主任Hugh Whittall称,这两个领域是基于学者和公众几个月的分析和投入,而被选定的。Nuffield工作组成员和伦敦大学国王学院的法律学者K
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两篇Science重大成果:CRISPR与非编码基因组
生物通报道:来自麻省理工学院,Broad研究院等处的研究人员利用一个大型单导向RNA(sgRNA)文库,发现了影响癌症患者耐药性的基因的非编码调控元件,这一重要的发现公布在9月29日的Science杂志上,同期杂志的另外一项独立研究采用了一种高通量 CRISPRi 筛选技术,也在距离两种疾病相关基因1Mb(兆碱基)处发现了非编码元件。这两项研究延伸了CRISPR在基础研究中的应用,分别扩展了 CRISPRi和 CRISPR/Cas9 非编码基因组筛选的应用范畴。前文:Science:张锋再发CRISPR新突破发现 Eric Lander研究组成果同期Science杂志也公布了另外一项相关研究:
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Nature:CRISPR将成为诺贝尔奖的赢家吗
生物通报道:每年,诺贝尔奖的各路“占卜家”们都在预测谁将会最终获得这一殊荣,今年面对即将到来的10月,从诺贝尔医学奖评委丑闻开始,就一路喧嚣不止。一些科学家认为 CRISPR–Cas9基因编辑作为改变基因组的一种新型快速有效方法,可能会是今年的赢家,但对于诺贝尔委员会来说,要在短时间内做出判断并不容易, CRISPR–Cas9已经在美国专利局中点燃了“战火”,它是否也会令评委们感到头疼呢?而且如果它获得了诺贝尔奖,这是否会影响专利的分配,或者反过来说,诺奖委员会需要等待专利局给出判决?尽管争论不休,但正如约翰霍普金斯大学的微生物学家Arturo Casadevall所说的那样,“10月的第一周
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关于瑞典学者编辑人类胚胎的5个关键问题
生物通报道:近期,瑞典卡罗林斯卡医学院的科学家们首次对健康的人类胚胎进行了基因编辑,但是这些研究人员究竟编辑的是什么呢?为什么该研究如此有争议?在最近的实验中,卡罗林斯卡医学院的生物学家Fredrik Lanner及其同事,将基因编辑工具注入到人类胚胎,打算对胚胎的DNA进行非常精确的修改。美国国家公共电台(NPR)首次报道了这一消息,这项工作在一个非常早期的发育阶段进行的,只在受精几天后。(相关阅读:瑞典科学家编辑人类胚胎基因)研究人员说,他们希望该实验将帮助他们了解胚胎早期发育的信息,也许有一天会带来新的方法治疗不孕和预防流产。关于这项研究,有五个关键的事实你要知道:1、这并不是第一次有科
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CRISPR先驱9月连发五项重磅成果
生物通报道:加州大学伯克利分校的生物化学家Jennifer A. Doudna教授是基因组编辑技术变革的先驱之一,她曾因这一技术获得了“生命科学突破奖”( Breakthrough Prize)(欲戴王冠,必承其重:追寻CRISPR奥秘的女科学家),同时也是CRISPR专利的有力竞争者(CRISPR发明专利究竟花落谁手?)。Doudna带领的研究团队取得了诸多令人侧目的CRISPR研究成果,仅在2016年9月份,她带领的研究团队就先后在国际权威期刊《Molecular Cell》、《Nature Structural Biology》、《Nature Biotechnology》、《Natur
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孟山都本月再次公布重磅消息:将用CRISPR-Cas9技术育种
科技日报北京9月26日电 (记者聂翠蓉)继宣布被德国制药巨头拜耳公司收购后,孟山都本月再次公布重磅消息:它已获准将美国布劳德研究所的基因编辑技术CRISPR-Cas9相关专利用于农作物育种,并率先将这一先进技术用于农业商业化。但孟山都在使用该技术时必须遵守几个关键制约。2013年发明并已在医学领域商业化的CRISPR-Cas9技术,在农业领域也有广阔潜力,可增加产量、降低化学农药使用,并使作物耐受因全球变暖而频繁出现的干旱。谈到孟山都抛弃几十年的基因修饰技术(GMOS)转向CRISPR技术的原因,该公司负责生物技术研究的汤姆·亚当斯表示,GMOS技术引入的外源基因在农作物基因组中的位点太随机,
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瑞典科学家编辑人类胚胎基因
尽管对人类胚胎基因组进行编辑在过去一年中引发了激烈争议,但美国国家公共电台报道称,瑞典科学家Fredrik Lanner已经在全球首次对健康人的胚胎进行了编辑。Lanner希望通过利用CRISPR-Cas9技术找到新的不孕不育和流产疗法。他将使胚胎中的基因失去活性,以了解它们在早期发育中发挥什么样的作用。但是很多人担心,基因编辑会产生设计婴儿和新的遗传性疾病,然而Lanner表示,很有必要开展类似的基础研究,从而避免这些情况发生。(冯维维)《中国科学报》 (2016-09-26 第2版 国际)
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如何在癌症研究中使用CRISPR工具
2016年6月21日,对CRISPR技术而言是具有里程碑意义的。这一天,美国NIH的重组DNA顾问委员会给美国的第一例临床试验开了绿灯。研究人员计划用CRISPR/Cas9技术来增强癌症疗法。这距离它的发现,仅仅只有四年。Horizon Discovery的首席科学家Jon Moore认为,基因组编辑在药物靶点的鉴定和验证以及直接的细胞治疗上具有重要的意义。例如,Horizon已经启动了一项混合文库筛选,寻找与抑癌基因p53相互作用的基因。他们鉴定出MDM2,作为另一种潜在的药物靶点。“那些保留了野生型p53活性的癌细胞对MDM2的敲除十分敏感,”Moore说。如果你也希望在自己的实验室中开展
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河北科大基因编辑中心近两千万采购项目开标
因韩春雨NgAgo论文而成为全球基因编辑领域焦点的河北科技大学,其总投资达2.24亿元人民币的基因编辑技术研究中心建设又有了新进展。9月21日上午9时,河北科技大学基因编辑技术研究中心采购进口仪器设备项目在石家庄开标,预算金额为1958万。该项目的代理机构河北省国际招标有限公司的工作人员向澎湃新闻(www.thepaper.cn)表示,开标会一直从当天上午9时持续到下午1时结束。据中国政府采购网的公示信息,该项目的采购设备包括流式细胞仪等10个标段,上述工作人员表示,投标时间长短由标段、投标单位的多少来确定。该项目联系人李俊旭告诉澎湃新闻,因为是公开招标,很多企业来投标,但评标结果还没有公示,
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CRISPR专利之争愈演愈烈 或将鱼死网破
Cas9 (red) uses an RNA guide (green) to cut DNA生物通报道:国际遗传学家George Church开创了测定和改变基因组的方法。他也被称为合成生物学的创始人,并可能是世界“已灭绝的猛犸象复活工作”的顶级权威专家。现在,围绕着“谁拥获得革命性基因编辑技术专利权”的一场战争,可能在某种程度上取决于国际遗传学大牛Church的科学技能是否可以被认定是“普通人就能做到的”。也许这听起来很荒谬,但是,在围绕着CRISPR–Cas9基因编辑专利权的战争中,竞争者之间互相扯皮的这个诡异问题,是美国专利和商标局(USPTO)必须考虑的。这场可能拖上几年的诉讼,已经
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基因组编辑的下一个目标:表观基因组
CRISPR技术在生命科学领域刮起了一阵旋风。如今,表观基因组的编辑又成为一个新的热点。人们对染色质和表观遗传修饰进行操控,希望借此了解它们对基因组和细胞功能的影响。在新一期的《Genome Biology》上,波士顿大学等机构的研究人员发表综述,介绍了这方面的进展。染色质的DNA和组蛋白上存在着大量的生化修饰。这些修饰提供了重要的附加信息,因此被称为表观基因组。大量研究表明,表观基因组在调控基因组的结构和功能上发挥关键作用,包括基因表达的时机、强度和记忆。同时,表观基因组的改变也与许多人类疾病存在关联,包括大多数癌症。然而,对于表观基因组的功能,我们还有很多不甚了解的地方。因此,基因组编辑工
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四川大学魏于全院士发表CRISPR新研究
生物通报道:人锌指蛋白32(ZNF32)是一种Cys2-His2锌指转录因子,在细胞命运中发挥重要的作用,但是其功能仍然是未知的。近期在国际学术期刊《Oncotarget》上发表的一项研究中,来自四川大学和南开大学等处的研究人员,采用CRISPR相关的蛋白9系统,揭示了ZNF32功能在神经干细胞标记SOX2表达和再生调控中发挥的一个关键作用。本文通讯作者是四川大学生物治疗国家重点实验室的魏于全院士和林苹教授。魏于全院士是教育部“****奖励计划” 第二批特聘教授,1997 年国家杰出青年科学基金获得者,要从事肿瘤生物治疗的基础研究、应用开发与临床医疗实践。相关研究结果已发表在Nature Me
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南京大学发布无序列限制的DNA编辑新工具
生物通报道:内切酶经过改造可以成为强大的DNA编辑工具,比如ZFN、TALEN、风头正劲的CRISPR–Cas系统和引起争议的NgAgo技术。不过这些技术都是通过序列识别来实现靶向切割的,会受到序列偏好的限制。南京大学的研究团队九月十五日在Genome Biology杂志上发表了一项突破性成果。他们开发了结构引导的DNA编辑新技术,不再受到靶序列的限制。这篇文章的通讯作者是南京大学医学院附属金陵医院的周国华(Guohua Zhou)研究员、南京大学模式动物研究所的赵庆顺(Qingshun Zhao)教授和朱敏生(Minsheng Zhu)教授。FEN1(flap endonuclease-1)
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多篇Nature子刊文章:“千奇百怪”CRISPR
生物通报道:今天,CRISPR已经成为全世界范围内分子生物学家众所周知的一个名字,各国研究人员热切地使用这一系统在生命王国中嵌入或删除基因组中的DNA序列。同时本系统技术也在不断升级中,各种创新性技术层出不穷,近期Nature Chemical Biology又公布一项“奇怪”的CRISPR技术成果——利用化学开关切换CRISPR活性。细胞中有许多开启CRISPR/Cas9基因编辑活性的方式,但每一种技术发展至今,依然存在不少问题:要不就是非常复杂,不好操作,要不就是不可逆。为此一组研究人员从 调控基因表达的 Cre 重组酶技术中汲取灵感,研发出了一种方便使用的可逆CRISPR激活和失活技术。