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  • 细菌单细胞基因组学的湿实验室准备及自动化数据集去污染流程

    在微生物学领域,单细胞基因组学(Single-Cell Genomics, SCG)已经成为研究微生物基因组结构、多样性及进化过程的重要工具。这项技术的核心在于从单个细胞中提取基因组信息,从而避免传统宏基因组学中可能出现的基因片段拼接错误和污染问题。然而,由于单细胞基因组的构建过程中存在多种污染来源,包括实验操作中的生物污染和试剂污染,以及扩增过程中产生的非目标DNA序列,这些污染严重影响了单细胞基因组数据的质量。因此,开发一种高效的、可重复的单细胞基因组数据去污染方法显得尤为重要。本研究提出了一种适应性强且通用的单细胞基因组数据去污染流程,名为SINgle-CEll REads Decont

    来源:Methods in Ecology and Evolution

    时间:2025-10-26

  • 一种基于连通性的算法,用于从地面激光扫描数据中分离木材和树叶

    树木的三维结构在调节其关键生态功能方面发挥着重要作用,包括光截获、资源输送和结构稳定性。近年来,随着激光雷达技术(TLS)的发展,我们能够以更高的精度捕捉森林中树木的结构信息,这使得TLS成为量化树木三维结构的有力工具。然而,树木木质部分与叶片的分离仍然是TLS用于大型研究的重要瓶颈,这限制了其在树木结构量化中的广泛应用。为了解决这一问题,本研究提出了一种基于连通性的木质部分与叶片分离算法(CWLS),通过几何分类与连通性分析相结合,实现了对木质点的高精度提取。研究团队对来自中国东部六个不同森林样地的55棵树进行了TLS数据采集,这些样地涵盖了从寒温带到热带的广泛纬度梯度,其中包括温带混交林、

    来源:Methods in Ecology and Evolution

    时间:2025-10-26

  • 水文恢复与北方林业排水泥炭地植被群落恢复之间的关系

    在森林砍伐导致的寒带泥炭地恢复过程中,水位的变化对植被恢复具有重要影响。泥炭地作为独特的生态系统,不仅承载着丰富的生物多样性,还在水调节、碳储存等生态系统服务方面发挥着关键作用。然而,当前全球约15%的泥炭地面积已退化,因此生态恢复成为改善泥炭地生态系统功能和生物多样性的关键手段。尽管恢复措施通常能够提升生物多样性,但不同泥炭地类型之间的恢复效果存在显著差异,且同一类型内部的恢复效果也可能不一致。此外,恢复后的监测时间往往较短,通常仅持续几年,这使得识别影响恢复效果的关键因素变得尤为重要。本研究聚焦于芬兰的寒带泥炭地恢复项目,通过长期的“前后对照-影响”实验,分析了水位变化与植被恢复之间的关系

    来源:Journal of Applied Ecology

    时间:2025-10-26

  • 通过模拟质子介导的突触信号,实现了超低功耗的基于肽的忆阻器

    人工智能时代的到来,推动了计算技术在多个领域中的广泛应用,包括自动驾驶、金融分析以及医疗诊断等。随着这些技术的快速发展,其市场价值也在指数级增长。然而,传统计算架构存在明显的局限性,尤其是由于内存与处理单元之间的物理分离,导致数据传输过程中耗能巨大,效率低下。相比之下,人类大脑以其卓越的能量效率成为仿生计算的灵感来源。大脑由约860亿个神经元和100万亿个突触组成,能够存储高达2.5 petabytes 的信息,并在极低的功耗(仅约20瓦)下实现每秒数百万亿次的运算。因此,开发模仿大脑结构和功能的神经形态计算系统,成为提高计算效率和降低能耗的重要研究方向。在神经形态计算系统中,忆阻器因其高集成

    来源:Small Methods

    时间:2025-10-26

  • 综述:企业生物多样性报告可借助人工智能和地球观测技术实现规模化——但若无保护科学家的指导将失去意义

    摘要新型生物多样性和生态系统报告框架要求企业在时空维度上收集对复杂生态系统的多层面影响数据,但未提供明确的操作指南。人工智能(AI)和地球观测(EO)作为强大工具,可提升报告效率与可操作性。然而,企业要在改善自然状态中发挥关键作用,亟需科学界指导以确立有意义且可规模化的指标,负责任地将AI驱动的EO技术融入报告流程,并赋能报告人才队伍。1 引言2022年通过的《昆明-蒙特利尔全球生物多样性框架》(GBF)明确认可企业在遏制自然衰退中的重要作用,鼓励其披露对生物多样性的风险、依赖性和影响。欧盟《企业可持续发展报告指令》(CSRD)进一步将强制性报告范围扩大至数万家企业,与自愿性框架如《自然相关财

    来源:Conservation Letters

    时间:2025-10-26

  • 油菜(Brassica napus)中抗核盘菌茎腐病和叶绿素稳定性的基因组位点:将全基因组关联研究(GWAS)与微生物组信息相结合

    油菜(*Brassica napus*)是一种重要的经济作物,其种子富含蛋白质和油脂,广泛应用于食品、饲料以及工业领域。然而,油菜面临多种病害的威胁,其中“茎腐病”(Sclerotinia Stem Rot, SSR)尤为严重。SSR由一种名为*Sclerotinia sclerotiorum*的真菌引起,广泛分布于全球主要油菜种植区,对油菜的产量和品质造成显著影响。由于该病害的广泛传播性和严重的危害性,研究其遗传机制和微生物组成对于开发抗病品种和实现可持续防控具有重要意义。本文通过基因组关联分析(GWAS)和微生物组研究,揭示了油菜抗SSR的遗传基础和微生物群落的组成差异,为油菜病害防控提供

    来源:Plant-Environment Interactions

    时间:2025-10-26

  • 红松鼠的妊娠期长度不会受到母体特征、一窝幼崽的数量或未来食物可获得性的影响

    在哺乳动物的繁殖过程中,妊娠期的长度是一个至关重要的因素,它不仅决定了后代的出生时间,还影响着母体的能量分配和生存策略。然而,尽管已有大量研究关注繁殖时间的调控,对同一物种内部妊娠期长度变化的驱动因素却鲜有系统探讨,这主要是因为野外哺乳动物的妊娠期数据获取较为困难。本研究以加拿大育空地区北美的红松鼠(*Tamiasciurus hudsonicus*)为对象,利用27年的配种与分娩数据,探讨了影响其妊娠期长度的潜在因素。红松鼠作为一种小型哺乳动物,其繁殖行为与环境条件密切相关,尤其是在食物供应的波动方面。例如,它们的繁殖活动往往与白松(*Picea glauca*)的种子丰收周期同步,这种周期

    来源:Canadian Journal of Zoology

    时间:2025-10-26

  • 东部和西部金冠戴菊种群之间的遗传差异是否与环境变化有关?

    本研究聚焦于广泛分布的物种——金冠山雀(*Regulus satrapa* Lichtenstein, 1823)的遗传多样性与生态环境之间的关系。金冠山雀是一种分布于北美和中美洲的鸣禽,其种群在地理分布上呈现出显著的分化特征。通过对东部和西部种群进行基因组分析,研究者发现这两个群体之间存在明显的遗传差异,这一现象与先前的遗传学研究结果一致。然而,这种遗传分化并非完全由生态环境驱动,而是受到地理隔离以及历史气候变化事件的深远影响。金冠山雀的分布范围横跨北美大陆,其栖息地类型也因地理位置的不同而有所差异。在西部,金冠山雀主要栖息于温带雨林,这些地区通常具有较高的年降水量和较为温和的冬季气候。而在

    来源:Canadian Journal of Zoology

    时间:2025-10-26

  • 一种以个体为中心、结合遗传因素的方法,用于研究青少年在面对社区不利条件时的多领域韧性

    在当前的研究中,科学家们关注的是青少年群体在面对社区不利环境时的韧性表现。社区不利,如贫困、教育资源匮乏和犯罪率高,往往与较差的心理健康、学术表现和社会功能相关联。然而,许多青少年在这样的环境中仍然表现出积极的行为和心理状态,这种能力被称为韧性。研究韧性不仅有助于理解个体如何应对压力,也为开发有效的干预措施提供了基础。过去的研究多将韧性视为在中度到重度压力下缺乏心理问题的表现,但近年来,理论和实证研究强调韧性应涵盖两个方面:一是缺乏负面心理状态,二是展现出积极的功能。这种多维的韧性概念揭示了个体可能在某些领域表现出韧性,而在其他领域则缺乏。例如,一个青少年可能在社交方面表现出较强的韧性,但在心

    来源:Journal of Child Psychology and Psychiatry

    时间:2025-10-26

  • SpiderATLAS:巴西大西洋森林中蜘蛛特征与分布的数据库

    蜘蛛作为地球上数量最多的节肢动物捕食者之一,在生态系统中扮演着重要角色。它们不仅通过捕食控制害虫数量,还在营养循环和生物多样性维持中发挥关键作用。然而,尽管蜘蛛的生态价值被广泛认可,目前关于其地理分布和物种特征的知识仍存在显著不足。这种知识的缺失被称为“墙外效应”(Wallacean shortfall)和“Raunkiæran shortfall”,分别指对地理分布和物种特性的了解不足。特别是在全球南方地区,这种信息缺口更为明显,给研究人员在大尺度上探讨蜘蛛如何响应环境变化及其对生态系统的影响带来了挑战。为了解决这一问题,SpiderATLAS 项目应运而生,旨在通过整合宏生态学、生物地理学

    来源:Journal of Biogeography

    时间:2025-10-26

  • 用于生态恢复项目的长期监测策略,采用空间平衡的轮换面板设计

    生态恢复是确保生态系统扰动不会永久存在的重要过程,尤其在应对气候变化、生物多样性下降、生态系统完整性以及社会和经济需求方面具有关键作用。随着人类活动的增加,生态恢复的需求也在不断上升,因此,如何有效地监测生态恢复的效果成为了一个重要的研究课题。监测方案对于不同利益相关方来说至关重要,它不仅有助于遵守法规要求,还能评估现场表现并为决策管理提供信息支持。然而,由于现场调查的物流限制,设计能够覆盖多个地点或大面积区域的采样策略对于提升监测方案的效率和准确性显得尤为重要。为了应对这些挑战,研究人员提出了一种基于空间平衡的旋转面板采样设计,这种设计可以确保在不同时间点的采样过程中,样本在空间上具有良好的

    来源:Ecological Solutions and Evidence

    时间:2025-10-26

  • 在变暖且日益分裂的世界中生存:蜥蜴物种Gonatodes humeralis的长期种群动态

    气候变化对物种生存构成重大挑战,但热带蜥蜴种群的长期影响仍缺乏系统研究。尽管已有研究对气候变化可能带来的后果提出了多种预测,一些学者认为温度上升可能导致物种灭绝风险显著增加,而另一些则认为热带环境中的物种可能展现出更强的适应能力。为了填补这一研究空白,本研究对亚马逊中心东部地区的一种蜥蜴——*Gonatodes humeralis* 进行了长期监测,分析了其种群动态变化,并探讨了温度升高和栖息地质量如何影响其种群增长速率。通过2001年和2021年的两次调查,研究团队在24个采样点(每个采样点包含1000米的调查路径)中对*G. humeralis*的种群数量进行了统计,发现该物种在20年间的

    来源:Austral Ecology

    时间:2025-10-26

  • 结构特征是否支持对草原树木种类的可靠分类?来自近距离摄影测量数据的见解

    摘要 了解结构特征是否能够可靠地反映物种身份对于推进自动化树木分类至关重要,尤其是在像西苏丹稀树草原这样复杂且易受干扰的生态系统中。在这项研究中,我们评估了17种结构特征的生态一致性和分类区分能力,这些特征涵盖了树冠、树枝以及整棵树的组成部分,数据来源于对五种主要稀树草原树种的近距离摄影测量点云。我们采用基于“特征概率密度”(TPD)框架的特征分析方法,通过功能丰富度(FRic)和特征间的重叠程度来量化种内与种间的变异。我们计算了一个综合得分,根据这些指标对特征进行排序,以评估它们的物种区分潜力。通过对综合得分进行方差分析(ANO

    来源:African Journal of Ecology

    时间:2025-10-26

  • 具有分子印迹珠的功能化不对称PVC膜,用于四溴双酚A(TBBPA)的电位传感

    开发了一种新型电位传感器,该传感器基于嵌入非对称膜结构中的分子印迹聚合物(MIP)珠子,用于痕量检测四溴双酚A(TBBPA),这是一种广泛使用的溴化阻燃剂和持久性环境污染物。该传感器的制作方法是将TBBPA印迹珠子掺入用邻苯二甲酸二辛酯(DOP)增塑的聚氯乙烯(PVC)膜中,然后将其滴涂在经过还原氧化石墨烯(rGO)改性的丝网印刷电极上。这种非对称设计具有表面富集的离子交换层,能够增强脱质子化TBBPA在膜界面处的积累。在优化条件下,传感器在5.0 × 10−6至10−3 M的线性范围内表现出接近Nernstian的斜率(−56.6 ± 1.2 mV/d

    来源:Environmental Science: Nano

    时间:2025-10-26

  • 在酸性高地土壤中,无论是否施用秸秆,用于降低全球变暖潜力的最佳石灰材料

    土壤酸化是农业生态系统中一个普遍存在的问题,主要由过量施用化肥,特别是氮肥,导致土壤pH值下降。为应对这一问题,农业实践中常采用石灰改良和秸秆还田等措施,以提升土壤肥力并缓解酸化现象。然而,这些措施对温室气体(GHG)排放的影响,尤其是不同类型的石灰材料与秸秆的相互作用,尚缺乏深入研究。本研究通过在酸性红壤中进行培养实验,探讨了不同石灰材料及其与秸秆结合使用对氮氧化物(N₂O)和二氧化碳(CO₂)排放的影响,为可持续农业实践提供了科学依据。在没有秸秆的情况下,石灰的施用显著增加了N₂O的排放,增幅在20.3%至78.2%之间,其中氢氧化钙(Ca(OH)₂)的影响最为显著。相比之下,碳酸钙(Ca

    来源:Environmental Science: Processes & Impacts

    时间:2025-10-26

  • 环形圆柱形氧化流反应器:用于气固处理研究的流体动力学特性分析与验证

    氧化流反应器(OFRs)是模拟大气中气溶胶老化过程的重要工具,然而传统的层流设计常因氧化剂暴露不均匀、停留时间分布(RTD)较宽以及显著的壁面损失而受到限制,这些因素阻碍了它们在模拟真实大气中气-粒相互作用过程中的应用。为了解决这些问题,本文提出了一种新型的环形圆柱氧化流反应器(AC-OFR),该反应器采用了优化的环形流几何结构,结合计算流体力学(CFD)模拟和全因子实验设计,实现了气体和颗粒物停留时间分布接近理想活塞流,同时显著减少了死体积和回流区域。实验结果表明,AC-OFR在臭氧、二氧化硫和颗粒物(50–800 nm)的传输效率高达50%至80%,且具有较强的气-粒耦合特性与较低的壁面损

    来源:Environmental Science: Processes & Impacts

    时间:2025-10-26

  • 地中海浮游生物图像数据集MedPlanktonSet:推动机器学习与生态研究的新资源

    浮游生物是海洋生态系统的基石,它们支撑着渔业资源,驱动碳固定和营养循环,却因气候变化和污染面临严峻威胁。传统浮游生物监测依赖显微镜观察,虽精度高却耗时费力,难以捕捉短时动态变化;分子技术能发现稀有物种,但定量困难且依赖数据库完整性。这些局限催生了浮游生物成像技术的兴起,其中成像流式细胞仪(IFCB)可自动采集高分辨率图像,实现高频监测。然而,IFCB每秒产生海量图像,人工分类已成瓶颈——训练一个有效的机器学习分类器需每类至少千张图像,且需专家耗时标注。更棘手的是,现有公开标注数据集多集中于北大西洋或波罗的海,地中海作为生物多样性热点区域竟无覆盖!为此,意大利安东·多恩动物站的研究团队开展了Me

    来源:Scientific Data

    时间:2025-10-26

  • 南非东开普省西方蜜蜂分布、生物学与生态学及其对养蜂业可持续发展的启示

    在南非东开普省的辽阔土地上,两种独特的蜜蜂亚种——撒瓦纳蜜蜂(Apis mellifera scutellata)与海角蜜蜂(Apis mellifera capensis)——与它们的杂交后代共同构成了一道独特的生态景观。这片区域不仅是南非唯一同时存在这三种蜂群的省份,还拥有包括奥尔巴尼生物多样性热点在内的丰富植被类型,为蜜蜂提供了充足的蜜源和花粉资源。然而,尽管养蜂业具有巨大的经济潜力,能够通过生产蜂蜜、蜂蜡等产品促进收入增长和贫困缓解,但由于养殖者缺乏对蜜蜂生物学和生态学的深入了解,加上病虫害的潜在威胁,这一产业的潜力远未得到充分开发。更严峻的是,A. m. capensis具有社会性寄

    来源:International Journal of Tropical Insect Science

    时间:2025-10-26

  • 仅功能特征分布可能无法预测无脊椎动物群落对溪流流域清理行为的响应

    摘要30%,共8条)和低干扰程度组(<30%,共8条),收集了其中的无脊椎动物,并检测了它们之间的物理化学相关性。根据现有文献,我们将无脊椎动物特征与溪流量和摄食方式进行了关联。高干扰程度和低干扰程度流域之间的分类组成存在差异,这与营养物质浓度、电导率和水深的差异有关。组成的差异与无脊椎动物对土地利用方式的响应有关,但与摄食和流量相关的特征并不能充分预测它们对地貌扰动的响应。尽管分类特征能够预测对农业扰动的响应,但它们在预测泛化特征(如杂食性和栖息地适应性)的普遍程度方面表现不佳。泛化生存方式可能隐藏在无脊椎动物特征响应的缺失之中。特征数据库需要找到方法,将杂食性和栖息地适应性定义为固定特征,

    来源:Hydrobiologia

    时间:2025-10-26

  • 利用物种分布模型预测欧洲常见野生哺乳动物分布:现有出现数据是否充足?

    在人类疾病和牲畜疾病中,超过60%的人类疾病和75%的牲畜疾病与多宿主野生动物疾病相关。理解这些疾病的风险和管理方法,关键在于了解分布广泛且常见的野生动物物种,因为它们是疾病维持的主要驱动因素。然而令人意外的是,即使是常见物种,其分布和数量也存在着巨大的不确定性。以英国相对完善的哺乳动物生物多样性调查为例,鼹鼠(Talpa europaea)、田鼠(Microtus agrestis)和兔子(Oryctolagus cuniculus)等常见物种的种群规模仍存在很大不确定性,这表明欧洲其他地区的调查情况可能更加不理想。欧洲食品安全局(EFSA)于2017年启动了ENETWILD项目,旨在审查可

    来源:European Journal of Wildlife Research

    时间:2025-10-26


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