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Nature：哈佛，MIT构建细胞“图谱”，指导类风湿关节炎精准医学治疗
研究人员分析了来自类风湿性关节炎组织的314,000多个细胞，定义了六种类型的炎症，涉及不同的细胞类型和疾病途径了解单细胞水平的疾病可能会促进靶向药物的开发和治疗策略类风湿性关节炎(RA)是一种以炎症为特征的自身免疫性疾病，可导致疼痛、关节损伤和残疾，影响全球约1800万人。虽然针对特定炎症途径的RA疗法已经出现，但只有一些患者的症状随着治疗而改善，这强调了针对不同疾病亚型的多种治疗方法的必要性。为了更精确地定义RA的细胞驱动因素，由麻省理工学院Broad研究所和哈佛大学以及布莱根妇女医院(麻省总医院布莱根医疗保健系统的创始成员之一)的研究人员共同领导的一个国际研究联盟，在单细胞水平上分析了来
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从线粒体功能入手，改善肿瘤免疫疗法
现在可以肯定的是，衰竭过程受到“细胞的动力”——线粒体的显著影响。当线粒体呼吸失败时，会触发一系列反应，最终导致T细胞的遗传和代谢重编程——这一过程会导致它们的功能衰竭。但是这种T细胞的“衰竭”是可以被抵消的:细胞代谢的药理学或遗传优化增加了T细胞的寿命和功能。例如，这可以通过过度表达线粒体磷酸转运体来实现，该转运体驱动提供能量的分子三磷酸腺苷的产生。这些发现是由免疫学研究所的Martin Vaeth博士领导的研究小组在《Nature Communications》杂志上发表的。“我们乐观地认为，我们的发现将有助于改善癌症免疫治疗，”这位科学家说。 &
来源：Nature Communications
时间：2023-11-10
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ASHG 2023年会展示诊断和治疗的力量，卢煜明教授介绍片段组学
在上周举行的2023年美国人类遗传学学会（ASHG）年会的主席研讨会上，学会主席Brendan Lee邀请的三位演讲者介绍了最新的研究进展。用Lee的话来说，这些进展显示了“诊断和治疗的力量”。液体活检开幕式由香港中文大学的卢煜明（Dennis Lo）教授主持，他是无创产前诊断和液体活检领域的先驱。1997年，卢教授领导的研究团队发现，胎儿释放的游离DNA（cfDNA）在妊娠10周时就可以在母体血液中检测到。到2008年，他的研究小组表明，对血浆中的cfDNA进行随机测序，然后将这些序列映射到各自的染色体上，可以用来检测染色体。这使得唐氏综合症的检测准确率达到99%。自2011年进入临床以来，
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一个意想不到的肺癌复发预测因子
根据纽约大学朗格尼健康中心及其珀尔马特癌症中心领导的一项新研究，从肺肿瘤附近看似健康的组织中收集的遗传信息可能比分析肿瘤本身更能预测癌症治疗后是否会复发。健康组织RNA预测肺癌复发的准确率为83%。这项研究包括147名早期肺癌患者。这一发现可能会彻底改变早期癌症治疗和生物标志物鉴定。这项新研究的重点是肺腺癌，这是一种在肺泡上皮细胞中形成的癌症，根据美国疾病控制和预防中心的数据，它占美国所有肺癌的三分之一左右。如果在疾病进展的早期通过手术切除肿瘤，大多数患者都能治愈，但在大约30%的病例中，残留的癌细胞会重新生长，并可能导致死亡。因此，专家们长期以来一直在寻找可能促使更积极的初始治疗的生物标志物
来源：Nature Communications
时间：2023-11-10
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Cancer Cell：攻击胰腺癌的根源
胰腺癌不仅仅是一种疾病，但这是目前治疗它的方法。Tannishtha Reya实验室的新工作可能有助于为改变铺平道路。虽然大多数胰腺癌被归类为胰腺导管腺癌(PDAC)，但也存在其他几种亚型。“每个人都接受同样的化疗，即使一些亚型对治疗的反应明显较低，甚至更致命，”哥伦比亚大学瓦格洛斯内科和外科医生学院的赫伯特和佛罗伦萨欧文基础癌症科学教授(生理学和细胞生物物理学)和赫伯特欧文综合癌症中心转化研究副主任Tannishtha Reya博士说。由于缺乏相关的模型和对不同形式胰腺癌的了解不足，肿瘤亚型信息没有被考虑到风险分层或治疗。她的发现揭示了胰腺中单个干细胞和祖细胞是如何产生多种不同类型的胰腺癌的
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NEJM：每25人中就有1人携带与寿命缩短有关的基因型
每25人中就有1人携带与寿命缩短有关的基因型安进(Amgen)子公司deCODE genetics的科学家发表了一项研究，研究了在冰岛人群中检测到的可操作基因型及其与寿命的关系。这项研究的结果促使冰岛政府宣布在全国范围内努力开展精准医疗。由于向人口提供精准医疗需要大量的人口基因组学、转录组学和蛋白质组学数据，冰岛人目前特别适合这项工作，因为他们看到了前所未有的数据量。这项研究发表在《新英格兰医学杂志》上，重点研究了增加疾病风险的基因型，而预防或治疗措施已经建立起来。这些基因型称为可操作基因型。科学家们使用了一个基于人群的数据集，包括58000名全基因组测序的冰岛人，来评估携带可操作基因型的个体
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Nature子刊：一个点突变如何深刻地改变基因调控
霍奇金淋巴瘤是年轻人中最常见的淋巴瘤之一。它的特点是存在较大的B淋巴细胞，这是不寻常的，因为它们的表面上有许多其他免疫细胞的识别标记，比如在吞噬细胞、树突状细胞或T细胞上发现的那些标记。现在，由实验和临床研究中心(ECRC)的Stephan Mathas领导的一个团队解释了这些变化是如何在细胞中发生的，以及它们有什么影响。ECRC是Max delbrck中心和柏林慈善机构Universit tsmedizin的联合机构。“在经典霍奇金淋巴瘤中已经发现了许多不同的分子变化，但我们对积极促进肿瘤细胞发育的突变知之甚少，”Stephan Mathas说，他是发表在《自然通讯》上的这项研究的最后一位作
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JAMA Oncology：乳腺钼靶检查拿到假阳性结果的女性要当心
瑞典卡罗林斯卡医学院的研究人员近日在《JAMA Oncology》杂志上发表文章称，乳腺钼靶检查结果呈假阳性的女性在随后的20年里更有可能患上乳腺癌。他们发现，年龄在60至75岁之间、乳腺密度较低的女性患乳腺癌的风险更高。在全球范围内，乳腺癌是女性中最常见的癌症类型，据统计2020年全球新发乳腺癌达到226万例，而筛查是尽早发现肿瘤患者的重要手段。在瑞典，所有40至74岁的女性都受邀参加筛查，每隔18至24个月筛查一次。在每次筛查中，大约有3%的女性会出现假阳性结果，这意味着她们会被召回接受进一步检查，但是没有确诊癌症。乳腺钼靶检查的假阳性结果会引起心理焦虑，并影响筛查参加率。以往的研究表明，
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“芯片实验室”基因检测设备可以在三分钟内以最高的准确率识别病毒
巴斯大学的工程师们发明了一种病毒诊断设备，只需三分钟就能得出实验室质量的结果，他们称其为“世界上最快的新冠病毒检测”。LoCKAmp原型设备采用创新的“芯片实验室”技术，已被证明可以从鼻拭子中快速、低成本地检测Covid-19。巴斯大学的研究小组表示，这项技术可以很容易地用于检测其他病原体，如细菌，甚至癌症等疾病。该设备的工作原理是通过进行化学反应来快速释放和放大鼻拭子样本中的遗传物质，并在智能手机应用程序上查看结果。与大流行期间常见的横向流动检测不同，LoCKAmp采用了先前用于实验室PCR(聚合酶链反应)检测的相同的“金标准”基因检测技术，从而首次实现了实验室规模标准的快速检测。以及它的准
来源：Lab on a Chip
时间：2023-11-10
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柳树皮能成为下一种救命的抗病毒药物吗?
从季节性感冒到胃病，没有人喜欢感染病毒——而流行病可能是毁灭性的。我们需要安全、可持续的抗病毒药物来治疗未来的疫情。芬兰科学家在细胞样本实验中发现，柳树皮提取物具有广谱抗病毒作用。柳树皮是一种植物，已经提供了几种药物，包括现代阿司匹林的前身。这种提取物对包膜冠状病毒和非包膜肠病毒都有效，前者会导致感冒和Covid-19，后者会导致流感和脑膜炎等感染。目前还没有临床批准的药物可以直接对抗肠道病毒，所以这种提取物可能会改变未来的游戏规则。Varpu Marjomäki教授说，“我们需要广泛有效的工具来对抗我们日常生活中的病毒负荷，疫苗接种很重要，但它们无法及早处理许多新出现的血清型，无法
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神经元噩梦:糖、肥胖和大脑退化之间令人不安的联系
果蝇的高糖饮食导致胰岛素大脑的抵抗力会损害神经元废物的清理美国弗雷德哈钦森癌症研究中心的Mroj Alassaf领导的研究人员发现，肥胖与阿尔茨海默病等神经退行性疾病之间存在联系。利用普通果蝇，研究表明，高糖饮食——肥胖的标志——会导致大脑中的胰岛素抵抗，从而降低清除神经元碎片的能力，从而增加神经变性的风险。这项研究发表在11月7日的开放获取期刊《公共科学图书馆·生物学》(PLOS Biology)上，将影响旨在降低患神经退行性疾病风险的治疗方法。胰岛素抵抗和神经元碎片虽然肥胖被认为是阿尔茨海默病和帕金森病等神经退行性疾病的一个危险因素，但究竟是如何导致另一个仍然是个谜。这项新研究的重点是利用
来源：PLOS Biology
时间：2023-11-10
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阿拉伯的人基因组多样性
在一份新发布的题为《阿拉伯泛基因组参考草案》的预印本中，来自阿联酋和其他几个国家的研究人员利用测序技术组合产生的长读数据构建了细胞核和线粒体泛基因组，PacBio HiFi长读“为碱基提供了高度精确的长读”。泛基因组构建的新领域阿拉伯人构成了文化多样化的社区，总人口约占全球人口的5%。不幸的是，他们在全球测序项目中代表性不足，HPRC全基因组计划和1000基因组计划都没有对任何阿拉伯人口进行采样。该出版物的作者说，缺乏阿拉伯人口的参考基因组限制了对遗传多样性和许多疾病的遗传基础的研究。为了构建泛基因组，使用Hifiasm重新组装整个队列中所有样本的长序列读数(PacBio HiFi的平均中位数
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新的研究检验了带状疱疹活疫苗的长期有效性
带状疱疹(带状疱疹)活疫苗的效力在接种后的第一年最高，然后大幅减弱。但《英国医学杂志》发表的一项研究发现，即使是免疫系统较弱的患者，接种疫苗十年后，它仍能对带状疱疹及其并发症提供一定的保护。疫苗有效性是衡量疫苗在现实世界中保护社区的效果。带状疱疹，俗称带状疱疹，是由水痘病毒重新激活引起的疼痛皮疹。它在60岁及以上的人群和免疫系统较弱的人群中更为常见，并可能导致致残并发症。带状疱疹活疫苗是预防带状疱疹的第一种疫苗，全世界有5000多万人接种了这种疫苗。目前不建议免疫系统较弱的人服用，在美国也不再使用，但在英国和澳大利亚等其他地方仍在使用。然而，缺乏使用真实世界数据对其长期有效性的估计。为了解决这
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激活促进细胞分裂的途径能增加产生胰岛素的细胞的数量和功效
威尔康奈尔医学院的研究人员发现了一种新的途径，可以刺激糖尿病临床前模型中产生胰岛素的健康胰腺β细胞的生长。这一发现为未来的治疗方法带来了希望，将改善2型糖尿病患者的生活——这种疾病影响着全球超过5亿人。这项发表在9月15日《临床研究杂志》上的研究表明，激活促进细胞分裂的途径不仅扩大了产生胰岛素的细胞的数量，而且令人惊讶的是，它还增强了细胞的功能。该研究的资深作者劳拉·阿隆索博士说:“这令人放心，因为该领域长期以来一直认为，增殖会导致‘去分化’和细胞功能丧失。”她是内分泌学、糖尿病和代谢学部门的负责人，威尔代谢健康中心主任，也是威尔康奈尔医学院的E.休·勒基杰出医学教授。“我们的研究结果颠覆了这
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一种针对实体瘤的实验性治疗方法结合免疫疗法，能显著提高抗肿瘤效果
杜克大学和哈佛大学的一个研究小组发现，一种针对实体肿瘤的实验性治疗方法，如果与针对特定类型癌细胞的免疫疗法相结合，可能会特别有效。在杜克大学药理学与癌症生物学系主任Lee Zou博士的带领下，研究人员专注于一些癌细胞阻碍正常DNA修复以促进肿瘤形成的方式。这种现象被称为DNA错配修复缺陷。具有这种特征的肿瘤容易受到免疫疗法的影响，最近批准的一种生物标志物可以识别这些癌症，改善许多患者的预后。即便如此，只有一半的这种肿瘤患者对免疫疗法有反应。“迫切需要找到替代方法来靶向那些对免疫治疗没有反应的患者的肿瘤，”Zou说。在《基因与发育》杂志上发表的报告中，Zou和他的同事探索了肿瘤细胞中DNA损伤反
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肠道微生物群与老年男性前列腺炎症之间的新联系
-一篇新的研究论文发表在Aging杂志上(MEDLINE/PubMed将其列为“Aging (Albany NY)”和“Aging- us”，由Web of Science列出)第15卷，第20期，题为“老年男性BPH和MetS患者组织免疫表达IL-6和IL-18及其与脂质参数和肠道微生物衍生短链脂肪酸的关系”。近年来的研究表明，炎症是良性前列腺增生(BPH)发展的原因之一。炎症可能是由过去的感染、代谢紊乱引起的，但也可能是由肠道微生物群的功能状态引起的。在这项新的研究中，来自波兰波美拉尼亚医科大学和国立应用科学大学的研究人员Weronika Ratajczak, Maria Laszczyń
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呼吸新鲜空气可以让制造毒品的细胞活得更久
有氧合装置支持的细胞(左)和没有氧合装置支持的细胞(右)的并排比较。活细胞用绿色表示;死亡细胞是红色的。来源:Jonathan Rivnay/西北大学 2021年，美国西北大学(Northwestern university)领导的一个研究团队开始致力于开发一种可植入的“活药房”，
来源：medical Xpress
时间：2023-11-10
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研究表明，大脑的细胞外空间影响睡眠、运动和行为
来源:维基共享资源 大脑包含数十亿个神经细胞，控制着我们的思想、行为和运动。但事实上，大脑的20%对科学家来说是一个谜。这就是所谓的细胞外空间，也就是每个脑细胞周围的环境。这是一个围绕着神经元、神经胶质细胞和血管的微环境。这个空间作为交流的通道，允许多巴胺和蛋白质等物质在脑细胞之间
来源：medical Xpress
时间：2023-11-10
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《Cell》打破世界记录！报道“人造”生命的奇迹
生物学家已经培育出一种酵母菌，其基因组中超过50%是人工合成的DNA。标准酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)将其遗传蓝图存储在16条染色体上。在新的菌株中，这些染色体中的6.5条是在实验室中编辑和合成的，另外一条是用编辑过的酵母遗传密码片段拼接在一起的。这篇文章是有关一个从零开始构建真核合成基因组的项目——Sc2.0项目，该联盟15年来一直试图创造一种具有完全合成基因组的酵母菌株。。文章报告了一个重要里程碑的达成，即所有单独的Sc2.0染色体都已经被组装起来。接下来的步骤是巩固这些合成的染色体，这就是这篇文章的重点。今天发表在《Cell》和《Cell Genomics
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科学家发现了一种神秘的激素，可以使胰岛素发挥更好的作用
全球有超过5亿人患有糖尿病，约26亿人体重超标。这两组人都有一个共同的问题，那就是他们体内的胰岛素——一种至关重要的激素——与那些健康且保持正常体重的人相比，表现不佳。因此，了解影响人体内胰岛素活性的机制一直是科学家们关注的重点，目的是制定创新药物和治疗方法。在一项新的研究中，哥本哈根大学营养、运动和运动系(NEXS)的研究人员研究了GDF15如何影响啮齿动物的胰岛素敏感性。研究人员首次发现，GDF15实际上提高了小鼠和大鼠的敏感性，使它们更适合调节血糖，并在肌肉中吸收能量。该研究结果发表在著名的科学杂志《Cell Metabolism》上，增加了我们对GDF15的总体了解。研究人员发现，GD
来源：Cell Metabolism
时间：2023-11-09
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