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华裔牛人Nature Methods发布基因组编辑优化新技术
生物通报道 来自哈佛大学、麻省总医院的研究人员开发出了一项能推动基因组工程领域的新技术。这一技术可显著提高科学家们靶向特定缺陷基因，然后“编辑”它们，用健康DNA替代这一受损遗传密码的能力。这一重要的研究成果发布在《自然方法》（Nature Methods）。论文的通讯作者是哈佛大学化学及化学生物学教授，霍华德休斯医学研究所研究员David R. Liu。据称这位教授是一位从来没有做过博士后的年轻教授，他早年毕业于哈佛大学，1999年在加州大学伯克利校区攻读博士学位，在Peter Schultz教授指导下从事核糖核酸研究，并自主首次开始活细胞遗传密码的研究。之后就被哈佛大学任命为助
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李晓江：用CRISPR构建大型神经变性病动物模型
生物通报道：动物模型对于帮助我们了解神经退行性疾病的发病机制、并找到治疗方法，是非常有价值的。因为相比较啮齿动物来说，大型动物更接近于人类，它们为确定人类中所看到的重要病理事件，提供了很好的模型；大型动物对于验证有效的治疗方法或确定治疗靶标，也是非常重要的。由于缺乏来自大型动物的胚胎干细胞系，我们很难用传统的基因打靶技术，来构建神经退行性疾病的大型动物模型。近年来，CRISPR/Cas9已被成功应用于不同物种基因组的遗传修饰。最近，中科院遗传与发育生物学遗传研究所的李晓江博士，在国际学术期刊《Molecular Neurodegeneration》（影响因子6.563）发表综述文章，讨论了用C
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Nature：风口浪尖上的CRISPR基因编辑
生物通报道 “扯淡！”，这是哈佛医学院生物工程师Kevin Esvelt看到去年发表在《科学》（Science）杂志上的一篇研究论文时，口中冒出来的第一个词。这项研究工作描述利用一种基因编辑技术将突变插入到了果蝇中，并且这种突变可以传递给几乎所有的果蝇后代。尽管有趣，这份研究报告却让Esvelt感到不安：如果基因工程果蝇从实验室中逃出，突变有可能会在整个野生种群中迅速传播。但这却让加州大学欧文分校的分子生物学家Anthony James感到极为兴奋。他在给研究作者的信中写道：“天哪！我们能将之应用于蚊子吗？”7月30日，美国国家科学院(NAS)首次召开了一系列会议，旨在寻找一些方法
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BioTechniques：2015最受欢迎的技术文章
生物通报道：BioTechniques杂志日前评出了2015年最受欢迎的十篇技术文章，涵盖了对PCR、DNA提取、无细胞蛋白表达等常规技术的改良，以及CRISPR/Cas9、Hi-Plex、微图案化等新技术的应用。1. Visual detection of isothermal nucleic acid amplification using pH-sensitive dyes我们都曾在化学课上根据pH试纸的颜色判断过溶液的酸碱度。NEB公司的研究团队以同样的理念（基于pH值的颜色改变）为基础，开发了一种对pH敏感的变色染料，给DNA扩增赋予了肉眼可见的颜色改变。这一技术可以帮助人们直接用眼
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基因编辑技术成功精确修饰人类T细胞
科技日报华盛顿8月3日电 （记者何屹）美国加州大学旧金山分校的研究小组利用基因编辑技术CRISPR/Cas9精确修饰了人类T细胞。由于T细胞在人体免疫系统中作用十分重要，这一研究成果将为治疗糖尿病、艾滋病及癌症等提供全新的手段。CRISPR/Cas9是最新出现的一种由RNA指导的Cas9核酸酶对靶向基因进行编辑的技术。新的方法能使T细胞表面一种称为趋化因子受体CXCR4的蛋白质失去功能。这种蛋白可被艾滋病病毒利用感染T细胞，进而引发艾滋病。在癌症免疫疗法中，科学家发现，新方法还可成功关闭 PD-1分子，进而诱导T细胞攻击肿瘤。科学家对CRISPR/Cas9方法抱有极大的希望，因为其简单又不昂贵
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华人学者Cell子刊发表CRISPR重要成果
生物通报道：人类消化道中居住着大量的微生物，它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用。许多人类疾病都与微生物组失衡有关。科学家们正在尝试对肠道微生物进行基因工程改造，以实现各种各样的应用，比如调节肠道生态环境和治疗人类疾病。多形拟杆菌（Bacteroides thetaiotaomicron）是普遍存在于人类肠道微生物组的一种高丰度共生菌，很适合用来进行这类研究。不过，对非模式生物进行改造并不容易。遗传学元件的缺乏，使人难以构建复杂的多基因通路。日前，麻省理工的研究人员开发了可以改造多形拟杆菌的多种遗传学元件，包括组成型启动子、诱导型启动
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Cell：CRISPR解答细胞代谢谜题
生物通报道 众所周知，线粒体是我们细胞中的发电厂，它利用呼吸作用来释放我们食物中的能量，捕获三磷酸腺苷（ATP）分子中的能量。在发表于7月30日《细胞》（Cell）杂志上的两篇研究论文中，来自麻省理工学院的研究人员揭示出了增殖细胞，包括肿瘤细胞需要线粒体呼吸作用的原因。尽管有许多其他的途经可以生成ATP，得不到呼吸作用提供的电子受体细胞无法进行增殖。上接：两篇Cell文章揭示惊人发现：至关重要的氨基酸 在同期的Cell杂志上，麻省理工学院生物学教授、Whitehead研究所和Koch研究所成员David Sabatini报告称，他利用一种不同的方法确定了天冬氨酸和细胞呼吸作用之间的
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CRISPR技术牛人Science热议基因驱动技术
生物通报道：在7月出版的Science杂志上，几位著名的CRISPR技术研究人员发表了题为“Safeguarding gene drive experiments in the laboratory”的评述文章，探讨了以CRISPR为基础的基因驱动技术系统（gene drive systems，生物通译），指出在实验室中进行此种另类的转基因技术的时候，需要慎之又慎。 今年3月，科学界出现了一个传言，称中国学者已成功地编辑了人类胚胎的基因，以一种人类无法完成的方式改变了他们的DNA。当然这一说法并不全面，但是已经非常火热的CRISPR/Cas9 基因组编辑方法又一次被放到了舆论的最前沿，还有以其
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四川大学国际期刊发表CRISPR文章
生物通报道：工程重组核酸酶的进展，为基因组编辑提供了简便可靠的方法。特别是CRISPR/Cas9系统的发展，科学家们已经发现了各种版本的Cas9蛋白和传递载体，可将所需的突变导入基因组，以校正疾病相关的突变，或激活/抑制感兴趣的基因。表观遗传调控因子在癌细胞中经常受到干扰，对于正常细胞到癌细胞的转化是至关重要的。肿瘤相关的表观遗传学改变或表观遗传学因子突变，在致癌过程的各个步骤中起主要作用，并影响各种各样癌症相关基因和各种癌性表型。因此，表观遗传学调控酶可能是癌症治疗的候选靶点。最近，四川大学生物治疗国家重点实验室的陈崇研究员在国际学术期刊《Human Gene Therapy》发表一篇评论文
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检测CRISPR/Cas9脱靶效应的简单方法
生物通报道：CRISPR/Cas系统目前被广泛应用于各种研究中，而将来更有望用于临床，但脱靶效应的存在始终是个问题。七月二十四日，来自意大利国家研究委员会（Consiglio Nazionale delle Ricerche）和意大利人类临床和研究中心的研究人员，提出了一种基于荧光原位杂交（FISH）的简单策略，可让我们对一个给定质粒的非特异性整合进行检测和频率评估，相关研究结果发表在Nature旗下子刊《Scientific Reports》。CRISPR/Cas9系统是一种创新、特异而有效的基因编辑方法。然而，它应用于人类研究，还需要进一步调查其他基因位点的额外修饰（所谓的“脱靶”事件）。
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清华汪小我等人开发CRISPR sgRNA设计工具
生物通报道：CRISPR/Cas9系统，是最近开发的一种强大而灵活的靶向基因组工程技术，包括基因组编辑和基因调控。这些应用需要设计高效、特异的单向导RNA（sgRNA）。然而，这仍然是具有挑战性的，因为它需要考虑许多标准。已有研究开发出了一些sgRNA设计工具用于基因编辑，但是目前还没有设计出用于基因调控的sgRNA设计工具。延伸阅读：专家指南：CRISPR实验中如何选择sgRNA[心得点评]。七月二十三日，清华大学自动化系的汪小我和美国斯坦福大学的Lei S Qi博士带领的研究小组，在国际权威杂志《Bioinformatics》发表了题为“CRISPR-ERA: a comprehensiv
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CRISPR先驱重大成果：实现CRISPR/Cas9医学应用的重要一步
生物通报道 在由加州大学旧金山分校的研究人员牵头的一个研究项目中，科学家们设计出了一种新策略利用基因组编辑系统CRISPR/Cas9来精确改造人类T细胞。由于这些免疫系统细胞在糖尿病、艾滋病到癌症等广泛疾病中都发挥着重要作用，这一研究成果为开展T细胞功能研究提供了一个万能的新工具，并为开发出基于CRISPR/Cas9的疗法来治疗许多严重的健康问题提供了一条途径（延伸阅读：张锋参与Cell发布CRISPR重要新成果）。利用他们的新方法，科学家们能够使得T细胞表面的CXCR4蛋白丧失功能——HIV利用了这一蛋白来感染T细胞引起艾滋病。研究小组还成功地关闭了PD-1——这一蛋白在新兴的癌
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张锋参与Cell发布CRISPR重要新成果
生物通报道 一直以来研究人员都无法在哺乳动物细胞中实现高通量的靶向基因编辑，CRISPR-Cas9系统的应用标志着遗传筛查一个重大的突破。现在，来自哈佛-麻省理工Broad研究所的研究人员将这一筛查技术应用于小鼠骨髓源性树突状细胞，研究了PAMPs触发的免疫反应的调控机制。通过综合分析基因敲除结果及蛋白质和mRNA表达改变，他们利用CRISPR筛查以前所未有的分辨率剖析了免疫调控网络。这一重要的成果发布在7月16日的《细胞》（Cell）杂志上。哈佛-麻省理工Broad研究所的Aviv Regev博士和Nir Hacohen博士是这篇论文的共同资深作者。著名华人科学家、CRISPR-
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Cell：利用CRISPR-Cas9绘制广泛天然免疫网络图谱
生物通报道 来自哈佛-麻省理工Broad研究所的研究人员将CRISPR-Cas9筛查技术应用于小鼠骨髓源性树突状细胞，研究了PAMPs触发的免疫反应的调控机制。通过综合分析基因敲除结果及蛋白质和mRNA表达改变，他们利用CRISPR筛查以前所未有的分辨率剖析了免疫调控网络。这一重要的成果发布在7月16日的《细胞》（Cell）杂志上。上接：张锋参与Cell发布CRISPR重要新成果随后，研究人员基于它们对树突状细胞功能选择性标记物RNA和蛋白质表达的影响，对所有已知和新鉴别出的调控因子进行了赋值。除了已知的TLR信号调控因子，还鉴别出了由从前未发现与TNF调控或炎症基因表达相关的一些
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Cell Stem Cell：用CRISPR实现iPS细胞治疗
生物通报道 血友病的患者生活在一种永久的压力和焦虑状态中：他们的关节会过早的磨损，一旦出血便感觉好像永不会停止。他们的身体无法生成让血液凝固的凝血因子，因此任何的切割或擦伤不即刻予以处理都可以转变为急症（延伸阅读：Nature：超越CRISPR的基因组编辑新技术 ）。每5000名出生男婴中便有一人罹患血友病A，大约一半的重症病例都是由于确定的“染色体倒位”引起。在染色体倒位中，染色体上的碱基对顺序颠倒，因此基因无法正确表达，患者缺失凝血因子VIII (F8)基因，在健康人体中F8可引起血液凝结。由基础科学研究所基因组工程中心主任Jin-Soo Kim，和延世大学Dong-Wook
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Cell子刊：让CRISPR-Cas9基因编辑更廉价的简单技术
生物通报道 来自加州大学伯克利分校的研究人员发现了一种更廉价及简单的方法，让热门的基因编辑工具CRISPR-Cas9靶向切割或是标记DNA（延伸阅读：遗传学界大牛Nature子刊发布CRISPR-Cas9新工具）。自3年前发明这一技术以来，由于它能够很容易地结合并切割非常特异的DNA序列、失活基因，CRISPR-Cas9如暴风般横扫基因组学领域。这为靶向基因疗法治愈遗传疾病，及发现疾病的病因带来了巨大的希望。此外，还可以调整这一技术，借助于一种荧光标记结合及标记DNA，使得研究人员能够定位和追踪正在分裂的活体细胞细胞核中成千上万基因其中的某一基因。新开发的技术现在使得构建出让CRI
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中国农大权威期刊发表CRISPR研究
生物通报道：通过CRISPR/Cas9基因组编辑系统的组成型过量表达而产生的拟南芥突变体，通常在T1代是嵌合体。七月二十一日，来自中国农业大学的研究人员在国际生物学权威期刊《Genome Biology》发表的一项研究中，利用卵细胞特异性的启动子，来驱动Cas9的表达，并以很高的效率获得了多个靶基因的非嵌合性T1突变体。延伸阅读：首次用CRISPR编辑树木基因组。本文通讯作者是中国农业大学植物生理学与生物化学国家重点实验室的陈其军博士，其2002年在中国农业大学获博士学位，2004年9月起在中国农业大学生物学院从事教学及科研工作，主要研究方向为：植物非生物逆境胁迫反应重要基因挖掘及功能鉴定；高
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专家Science警告CRISPR等新技术的应用
生物通报道：7月24日Science杂志发文，警告新兴技术的应用需要更多监管，其中尤其提及了近期十分火热的CRISPR-Cas9技术在临床上的应用。文章作者是曾任前总统比尔克林顿生物伦理顾问委员的R. Alta Charo，这位来自威斯康星大学的伦理学家在今年Nature Biotechnology杂志的人类生殖细胞基因改造大讨论中就表示，对于生殖细胞或胚胎的研究，不可能达成国际统一的法律，因为各国的立法和监管架构本身就是不同的。但我们在一开始就是要引入公众探讨，并制定原则用以指导研究。在这篇题为“Yellow lights for emerging technologies”的文章中，她也指
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我科学家用CRISPR实现杨树定向诱变
生物通报道：最近，RNA引导的CRISPR/Cas基因组编辑，已被用于多种草本植物的基因组编辑。然而，该系统是否可用于木本植物的基因组编辑，仍然还是非常罕见的。今年六月份，美国乔治亚大学（UGA）的研究人员首次利用CRISPR/Cas基因编辑工具，修改杨属植物的基因组。他们的研究结果发表在植物学国际知名期刊《New Phytologist》，为更快速和更可靠的植物基因编辑，打开了大门。相关新闻：首次用CRISPR编辑树木基因组。七月二十日，来自西南大学、中科院西北高原生物研究所的科学家，在Nature子刊《Scientific Reports》发表的一项研究中，通过CRISPR/Cas系统实现
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一步生成条件性基因敲除小鼠ESC
生物通报道：最近发展的基因组编辑工具，包括转录激活因子样效应物核酸酶（TALENs）和CRISPR/Cas9，使我们能够通过诱导双链断裂（DSBs）的非同源末端连接（NHEJ）修复，快速而有效的敲除靶向基因。然而，这种方法不能进行必需基因的功能研究，这类研究通常采用的策略是基于Cre-LoxP系统的条件性基因敲除（cKO）。这就需要通过同源重组（HR）和诱导Cre重组酶表达，进行loxP位点的靶向整合（敲入）。Cre融合蛋白和人类雌激素受体ERT2的突变配体结合域，常用于4-羟基他莫昔芬（4OHT）对Cre重组酶活性的控制，4OHT可促进CreERT2从细胞质到细胞核的易位，在那里Cre可识别
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