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AlphaFold书写蛋白质结构图谱，挖掘到了惊人发现
研究人员挖掘了一个包含几乎所有已知蛋白质结构的数据库——使用谷歌DeepMind革命性的AlphaFold神经网络预测了超过2亿个条目。这项工作揭示了全新的形状，生命机制中令人惊讶的联系，以及几年前不可想象的其他见解。去年，谷歌DeepMind使用AlphaFold预测了几乎所有已知生物蛋白质的基因组数据结构，在AlphaFold数据库中积累了大约2.14亿个结构，该数据库由位于英国欣克斯顿的欧洲分子生物学实验室的欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)托管。结构的集群首尔国立大学(Seoul National University)的计算生物学家Martin Steinegger对绘制整个数
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《Nature》新干细胞能生成脊柱，可是会促进肿瘤转移
某些癌症，包括乳腺癌、前列腺癌和肺癌，优先向脊柱扩散，但原因尚不清楚。20世纪40年代的一种理论提出，咳嗽等强烈的事件可以暂时逆转血液流动，并将癌细胞震动到脊柱附近，在那里形成新的肿瘤。科学家们发现了一种新的干细胞，这种干细胞可以产生脊柱，并有助于推动乳腺癌肿瘤和其他癌症向脊柱的频繁转移。这项研究发表在9月13日的《自然》杂志上。“我们的研究推翻了现在医学院教授的经典教条”，纽约市威尔康奈尔医学院的病理学家、最新研究的合著者Matthew Greenblatt说。长出脊椎脊椎动物的脊椎是独一无二的，脊椎骨不携带一些通常被认为是骨骼特征的蛋白质。这些特征使Greenblatt和他的同事们怀疑它们
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癌症抑制剂的组合可以减缓肿瘤生长
一个国际研究小组已经证明，抑制剂的组合可以抑制肿瘤生长并防止某些癌症患者的复发，包括头颈部鳞状细胞癌和肺腺癌。他们的发现支持了针对这些癌症的创新治疗方法的未来发展。该团队的研究成果发表在2023年8月17日的《癌基因》杂志上。科学家们知道，在人类和其他哺乳动物中，Hippo信号通路在体内癌细胞快速增加的过程中起着关键作用。Yes-associated protein 1，简称YAP，是一种在调节肿瘤生长过程中起关键作用的蛋白，它在多种癌症的开始和扩散中起着重要作用。当Hippo通路失调时，它会触发YAP的激活，从而导致头颈部鳞状细胞癌。Hippo通路和YAP通路作为调控癌细胞特性的信号通路引起
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阻断这种蛋白可以切断结肠肿瘤的电源
通过周五发表在《细胞报告》上的研究结果，VCU梅西癌症中心的一组科学家发现了一种以前未知的蛋白质之间的相互作用，这种相互作用负责向肿瘤细胞提供能量，可能对未来结肠癌治疗的发展具有重要意义。“这项研究非常令人兴奋，因为我们可以利用这些发现来为梅西大学开发一种全新的抗癌药物提供信息，”研究作者Can Senkal博士说，他是梅西大学癌症生物学研究项目的成员，也是VCU医学院生物化学和分子生物学系的助理教授。潜在的答案在于一类被称为神经酰胺的脂肪化合物。神经酰胺调节许多重要的细胞功能，许多抗癌药物刺激神经酰胺的产生，以帮助抵御疾病。当神经酰胺的产生被切断时，癌细胞可以存活并更有效地生长。Senkal
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《PNAS》工程益生菌可以“感知”炎症性肠病
根据发表在《PNAS》上的一项研究，西北医学院的科学家们已经开发出一种能够检测炎症性肠病的工程益生菌。炎症性肠病(IBD)以胃肠道慢性炎症为特征，可导致持续腹泻、腹痛、体重减轻和消化系统永久性损伤。据美国疾病控制与预防中心(Centers for disease Control and Prevention)估计，大约有300万美国人患有炎症性肠病。目前，IBD是通过侵入性结肠镜检查来监测的，没有办法知道IBD何时会发作。这促使生物化学和分子遗传学以及化学和生物工程助理教授Arthur Prindle博士实验室的研究人员探索了检测这种疾病的合成生物学方法。该研究的资深作者Prindle说:“我
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SARS-CoV-2速效口服疫苗
牛津大学出版社发表在《Biology Methods and Protocols》上的一篇新论文表明，研究SARS-CoV-2的研究人员可能已经开发出口服疫苗的新方法，这种方法既容易接种，又能更有效地对抗疾病。中和病毒的最好方法是在病毒进入人体细胞之前，但只能在肺、鼻子和口腔上皮细胞的外表面产生粘液。一种被称为免疫球蛋白A的特殊抗体在粘液中起作用，可以使病毒失效。然而，针对特定病毒的特异性免疫球蛋白/抗体的产生必须首先通过接种疫苗来诱导。有效地快速产生免疫球蛋白A抗体的疫苗可以更好地预防疾病。由于冠状病毒和流感一样，会感染支气管细胞，研究人员认为，重要的是在粘膜中而不是在血液中诱导病毒抗原特异
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母乳中的某些蛋白质被发现对婴儿的肠道健康至关重要
哺乳动物经过3.2亿年的进化，使母乳适应了婴儿的所有生理需求:母乳不仅含有营养物质，还含有激素、抗菌剂、消化酶和生长因子。此外，母乳中的许多蛋白质，例如酪蛋白和乳脂球膜蛋白，不仅是能量和分子构建块的来源，而且还直接刺激免疫力，至少在临床前条件下是这样。同样，由细菌、古细菌和真菌组成的肠道微生物群在免疫系统的调节中起着至关重要的作用。这就提出了一种可能性，即母乳蛋白的免疫增强功能可能是双管齐下的:不仅通过直接刺激免疫系统，还通过间接调节肠道微生物的丰富程度，从而影响免疫力。现在，中国研究人员在《微生物学前沿》(Frontiers in Microbiology)上发表的一项研究首次发现了母乳蛋白
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金黄色葡萄球菌的遗传学见解
金黄色葡萄球菌是一种革兰氏阳性细菌，引起多种临床疾病。这种病原体引起的感染在社区获得性和医院获得性环境中都很常见。如果细菌进入血液，导致败血症，感染可能会危及生命。现在，由彼得·多尔蒂感染与免疫研究所领导的研究人员分析了1300多种葡萄球菌菌株的基因图谱，揭示了这种细菌进入血液后如此危险的原因。研究结果发表在《Cell Reports》的一篇题为“A statistical genomics framework to trace bacterial genomic predictors of clinical outcomes in Staphylococcus aureus bacterem
来源：Cell Reports
时间：2023-09-14
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吸烟与端粒衰老之间的关联
一项对近50万人的研究表明，吸烟缩短了我们免疫系统白细胞中染色体的末端片段。这些末端片段的长度，被称为端粒，是我们衰老的速度和细胞修复和再生能力的一个指标。杭州师范大学临床医学院助理教授、香港中文大学儿科系名誉博士后Siyu Dai博士在意大利米兰举行的欧洲呼吸学会国际大会上发表演讲时说:“我们的研究表明，吸烟状况和吸烟数量会导致白细胞端粒长度缩短，而白细胞端粒长度是组织自我修复的一个指标。再生和老化。换句话说，吸烟会加速衰老过程，而戒烟可能会大大降低相关风险。”端粒就像鞋带末端的塑料或金属鞘，可以防止鞋带磨损。它们是保护染色体末端的重复DNA序列的长度。细胞每分裂一次，端粒就会稍微变短一些，
来源：European Respiratory Society
时间：2023-09-14
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哈佛大学：COVID治疗比疾病更糟糕吗？
研究人员担心治疗可能会产生超级病毒COVID-19患者通常会服用抗病毒药物，通过减少体内循环的病毒颗粒数量来发挥作用。其中一种药物molnupiravir可以诱骗病毒产生突变，其中一些突变对病毒本身是致命的。这些突变最终压倒并摧毁了体内的SARS-CoV-2种群。由于molnupiravir通过诱导突变导致病毒死亡，一些人担心可能会无意中产生新的耐药病毒。像SARS-CoV-2这样的冠状病毒擅长变异成新的菌株，如Delta、奥密克戎和EG.5。一种药物可以帮助病毒变异，虽然以杀死病毒为目的，但这种想法让一些人感到担忧。包括哈佛大学数学和生物学教授Martin Nowak在内的一个研究小组以数学
来源：PLOS Biology
时间：2023-09-14
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乳腺癌的复发可能是由化疗对非癌细胞的损伤引起的
9月12日，美国埃默里大学的Ramya Ganesan及其同事在开放获取期刊《公共科学图书馆·生物学》上发表的一项新研究表明，一种标准的化疗药物会损伤周围的非癌细胞，然后唤醒休眠的癌细胞，促进癌症生长。这一发现对了解癌症复发很重要，并可能指出预防癌症的重要新靶点。包括化疗在内的癌症治疗的进步，大大降低了包括乳腺癌在内的多种癌症的死亡率。尽管如此，高达23%的乳腺癌患者在前五年内经历了复发。治疗的目的是杀死所有的癌细胞，但通常情况下，一些细胞进入休眠状态，在这种状态下，它们停止分裂，对化疗药物没有反应。当休眠细胞重新唤醒并开始再次分裂时，复发就会发生。一些研究表明，化疗本身可能促进休眠，但这种作
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微血管对阿尔茨海默病白质损伤的影响
“当血管功能障碍和ADNC同时发生时，介导白质实质小动脉功能障碍增强的分子机制仍然难以捉摸。”一篇新的社论论文发表在Aging(由MEDLINE/PubMed列为“Aging (Albany NY)”和“Aging- us”由Web of Science)第15卷，第16期，题为“微血管对阿尔茨海默病白质损伤的贡献”。在他们的新社论中，来自奥古斯塔大学的研究人员Zsolt Bagi, Larry S. Sherman和Stephen A. Back讨论了认知障碍和痴呆的机制。认知功能和执行功能的损伤是最近公认的血管性认知障碍和痴呆(VCID)的重要神经病理学表现。众所周知，高血压性脑血管病还涉
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研究发现大量饮酒与异位脂肪有关
过量饮酒会增加体内脂肪的沉积量吗?根据多种族动脉粥样硬化研究(MESA)的新发现，答案是肯定的。维克森林大学医学院的研究人员发现，大量饮酒与高水平的异位脂肪有关，异位脂肪指的是心脏、肝脏和肠道等器官周围的脂肪。这项研究发表在《美国心脏协会杂志》的网站上。“研究表明，过量饮酒对心脏健康不利，”医学博士、维克森林大学医学院内科学助理教授、该研究的主要作者理查德·卡兹布说。“心包脂肪或心脏周围的脂肪也与心血管疾病的风险增加有关，所以我们想更好地了解酒精摄入是如何导致这种风险的。”MESA于1999年启动，旨在研究亚临床心血管疾病的特征——在出现任何临床体征或症状之前检测到的心脏或血管紊乱——以及预测
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脑出血的风险似乎可以通过输血传播
发表于《美国医学会杂志》由卡罗林斯卡学院的研究人员领导的一项研究表明，自发性脑出血的可能原因可能通过输血传播。与此同时，任何人在接受捐赠的血液后都不太可能出现脑出血。自发性复发性脑出血的常见原因是血管疾病脑淀粉样血管病(CAA)，其中蛋白质沿着大脑的微小血管积聚。几项研究表明，CAA可以通过神经外科手术从一个人转移到另一个人，也可能是通过使用某种生长激素的治疗。受影响的个体很少卡罗林斯卡医学院(S?dersjukhuset)、瑞典卡罗林斯卡大学医院、丹麦哥本哈根大学、比利时鲁汶大学和其他机构的研究人员进行的一项新研究表明，接受供血者血液的患者，如果后来再次出现脑出血，那么他们自己患脑出血的可能
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加强血癌治疗和诊断的新见解
新加坡国立大学(NUS)新加坡癌症科学研究所(CSI Singapore)的研究人员进行的一项突破性研究揭示了组蛋白甲基转移酶NSD2及其表观遗传靶点PKCα在导致t(4;14)易位性多发性骨髓瘤(MM)(一种高风险的血癌亚型)更具侵袭性和耐药性中的重要作用。该研究由新加坡CSI高级首席研究员郑伟珠教授和新加坡CSI高级研究员俞宗舒博士领导。研究小组发现，NSD2通过激活PKCα引发糖酵解升高，导致过量乳酸的产生，从而加剧恶性肿瘤并破坏对免疫调节药物的反应。这些发现提出了改善骨髓瘤治疗的潜在靶点。治疗干预的目标骨髓瘤是第二常见的血癌，t(4;14)骨髓瘤占MM病例的15%至20%。与其他类型的
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墨西哥议会公开展出外星生物遗骸，全球首个承认外星生物存在国家
近日，墨西哥议会召开了一场备受关注的公开听证会，主题是与“不明异常现象”相关。在这场听证会上，墨西哥议会向外界展示了两具疑似来自外星的生物遗骸。这两具遗骸分别在秘鲁被发现，距今已有1800年和700年的历史。据观察，这些遗骸的头部异常细长，每只手仅有三根手指。同时，从对遗骸进行的DNA检测结果来看，它们并非属于人类。然而，对于这两具“外星生物”的真实性，一些观看听证会直播的民众表示怀疑。他们质疑遗骸的来源和完整性，并希望有更多的科学证据能够加以验证。尽管存在质疑声音，但墨西哥方面计划通过听证会推动相关立法工作，这也意味着墨西哥可能成为全球首个承认“外星生物”存在的国家。这一消息引起了全球的广泛
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Nature Cancer：蛋白-蛋白相互作用原来是癌细胞侵袭的关键
一种以前未知的分子靶点的发现激发了胶质母细胞瘤患者治疗上的突破，胶质母细胞瘤是最常见和侵袭性的脑癌。当人们听到“癌症”这个词时，他们通常会想到一个单一的肿块，但胶质母细胞瘤细胞也具有高度侵袭性，并且从中心肿块迅速扩散，因此很难完全根除。即使使用诸如替莫唑胺(一种被批准用于治疗胶质母细胞瘤的标准化疗药物)等目前的治疗方法，对替莫唑胺耐药的肿瘤也会在50%以上的患者中复发，其中不到1%的患者在诊断后存活10年。在《自然癌症》杂志上发表的一项研究中，病童医院(SickKids)的一个研究小组展示了一种新的潜在治疗胶质母细胞瘤的方法，称为设计肽（designer peptide，生物通注），它针对胶质
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前列腺癌模型中致癌突变重新连接生长信号
重点:PIP3/PI3K信号通路是我们细胞中最重要的信号通路之一，影响细胞的代谢和生长。它也是人类癌症中最常发生改变的途径之一。该研究所的研究表明，PI3K通路重塑是由过度激活的PI3K信号驱动的癌症的共同特征。在前列腺肿瘤模型中，研究小组发现了一种未知的激活因子，它驱动PI3K信号传导和癌症生长，这种激活因子既可以从需要的积极生长信号中释放，也可以从生长限制反馈控制中释放。这一知识确定了PI3K信号网络的新成分，这些成分代表了潜在的脆弱性和药物开发的靶标，以控制癌细胞的生长。重要的是，在重新连接的信号网络中发现的蛋白质在健康的前列腺组织中没有明显的作用，并且被认为只在肿瘤组织中特异性地驱动细
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人类脂质组揭示了健康、疾病和衰老的新指标
人类基因组测序有望在医学上掀起一场革命，但科学家们很快意识到，仅凭基因蓝图并不能展示人体的运作。这就需要了解蛋白质组——由我们的基因表达的所有蛋白质，它们构成了执行人体大部分功能的细胞机制。现在，另一组分子正在填补人类生理学的更多细节，这就是脂质组（lipidome）。脂类是一大类脂肪或油性小分子，包括甘油三酯、胆固醇、激素和一些维生素。在我们体内，它们构成细胞膜，充当细胞信使，并储存能量；它们在应对感染和调节新陈代谢方面也发挥着关键作用。我们的基因组基本上是稳定的。我们的蛋白质组虽然受到健康和环境的影响，但在很大程度上取决于基因编码。相比之下，脂质组是可以直接改变的，部分取决于我们吃了什么以
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免疫细胞分泌的microRNA战胜肥胖代谢缺陷
范德比尔特大学的研究人员已经证明，一组微RNA（一种调节基因表达的小片段RNA）在一种被称为巨噬细胞的免疫细胞中发挥作用，有助于防止肥胖的代谢缺陷。病理学、微生物学和免疫学助理教授、这项新研究的资深作者Heather Pua博士说：“我们必须了解肥胖的细胞和分子发病机理的细节，以最终设计治疗干预措施——在这种情况下，可以针对miRNA或它们影响的基因和信号通路。”Pua和她的团队对巨噬细胞很感兴趣，因为之前的研究发现它们是脂肪组织中最丰富的免疫细胞类型。Pua说：“在过去的20年里，有一些文献表明，免疫细胞在脂肪调节我们的代谢健康和对肥胖的反应中起着关键作用。我们的目标是试图了解免疫细胞是如何
来源：Cell Reports
时间：2023-09-13
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