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人工智能模型利用基因测序数据预测癌症的主要来源
丹娜-法伯癌症研究所的研究人员创造了一种基于人工智能的工具,该工具使用肿瘤基因测序数据来预测患者癌症的主要来源。这项发表在《自然医学》杂志上的研究表明,这种名为OncoNPC的预测工具可以帮助指导癌症的治疗,并改善难以诊断病例的结果。传统上,癌症的主要来源是通过标准化的诊断检查来诊断的,包括基于肿瘤活检细胞切片的放射学和病理学评估。在3-5%的癌症病例中,肿瘤的原始来源无法确定。在这些病例中,患者被诊断为原发性未知癌症(CUP),并且几乎没有治疗选择,因为大多数治疗方法都是针对特定类型的癌症批准的。Dana-Farber研究员和资深作者Alexander Gusev博士说:“这个患者群体的结果
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喝饮料增加患肾结石的风险
研究人员首次证明了添加糖摄入量增加与肾结石风险增加之间的联系。在北美,肾结石患者占总人口的7%至15%,而欧洲为5%至9%,亚洲为1%至5%。肾脏中这些令人痛苦的矿物质形成会引起强烈的不适,表现为剧烈疼痛、恶心、呕吐、发烧、发冷和尿血等症状。然而,与肾结石相关的问题不仅仅是生活质量下降。随着时间的推移,它们会导致感染、肾脏肿胀(即肾积水)、肾功能不全,甚至是终末期肾脏疾病。在某些危险人群中,患肾结石的可能性更高,包括成年男性、肥胖者和患有慢性腹泻、脱水、炎症性肠病、糖尿病或痛风的人。现在,《营养学前沿》(Frontiers in Nutrition)的一项研究首次表明,添加糖摄入量的增加可能应
来源:Frontiers in Nutrition
时间:2023-08-08
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中国原生热带植物成为抗肥胖潜力股
肥胖是各种生活方式疾病(如糖尿病和高血压)的主要危险因素,已在世界范围内普遍存在。由大阪城市大学人类生命与生态研究生院副教授Akiko Kojima领导的一个多机构研究小组在对抗肥胖方面取得了重大进展。该小组此前曾对中国海南岛的热带植物Mallotus furetianus (MFE)提取物对脂肪肝的预防作用进行过研究,但直到现在才完全了解MFE的抗肥胖作用及其机制。他们的研究结果发表在《Food Science & Nutrition》杂志上。利用肥胖小鼠模型,研究人员开始验证MFE提取物的抗肥胖作用,结果是显著的。MFE显著抑制了小鼠体重和脂肪组织重量的增加,肝脏和脂肪组织的形态也
来源:Food Science & Nutrition
时间:2023-08-08
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新见解 | RNA修饰如何促进胰腺癌
RNA分子的化学修饰,如m6A,可以严重影响基因表达,影响癌症发生和进展的各个方面。然而,尽管对信使RNA (mRNA)的m6A修饰的研究已经很广泛,但对其对lncrna的影响的探索,特别是在PDAC的背景下,相对有限。在《基因与疾病》杂志上发表的一项创新研究中,来自浙江大学医学院、杭州医学院人民医院和密西西比大学医学中心的研究小组采用甲基化RNA免疫沉淀(MeRIP)策略,揭示了m6a修饰的长链非编码RNA (lncRNA) LINC00901在促进胰腺导管腺癌(PDAC)细胞增殖、存活和侵袭中的作用。从而导致肿瘤生长。有趣的是,该研究表明m6A读取器蛋白YTHDF1负调控LINC00901
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Nature子刊:通过代谢循环,探索生命的起源
生命起源的一种可能是分子相互作用形成细胞状液滴的自发组织。这些分子物种将形成第一个自我复制的代谢循环,这在生物学中无处不在,在所有生物体中都很常见。根据这种模式,第一批生物分子需要通过缓慢而低效的过程聚集在一起。如此缓慢的星团形成似乎与生命的快速出现不相容。来自MPI-DS生命物质物理系的科学家们现在提出了另一种模型来解释这种星团的形成,从而解释形成生命所需的化学反应的快速发生。“为此,我们考虑了不同的分子,在一个简单的代谢循环中,每个物种产生下一个物种使用的化学物质,”该研究的第一作者Vincent Ouazan-Reboul说。“模型中唯一的元素是分子的催化活性,它们能够跟随它们产生和消耗
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研究人员发现雷诺综合征的遗传原因
伦敦玛丽皇后大学精密医疗研究所(PHURI)和柏林健康研究所(BIH)的研究人员已经确定了雷诺综合征的遗传原因。他们的研究结果发表在今天的《自然通讯》杂志上,可能会为雷诺氏症患者带来第一个有效的治疗方法。Raynaud’s phenomenon(RP)是一种影响血液循环的遗传性疾病。这是一种血管收缩疾病,意味着皮肤表面附近的小血管痉挛,会限制血液流动。雷诺氏症患者在寒冷或情绪紧张时,由于发作时血液流动不足,他们的手指和脚趾经常会疼痛,并伴有皮肤颜色的变化。在更严重的情况下,它会引起严重的疼痛或溃疡。大约2-5%的人口受到雷诺氏病的影响。尽管这是一种常见的疾病,但对它的研究还不够充分,对这种疾病
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Science子刊:酶的开关
光以许多不同的方式影响生物体:例如,植物的生长方向朝向太阳,而人类的昼夜节律是由日光控制的。这些过程总是涉及光感受器,光感受器是一种能感知不同颜色和光强度的蛋白质。酶活性增加了一万倍现在,格拉茨科技大学(TU Graz)的研究人员已经破译了一种高效光感受器的功能。他们的研究结果发表在《科学进展》杂志上。研究小组研究了一种在许多细菌中发现的二胍酸环化酶蛋白。它的酶功能调节了一种控制细菌生存方式的中心信使物质的产生。在黑暗中,这种蛋白质几乎完全不活跃,但一旦暴露在日光的蓝色成分中,它的酶活性就会迅速增加。格拉茨工业大学生物化学研究所光生化工作组负责人安德里亚斯·温克勒说:“这种蛋白质在光照下的酶活
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两项新研究揭示了产前类固醇的潜在风险
《英国医学杂志》发表的两项新研究调查了给有早产风险的妇女服用类固醇药物对婴儿的潜在健康风险。综上所述,这些结果强调了医生在考虑产前类固醇治疗时需要意识到潜在的风险并谨慎行事。早产的婴儿比足月出生的婴儿有更大的死亡风险和严重的并发症,如呼吸困难、脑出血和感染。这些问题往往越早出生越严重。众所周知,皮质类固醇有助于增加早产婴儿的存活率,减少健康问题。理想情况下,它们应该在怀孕34周之前和出生后大约一周内给予。但它们对儿童后期健康的影响还不太清楚,特别是在给药“不合时宜”和婴儿足月出生的情况下。两项研究开始填补这一知识空白。第一项研究基于台湾健康保险研究数据库(NHIRD)的数据,该数据库涵盖了20
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热带地区注意了:流感预测对全球三分之一人口不适用
宾州大学公园在气候温和的地区,如北美和欧洲,流感季节从秋天开始,在冬天达到高峰,在春天结束。虽然公共卫生官员通常认为流感在热带气候中也是季节性的,但宾夕法尼亚州立大学领导的一项新研究发现,越南流感病例中几乎没有重复模式的证据。研究结果表明,流感在整个热带地区可能是不可预测的,这对生活在热带地区的全球三分之一人口的病例预防和管理构成了重大挑战。“世界卫生组织估计,季节性流感每年在全球范围内导致多达65万人死于呼吸道疾病;这还不包括死于流感引起的心血管疾病的人数,”宾夕法尼亚州立大学NIH博士后学者Joseph Servadio说。“如果没有能力确定热带地区流行病发生的定期间隔,就不可能进行诸如安
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科学家发现纯数学和遗传学之间的惊人联系
一个由数学家、工程师、物理学家和医学科学家组成的跨学科团队发现了纯数学和遗传学之间令人惊讶的联系。这种联系揭示了中性突变的结构和生物体的进化。数论,研究正整数的性质,也许是最纯粹的数学形式。乍一看,它似乎过于抽象,无法应用于自然界。事实上,有影响力的美国数论学家Leonard Dickson写道:“感谢上帝,数论没有被任何应用所玷污。”然而,一次又一次,数论在科学和工程中发现了意想不到的应用,从(几乎)普遍遵循斐波那契序列的叶角,到基于质数分解的现代加密技术。现在,研究人员已经证明了数论和进化遗传学之间意想不到的联系。具体来说,来自牛津大学、哈佛大学、剑桥大学、古斯特大学、麻省理工学院、帝国理
来源:The Royal Society Interface
时间:2023-08-08
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Cell首次发现超级细菌进化,病毒也有责任
研究人员发现了一种以前未知的机制,细菌通过噬菌体分享它们的遗传物质。这些见解可以帮助科学家更好地了解细菌是如何快速适应和进化的,以及它们是如何变得更具毒性和对抗生素具有耐药性的。《Cell》是生物化学和分子生物学领域最著名的同行评议科学期刊之一。在今天发表的一项研究中,来自新加坡国立大学(NUS)和伦敦帝国理工学院的科学家发现了细菌传播基因的一种新方式,使它们的进化速度比以前所知的要快得多。由新加坡国立大学NUS Medicine微生物学与免疫学和传染病转化研究项目助理教授John Chen领导,这些见解可以帮助科学家更好地了解致病菌如何进化并变得越来越毒力和对抗生素的耐药性。共享遗传物质的能
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《Nature Aging》新发现可以延缓衰老和预防与年龄有关的疾病
弗吉尼亚大学医学院的研究人员发现了慢性炎症加速衰老的关键驱动因素。这一发现可以让我们放慢时钟的速度,活得更长、更健康,并可能让我们预防与年龄有关的疾病,如致命的心脏病和毁灭性的脑部疾病,这些疾病会夺走我们的能力。那么是什么导致了这种有害的炎症呢?答案是某些免疫细胞线粒体中的钙信号不正确。线粒体是所有细胞的发电机,它们严重依赖钙信号。 UVA健康团队在Bimal N. Desai博士的领导下,发现巨噬细胞(一种免疫细胞)中的线粒体随着年龄的增长而失去吸收和利用钙的能力。他们证明,这个问题会导致慢性炎症,导致许多与老
来源:Nature Aging
时间:2023-08-07
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Science新发现:饱腹感or防止肠道真菌感染?这种肠道激素有双重作用!
Peptide YY(PYY)是一种由肠道内分泌细胞产生的激素,众所周知它能控制食欲,但芝加哥大学的最新研究发现,它在维持哺乳动物消化系统中真菌的平衡方面也发挥着重要作用。在本周发表在《科学》杂志上的一项研究中,研究人员发现,小肠中被称为Paneth细胞的特殊免疫细胞表达一种PYY,这种PYY可以阻止真菌白色念珠菌转变成更致命的形式。人们已经知道,PYY是由肠道内分泌细胞产生的,是一种表示饱腹感的激素,或者是动物吃饱了的信号。新的研究表明,它还可以作为一种抗菌肽,选择性地允许白色念珠菌的共生酵母形式繁殖,同时控制其更危险的形式。该研究的资深作者、芝加哥大学教授 Eugene B. Chang
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Science肿瘤基因表达惊人的一对基因
路德维希癌症研究中心的一项研究已经确定了一对基因,其在肿瘤内的一种免疫细胞的表达可以预测癌症患者的预后,并且与肿瘤微环境中多种细胞类型参与的基因表达程序的庞大网络有关,这些网络控制着人类癌症。由Ludwig Lausanne的 Mikaël Pittet领导的研究人员在最新一期的《Science》杂志上报告说,肿瘤相关巨噬细胞中CXCL9基因表达较高的患者的临床结果远好于免疫细胞中SPP1基因表达较高的患者。他们发现,表达前者基因的巨噬细胞总是准备好攻击癌细胞,而表达SPP1的巨噬细胞则处于支持肿瘤生长的状态。然而,最有趣的是,当肿瘤微环境(TME)中CXCL9与SPP1的
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Nature Aging:加速脂肪组织老化的新机制
韩国研究人员发现了一种新的信号通路,可以促进与衰老有关的慢性代谢疾病。 浦项工科大学生命科学系教授金钟京(音译)和高丽大学生命科学系教授具承会(音译)、韩国基础科学研究院首席研究员黄金淑(音译)表示,发现了BCAA代谢途径因衰老而受损,导致脂肪细胞功能失调和慢性代谢紊乱的新机制。该研究结果发表在24日(英国伦敦当地时间)的《Nature Aging》杂志(IF=16.6)上。 脂肪细胞在控制能量代谢稳态中起着关键作用。这些细胞与前脂肪细胞和组成脂肪组织的各种免疫细胞一起经历细胞衰老。从这些细胞释放的衰老相关分泌表型(SASP)加速衰老并降低脂肪组织的功能。因此,脂肪在肝脏和
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异常有效的COVID-19抗体,可中和几乎所有已知的变体
研究人员从一名接种过COVID-19疫苗的SARS幸存者身上分离出了强效中和抗体,这种抗体对已知的sarbecovirus表现出了惊人的抵抗力。《Science Advances》杂志最新发表的一项研究报告称,发现了一种高效抗体,能够中和几乎所有已知的COVID-19病毒变体(包括欧米克隆)和其他可能导致未来疫情的强效动物冠状病毒。一个由杜克大学-新加坡国立大学医学院、新加坡国立大学、澳大利亚墨尔本大学和美国弗雷德·哈钦森癌症研究中心的科学家组成的国际团队进行了这项研究。他们从一名从SARS中康复并随后接种了COVID-19疫苗的患者的血液中提取抗体。之前的冠状病毒感染和随后的疫苗接种的这种独
来源:Science Advances
时间:2023-08-07
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Science:古代DNA揭示了非裔美国人的遗传谱系
研究人员将古代 DNA(aDNA)与 23andMe 基因数据库中的数据相结合,发现了 1774 年至 1850 年间在马里兰州卡托克廷炼铁炉工作的自由和受奴役非裔美国人的血统和遗传特征,其中包括4万多名在世的亲属。Fatima Jackson在一篇相关的文章中写道:“这项工作之所以具有开创性,是因为这项研究是由一个积极参与的非洲裔美国人当地社区发起的,研究结果的结构符合他们的需求、优先事项和更大的非洲裔美国人社区的情感。”“这是这类研究应该进行的方式,它为未来的研究提供了蓝图。”生活在美国的绝大多数黑人和/或非裔美国人都是1501年至1867年间被强行运往美国的数十万非洲奴隶的后裔。然而,由
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Nature Immunology发现T细胞在肿瘤暴露数小时内衰竭的特征
根据8月3日发表在《自然免疫学》上的一项研究,本应能够杀死癌细胞的免疫系统T细胞在遇到肿瘤的几个小时内就会功能失调或“耗尽”。范德比尔特大学医学中心血液学和肿瘤学部门医学助理教授Mary Philip博士说,这些令人惊讶的发现对旨在利用T细胞杀伤肿瘤能力的癌症免疫疗法有影响,它们挑战了关于T细胞如何耗尽的现有观点。“我们的想法是,暴露于抗原(如肿瘤或病原体)很长一段时间的T细胞一直在工作,然后在某个时候它们会逐渐消失。这就是‘疲惫’这个词的由来,”该研究的资深作者菲利普说。“我认为没有人预料到,在6到12小时内,T细胞会看起来功能失调或耗尽;这是一个非常快的时间窗口。”为了探索T细胞是如何耗尽
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打破限制:首次使用MicroED分析DNA晶体
在生物学中,功能和形态是紧密交织在一起的。要了解生物体如何生长、适应和繁殖,就需要了解它们的物理结构。因此,显微镜的变革力量贯穿了过去四个世纪的科学。显微镜,或显微镜使用领域,现在可以通过微晶体电子衍射或MicroED等技术揭示最微小的结构。MicroED不像光学显微镜那样让光穿过细胞,而是用电子流轰击晶体样品,以产生有关其原子结构的详细信息。亚利桑那州立大学化学工程副教授Brent Nannenga说:“开发这种方法是为了揭示或‘解决’蛋白质的结构。”然后研究人员开始将其应用于药物和小有机分子的化合物。然而,它还没有在核酸上得到证实,科学界一直在问它是否适用于DNA。”Nannenga和他的
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神奇细菌改变了身体对可卡因的渴望
根据2021年全国药物使用和健康调查,480万人(12岁及以上)报告在过去12个月内使用可卡因,24,486人死于过量使用可卡因。由于目前还没有fda批准的治疗可卡因使用障碍的药物,因此迫切需要开发治疗干预措施。在维克森林大学医学院的一项新的临床前研究中,科学家提供了第一个证据,证明肠道微生物群的变化对可卡因的使用和戒断后的渴望有显著影响。这项研究发表在《Neuropsychopharmacology》杂志的网络版上。“有可卡因使用障碍史的患者有很大的复发风险,而且没有有效的药物治疗来降低这种风险。因此,我们的研究考察了肠道微生物群如何随着时间的推移影响药物寻找,”维克森林大学医学院和维克森林
来源:Neuropsychopharmacology
时间:2023-08-07