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  • 利用基于水和沉积物(底栖表面及悬浮固体)的环境DNA,研究近期恢复的溪流中鱼类群落多样性与组成估计结果的一致性

    环境DNA(eDNA)作为一种新兴的生态监测手段,近年来在淡水鱼类群落研究中备受关注。该研究聚焦于加拿大安大略省古尔胡椒粉河支流马登溪的生态监测,通过对比电捕鱼法与三种eDNA采样方法(水体、底泥表面沉积物、悬浮固体)在鱼类多样性评估中的异同,揭示了当前eDNA技术应用中的关键挑战与改进方向。研究首先通过电捕鱼法获取基准数据,共记录到22种鱼类。随后采用统一12S基因测序方案,分别从水体、底泥表面沉积物和悬浮固体中提取DNA进行分析。实验设计包含三个关键创新点:其一,首次将电捕鱼与三种eDNA采样方法进行系统性对比,特别是针对底泥表面沉积物这一传统研究较少的采样介质;其二,引入混合阳性对照验证

    来源:Environmental DNA

    时间:2025-11-26

  • 利用产甘油脂的假单胞菌(Pseudomonas azotoformans)和锌-硒纳米颗粒对废旧发动机油进行纳米生物修复:一种协同的绿色处理方法

    该研究聚焦于开发一种新型纳米生物修复技术,通过整合产糖脂类表面活性剂的大肠杆菌KMVKT08菌株与生物合成锌-硒(Zn-Se)纳米颗粒,实现废机油的高效降解。以下从技术原理、创新性、应用潜力及环境意义四个维度展开分析:一、技术原理的多层次协同机制研究团队构建了"微生物-表面活性剂-纳米颗粒"三级协同体系。菌株KMVKT08通过分泌糖脂类表面活性剂,显著降低废机油的表面张力(28.6±0.5 mN/m),使长链烃类物质发生物理形态改变,形成更易被微生物利用的微乳液结构。这种生物化学预处理使有机物分子量从C18(18碳)烃类降至C6-C10范围,为后续催化氧化创造有利条件。纳米颗粒的引入建立了双重

    来源:International Biodeterioration & Biodegradation

    时间:2025-11-26

  • 探究水温和水流对河流水质的综合影响:高度可变数据集存在的问题及可能的解决方案

    该研究针对多变量环境数据中水质参数与水温、水流关系的复杂性展开分析,提出了整合不同采样位置和时间的水质数据的方法论,并揭示了气候变化背景下河流水质参数的关联规律。研究基于多瑙河上游、下游及中游、近岸四个采样区域2019-2020年度共29次采样数据,通过标准化主成分分析(PCA)和共识生物图技术,系统解构了水温与水流对36项水质参数的影响机制。研究首先发现,传统单变量分析方法存在显著局限性。通过对全部样本和分区域(上游/下游、中游/近岸)数据集的对比分析,发现130/630对水质参数的符号和强度存在数据依赖性,其中仅15%的相关系数在整体数据集与子集分析中保持一致。这种显著的相关性波动主要源于

    来源:Heliyon

    时间:2025-11-26

  • 温度对Micropterus salmoides(北美梭鲈)生长性能、抗氧化能力、卵巢发育和基因表达的影响

    本研究以大型口黑鲈(Largemouth Bass, LMB)为对象,系统探究了恒定温度(18℃、23℃、28℃)对性腺发育及分子机制的调控作用。通过为期60天的养殖实验,结合抗氧化能力评估、血清激素检测及转录组测序技术,揭示了温度对黑鲈生长性能、卵巢发育阶段及关键代谢通路的影响规律,为水产养殖中的温度调控技术提供了理论依据。**一、研究背景与意义** 作为经济价值显著的水产养殖对象,黑鲈在温度敏感型繁殖调控领域具有重要研究价值。已有研究表明,水温对鱼类性腺发育具有关键调控作用,但具体分子机制尚不明确。本研究的创新性在于:首次系统对比了18℃、23℃、28℃三种恒温条件对黑鲈生长性能、抗氧化

    来源:Aquaculture Reports

    时间:2025-11-26

  • 中国南海仙北海山周围的原生生物多样性与群落结构

    海山生态系统浮游原生生物群落的多样性及组成特征研究——以南海轩辕山为例一、研究背景与科学问题海山作为海底地形的重要单元,其独特的物理化学环境对浮游生物群落结构具有显著影响。尽管已有研究揭示了海山对浮游植物和动物群落的作用机制,但关于原生生物(特别是二极虫门)的系统研究仍存在知识空白。本研究聚焦南海轩辕山,通过整合环境DNA测序与定量PCR技术,首次同时解析整个原生生物群落和二极虫门亚群落的垂直分布特征,旨在揭示水深梯度对浮游原生生物多样性的调控机制。二、研究方法与技术路线研究采用分层抽样法,在距海山200-1500米不同水层采集44份样品。通过优化引物设计(通用引物覆盖整个原生生物门类,特异性

    来源:Microbiology Spectrum

    时间:2025-11-26

  • 面粉类型和喂养时间对酸面团微生物群的影响

    酸面团微生物群落受面粉类型显著影响但受喂养频率影响较小酸面团作为古老的食品发酵体系,其微生物群落动态研究对理解微生物生态适应机制具有重要意义。本研究通过实验室控制实验,系统考察了不同面粉类型(全麦、面包粉、普通粉)和喂养频率(每日/隔日)对酸面团微生物群落的塑造作用,为解析环境因子对微生物群落演替的影响提供了新视角。在真菌群落结构方面,研究揭示了显著的生态位分化特征。所有实验组在发酵7-14天后均出现Kazachstania属酵母的快速增殖现象,该属酵母在28天成熟期中占据绝对优势地位(相对丰度达85-95%)。这种生态位替代现象与面粉类型无关,但值得注意的是Saccaromyces cere

    来源:Microbiology Spectrum

    时间:2025-11-26

  • 瑟拉蒂亚菌AS1在蚊子栖息地中的环境持久性及传播动态:推动用于疟疾控制的旁传遗传技术发展

    疟疾作为全球公共卫生的重要挑战,其防控策略的革新已成为研究热点。传统手段如杀虫剂和药物正面临多重耐药性问题,促使科学家探索替代方案。其中,利用工程化共生细菌进行基因传递的paratransgenesis技术备受关注。本文以伊朗巴兰德阿巴斯为研究基地,通过半自然场实验系统评估了假单胞菌属Serratia AS1-mCherry在疟疾传播媒介库蚊中的稳定性和传播效能,为新型生物防控策略提供关键数据支持。一、研究背景与意义全球每年约2700万疟疾病例和60万死亡,其中50%以上集中于非洲撒哈拉以南地区。传统防控手段面临双重挑战:寄生虫对青蒿素等抗疟药物的耐药性(WHO 2023年报告显示耐药率已达5

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-11-26

  • XRE家族蛋白DbuR是假单胞菌(Pseudomonas putida)中dbu操纵子的转录抑制因子

    Pseudomonas putida作为生物工程领域的重要底盘微生物,其代谢调控网络的研究对于优化工业应用潜力具有重要意义。本文系统解析了dbu操纵子的分子调控机制及其在D-氨基酸代谢中的功能拓展,揭示了该系统在动态环境适应中的多重调控策略。一、dbu操纵子的基础代谢功能该操纵子编码D-支链氨基酸氧化酶(DbuA)、Rid2家族蛋白(DbuB)和ABC转运蛋白(DbuC)。DbuA催化D-氨基酸α-碳氧化生成亚胺中间体,DbuB进一步完成脱氨基反应,产生氨和相应的酮酸。DbuC负责D-氨基酸的转运摄取。研究证实该系统可代谢D-亮氨酸、D-异亮氨酸和D-缬氨酸,为微生物提供氮源和碳源。二、转录调

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-11-26

  • 从美国乔治亚州分离出的Pseudomonas alliivorans菌株的特性研究:揭示其基因组多样性和对洋葱的致病性

    《科学》杂志近期发表的这项研究,聚焦于全球重要的洋葱病原菌——**Pseudomonas alliivorans**(P. alliivorans)的基因组特征与致病机制。研究通过整合基因组测序、比较基因组学、功能实验及分子进化分析,揭示了该菌的遗传多样性、核心致病基因及其在洋葱种植中的传播路径。以下是核心发现与科学意义的解读:### 一、研究背景与核心问题洋葱作为全球三大经济作物之一,其生产长期受多种细菌性病害困扰。P. alliivorans作为新兴病原体,曾因与近缘种P. viridiflava混淆而难以准确鉴定。该研究通过**系统性基因组分析**与**功能实验验证**,首次全面解析了P

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-11-26

  • 针对高通量酵母遗传变异工程,对Cas12a变体的PAM(Protein-Alphavirus-Mediated)兼容性进行基准测试

    近年来,CRISPR/Cas系统在微生物基因编辑领域中的应用不断拓展。针对酿酒酵母(*S. cerevisiae*)这一模式生物,研究者们尝试开发更高效的基因编辑工具以应对其基因组特性带来的挑战。酵母基因组具有高AT含量(约61.5%),而传统CRISPR/Cas9系统依赖NGG型PAM序列(G富集型),导致约38.5%的基因组区域无法被有效靶向。这一局限性严重制约了通过基因编辑手段对酵母功能基因组进行系统性研究。### 研究背景与核心问题Cas9系统在酵母中虽已广泛应用,但其严格的PAM依赖性(NGG)限制了编辑效率。尽管已有研究通过改造Cas9蛋白(如SpG、SpRY等)放宽PAM限制,但

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-11-26

  • 2017–2019年间在中国烟台地区传播的人类腺病毒40/41型的遗传多样性和系统发育特征

    该研究针对2017-2019年间山东省烟台市急性胃肠炎患者粪便样本中流行的HAdV-F40和F41毒株,通过多组学整合分析揭示了其遗传多样性、重组特征及进化规律。研究采用实时荧光PCR结合纳米孔测序与Illumina测序技术,对94份阳性样本中的37株进行全基因组测序,并纳入全球数据库中的30株F40和133株F41毒株进行比较分析。以下是核心发现解读:一、流行病学特征样本总量达2221份,检测出4.23%的腺病毒阳性率(94/2221),其中2018年检出率最高(6.55%)。HAdV-F41显著占优(33/37),主要感染2岁以下儿童(中位年龄2岁),性别分布均衡。病毒载量存在显著差异(C

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-11-26

  • 综述:农用化学品中的肉桂酸衍生物:当前应用与未来前景

    肉桂酸(Cinnamic Acid, CA)及其衍生物作为天然酚类化合物,近年来在农业化学领域展现出广阔的应用前景。其独特的结构特征和多样的生物活性,尤其在病虫害防控方面,为开发环境友好型农药提供了新思路。以下从多个维度系统梳理CA衍生物的农业应用潜力及研究进展。### 一、植物生长调节与抗逆性调控CA及衍生物通过干扰植物代谢途径实现生长调控。研究表明,CA通过诱导活性氧(ROS)生成和破坏钙离子稳态,引发氧化应激反应,抑制细胞分裂与伸长。例如,2,3-二溴-3-(3-溴苯基)丙酸(化合物4a)对菜豆幼苗的抑制率达80%,其作用机制与降低线粒体膜电位及ROS水平相关。结构修饰显示,苯环上羟基取

    来源:Journal of Advanced Research

    时间:2025-11-26

  • 健康饮食转变对欧洲各地土壤温室气体排放的影响

    本研究通过整合经济模型与生物地球化学模型,系统评估了欧盟及英国采用《柳叶刀饮食报告》(EAT-Lancet)建议的植物基饮食转型对土壤温室气体平衡的影响。研究揭示了饮食结构变化与土壤碳动态之间的复杂关联,并探讨了土地再利用策略的潜在补偿效果。### 一、研究背景与核心问题全球农业系统贡献了约三分之一的人为温室气体排放,其中畜牧业通过反刍动物消化产生的甲烷(CH₄)占重要比例。尽管已有研究关注饮食转型对CH₄减排的作用,但土壤碳库(SOC)和一氧化二氮(N₂O)排放的潜在影响尚未被充分量化。特别值得注意的是,减少牲畜养殖可能导致有机肥输入下降和永久草地转为农田,进而引发土壤碳流失和氮循环失衡。本

    来源:Global Change Biology

    时间:2025-11-26

  • 捕食者的减少驱动了热带森林中白蚁介导的木材分解过程的功能转变

    摘要 en此链接指向英文版摘要 es此链接指向西班牙文版摘要 白蚁在热带森林的木材分解和养分循环中起着关键作用,然而捕食者缺失对白蚁驱动过程的生态影响仍知之甚少。本研究探讨了北方Tamandua(一种专门捕食白蚁的动物)的缺失如何影响巴拿马地区的白蚁空间生态学行为及木材消耗情况。我们以树栖白蚁(Microcerotermes arboreus和属)为研究对象,比较了无捕食者和有捕食者环境下的种群密度、巢穴特征及木材消耗速率。研究发现,无捕食者区域的白蚁巢穴密度显著更高,巢穴高度更低,木材消耗量也更大。例

    来源:Global Change Biology

    时间:2025-11-26

  • 综述:极端气候事件对进化过程的影响

    气候变化引发的极端气候事件(ECEs)对生物进化过程的影响已成为当前生态学和进化生物学研究的重要议题。本文系统梳理了ECEs如何通过干扰突变、自然选择、基因流和遗传漂变等核心进化机制,加剧生物多样性危机。研究指出,ECEs的不可预测性、复合性和突发性特征,使得物种难以通过传统进化路径实现适应性调整,导致种群遗传多样性快速下降。尽管部分研究提出应激反应可能通过表观遗传调控或基因流动产生短期适应,但长期来看,种群在频繁ECE冲击下面临基因库萎缩、适应性瓶颈和生态位挤占等多重威胁。本文特别强调,当前生态学研究多聚焦于短期响应,而忽视进化过程的滞后性和系统性风险,这种认知偏差可能低估ECEs对生物多样

    来源:Global Change Biology

    时间:2025-11-26

  • 干旱程度决定了农田土壤有机碳和无机碳对干旱的响应

    摘要 面对气候变暖和极端天气事件增加的挑战,了解干旱条件下土壤有机碳(SOC)与无机碳(SIC)之间的平衡关系对于准确评估全球土壤碳(C)的固存量至关重要。然而,以往的研究主要集中在SOC上,尽管有新的证据表明SIC对土壤湿度动态非常敏感。本研究利用全球土壤剖面的碳含量数据,比较了农田中SOC与SIC相对于总土壤碳(STC)的比率,以评估气候干旱对土壤碳储量的影响。研究结果表明,在0–30厘米、30–100厘米和100–200厘米的土层深度,总土壤碳含量分别为8.0、16.7和21.6千克/平方米。深层土壤(100–200厘米)中

    来源:Global Change Biology

    时间:2025-11-26

  • 四十年来北方森林土壤养分储量的显著变化

    瑞典森林土壤营养动态的长期研究揭示,尽管树木生物量显著增加,土壤有机层中镁、钙和锰的浓度及储量呈现上升趋势,而氮含量下降。这一发现为理解北方森林可持续管理提供了关键依据。研究基于1983-2022年间四次全国性土壤普查数据,覆盖瑞典94%的森林区域。通过对比不同时期土壤有机层中主要营养元素的变化,结合树木生长数据与气象记录,发现三个核心现象:首先,酸沉降减少显著降低了土壤中镁、钙和锰的淋失,同时提高了这些元素的生物有效性;其次,树木根系活动促进了矿物质溶解,形成“营养抬升”效应;第三,氮素动态与大气输入及树木吸收存在显著反馈机制。在营养元素变化方面,镁浓度的增幅最为显著(38%),钙次之(21

    来源:Global Change Biology

    时间:2025-11-26

  • 导致虾早期死亡综合征(EMS)的副溶血性弧菌的致病特性:一项比较转录组学研究表明代谢适应性与毒力基因表达之间的关系

    副溶血性弧菌(*Vibrio parahaemolyticus*,VP)引起的对虾早期死亡综合征(EMS)是全球对虾养殖面临的重要挑战。该疾病根据肝脏胰腺组织病理学特征可分为急性肝胰腺坏死病(AHPND)和非AHPND两类,两者均由VP引发但致病机制存在差异。AHPND菌株通过分泌PirABvp毒素破坏宿主细胞膜,而非AHPND菌株的致病机制尚未明确。本研究以AHPND菌株5HP和非AHPND菌株2HP为模型,通过比较其在富营养培养基(TSB)、人工海水(SW)和虾 conditioned海水(SSW)中的生长特性及转录组特征,揭示了营养条件与宿主环境对VP毒力基因表达的调控作用。### 1.

    来源:Environmental Microbiology Reports

    时间:2025-11-26

  • DNA宏条形码技术在医院环境真菌评估中的贡献与应用前景

    在医院这个特殊环境中,免疫抑制患者面临着侵袭性真菌感染(IFI)的严重威胁。近年来,随着免疫缺陷患者数量的增加和抗真菌药物耐药性的出现,IFI的发病率持续攀升。特别是在COVID-19大流行期间,曲霉病、毛霉病和念珠菌血症等IFI病例显著增加,使得医院环境的真菌监测变得尤为重要。目前,医院环境的微生物监测主要依赖传统的培养方法,这种方法虽然能检测存活菌株,但存在明显局限性——超过90%的真菌无法通过标准培养基培养。这使得我们对于医院环境中真菌多样性的认识存在巨大空白。为了解决这一问题,Laura García-Gutiérrez、Emilia Mellado和Pedro M. Martin-S

    来源:Microbial Ecology

    时间:2025-11-26

  • 雄性黑腹果蝇肠道微生物群的年龄依赖性动态及其与生活史性状的关联研究

    在生命科学领域,理解衰老和繁殖的机制对于揭示生活史进化的复杂动态至关重要。近年来,越来越多的证据表明,肠道微生物群与多种物种的生活史进化密切相关,包括黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)这类经典模式生物。肠道微生物群通过扩展宿主基因代谢能力、调节免疫系统等方式,显著影响宿主的寿命、健康期、繁殖和行为。值得注意的是,将年轻个体的微生物群移植给年老个体,甚至可以逆转宿主衰老,延长寿命并增强晚期繁殖能力。这些发现将肠道微生物群定位为生活史进化的核心组成部分。然而,现有关于生活史进化的研究存在明显的性别偏见,主要集中在雌性个体上。这导致了对肠道微生物群与雌性生活史关联的深入研究,

    来源:Microbial Ecology

    时间:2025-11-26


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