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Nature子刊:TALEN/CRISPR介导的新型替代基因敲入技术
生物通报道 来自广岛大学的专任讲师Tetsushi Sakuma、Takashi Yamamoto教授,专任副教授Ken-Ichi T Suzuki及同事们在《Nature Protocols》杂志上,报告了一种利用基因组编辑技术的替代基因敲入方法的精简实验方案。这一创新方法被称作为PITCh系统(精确整合到靶染色体,Precise Integration into Target Chromosome)。基因敲入是通过用一种基因替换另一种基因,以便在体内测定它们是否具有相同的功能,或将正常基因引入基因组中置换突变基因以达到靶向基因治疗目的的技术。基因敲入通常是通过共同导入可编程核酸
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华人学者Nature综述:超越基因组编辑的CRISPR–Cas9
生物通报道:细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争,为此它们演化出了多种防御机制,CRISPR–Cas9适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合,可以在引导RNA的指引下,靶标并切割入侵者的遗传物质。2012年研究者们利用这一特点,将CRISPR系统制成了强大的基因组编辑工具。该系统使用简单而且扩展性强,很快便受到了研究者们的广泛欢迎。近年来,CRISPR技术如风暴一般席卷了生物学领域,它本身也在不断的更新换代。现在,CRISPR–Cas9系统已经不只是简单的基因组编辑工具。日前,斯坦福大学的齐磊(Lei Stanley Qi)和加州大学旧金山分校的W
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中山大学黄军就入选Nature 2015年度十大科学人物
生物通报道 科学领域充斥着各种大起大落,就像一次次惊心动魄的过山车。日前,Nature杂志展开了本年度的年终大盘点,选出了十位举足轻重的科学人物。中山大学副教授黄军就(Junjiu Huang)与著名华人女科学家鲍哲楠(Zhenan Bao)位列其中。黄军就:胚胎编辑者一位谦逊的生物学家因一项编辑人类胚胎基因的实验而引发了全球争论。今年4月,黄军就发布了世界上首个采用基因编辑改造人类胚胎的研究报告(延伸阅读:Nature:中国科学家用CRISPR/Cas9改造人类胚胎 )。这一新闻让基因编辑技术的迅速发展成为了公众注意的中心,并引发了在合乎伦理道德的范围内使用这类工具的巨大争论。但
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Science杂志2015年度热门:基因编辑
生物通报道:本周四,一项称为CRISPR的基因编辑技术,由于其彻底改革健康和医学领域的潜力,被国际著名期刊Science评选为2015年度热门性的技术突破。相关阅读:2015年Science十大科学突破公布。这项技术已引起了很大的争议,尤其是,在今年早些时候,中国的研究人员宣布,他们对来自生育诊所的不能存活的人类胚胎进行了基因编辑。全球科学家们对“这类研究——以及改变人类以促进某些理想性状的前景”表示担忧,从而敦促研究人员应该避免干扰妊娠期胚胎,因为这种技术可以永久性地改变人类的基因,并且会世代相传下去,将来可能会出现意料不到的后果。科学杂志说:但是,与其他基因组编辑技术相比,CRISPR具有
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刘小乐教授:CRISPR高通量筛选的新算法
生物通报道:高通量的CRISPR筛选,已在功能基因组学研究中显示出巨大的潜力。12月16日,华人女学者、哈佛大学公共卫生学院Dana-Farber癌症研究所的刘小乐教授,在国际著名学术期刊《Genome Biology》发表题为“Quality control, modeling, and visualization of CRISPR screens with MAGeCK-VISPR”的学术研究论文,为CRISPR筛选提出了一套综合质控(QC)、分析和可视化的工作流程——MAGeCK-VISPR。延伸阅读:刘小乐教授连发多项研究成果。CRISPR/Cas9系统是一种强大的遗传工程技术,可让
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Science十大科学突破 CRISPR登榜首
生物通报道:每年年底,Science杂志都会评选出十大科学突破。本周(12月17日)Science杂志公布了该刊评选出的2015年度十大科学进展,今年的Science十大科学突破之首是红得发紫的CRISPR基因编辑技术,这也是继2013年CRISPR技术荣登Science十大科学突破榜单后的第二次上榜,也是首个后来居上的科学突破,对此Science表示“前所未有”。 之所以CRISPR技术如此受热捧,这与今年该领域取得的多项突破密切相关,这些突破包括:CRISPR精确广泛遗传改变——今年10月,哈佛大学等处的研究人员在猪细胞中应用CRISPR编辑方法破坏了猪基因组62个位点的潜在有害DNA序列
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2015年度回顾:CRISPR技术兴旺发展
生物通报道 早在2年前CRISPR就位列《科学家》(The Scientist)杂志突破进展的名单之中,今年因为这一基因编辑技术在改良和应用方面取得的一些新进展,其再度入选。今年,报道的进展包括有利用CRISPR来编辑表观基因组;发现适合装入到病毒载体中实现高效体内基因组改造的更小的Cas9蛋白;发现了4个可以扩展基因编辑工具箱的新cas蛋白;设计出了一种不那么紧密结合错配DNA的改良Cas9等。但今年最大的新闻是有关这一技术的应用方面——它在编辑人类生殖细胞中的应用(延伸阅读:张锋Cell子刊:第二类CRISPR-Cas基因组编辑系统 )。4月,中国中山大学的研究人员在《Prot
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PNAS:CRISPR协助细胞对抗HIV
生物通报道:宿主细胞在面对病毒感染的时候,会表达一系列对抗病毒的蛋白,这些蛋白被称为宿主限制因子。哺乳动物细胞编码的限制因子,可以限制HIV-1和其他病毒的复制。不过,被病毒感染的细胞往往不表达这样的限制因子。人们普遍认为,诱导宿主限制因子的表达是抑制病毒复制的一个潜在途径。杜克大学的Bryan R. Culle领导研究团队在CRISPR/Cas9的基础上构建了转录激活子,成功让人类细胞表达了自己缺乏的限制因子(A3G和A3B)。这项研究发表在十二月十四日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争,为此它们演化出了多种防御机制,CRISPR/Cas适应性免疫系统就是
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中国农大特聘教授发表CRISPR文章
生物通报道:2015年12月10日,中国农业大学特聘教授韩建永带领的研究小组,以Letter的形式在《Protein & Cell》杂志上发表题为“Highly efficient generation of biallelic reporter gene knock-in mice via CRISPR-mediated genome editing of ESCs”的学术研究成果。在这项研究中,研究人员提出了一种方法,通过用CRISPR技术对胚胎干细胞进行基因组编辑,高效地产生双等位基因报告基因敲入小鼠。这项研究的通讯作者韩建永教授,为中国农业大学生物学院拔尖人才、特聘教授、博士生
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张锋发表Nature综述文章:聚焦CRISPR–Cas系统应用
生物通报道 麻省理工学院的张锋(Feng Zhang)博士是近两年大热的CRISPR/Cas9技术的先驱开创者之一。2013年,这位80后的年轻华人科学家开发出了可用来编辑DNA、敲除指定基因的CRISPR/Cas系统,自此之后一直致力于推动这一技术走向完美(延伸阅读:张锋Science重大突破:攻克CRISPR-Cas9基因组编辑的主要障碍 )。12月10日,张锋博士在《自然综述神经科学》(Nature Reviews Neuroscience)杂志上发表了一篇题为“Applications of CRISPR–Cas systems in neuroscience”综述文章,介
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用CRISPR给动物“改头换面”
生物通报道:CRISPR-Cas9基因编辑技术的简单性,将很快使任何生物(从最简单的黏菌到章鱼)的基因研究,变得像现在标准的实验室动物(如线虫、果蝇、青蛙和小鼠)那样容易。延伸阅读:西南大学将CRISPR用于鱼类遗传学研究。12月10日,在《Current Biology》杂志发表一项新研究中,加州大学伯克利分校的研究人员用CRISPR-Cas9,很容易地敲除了一种端足目(Amphipod)节肢动物(crustaceans)的基因,以了解这些基因如何控制生长和发育。研究人员想知道,哪些基因控制着端足目动物每一节段上附肢的发育,这种动物的身体就像一把瑞士军刀,身体每一节段都承载有不同的刀片或工具
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深挖CRISPR的治疗潜力
生物通报道:CRISPR-Cas9是细菌在漫长的进化史中演化出的重要防御机制。这个监控体系能够根据引导RNA的指示,靶标并降解入侵者的遗传物质。现在,CRISPR-Cas9已经成为了炙手可热的基因组编辑工具。多伦多病童医院的科学家们对CRISPR-Cas9进行改造,并将其用于基因表达调控。他们成功在杜氏肌营养不良患者的细胞中恢复了蛋白功能,这一成果最近发表在American Journal of Human Genetics杂志上。CRISPR-Cas9是细菌在漫长的进化史中演化出的重要防御机制。细菌免疫系统的天然蛋白Cas9,能像分子剪刀一样精确切割或编辑特定的DNA片段。这一系统被视为基因
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Nature:中外学者众议人类基因编辑
生物通报道 来自20多个国家近500名科学家、伦理学家、法律专家和利益团体上周共聚华盛顿,生成了在人类中利用基因编辑的指导准则。此次会议有力地提醒了人们,遗传工程渗透进社会达到了怎样的程度。1975年,主要来自美国的一群科学家在加州的阿西洛玛举行了一次标志性的会议,为推进一些强有力的新研究工具制定了严格的指导准则,这些工具可实现物种间的DNA混合。40年后,一个更加多样化的团体达成了一个不太明确的协议:不完全阻止人类基因编辑研究,但要避免一些研究和应用利用改造的人类胚胎建立妊娠。于12月1-3日召开的这次国际人类基因编辑峰会,是由美国国家科学院、美国国家医学院、中国科学院和英国皇家
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基因编辑有望治疗血友病
首例体内细胞基因编辑即将实现。这项技术将被试用于治疗B型血友病—— 一种能够导致自发性内出血的凝血功能紊乱病症。 这次临床试验的消息在近日于美国华盛顿特区召开的人类基因编辑国际峰会上宣布。此次会议主要聚焦于一项叫作CRISPR的革命性基因工程技术,尤其是其在人体上的应用。 基因编辑是指删除、增加或改变一个基因组精确位点的DNA。CRISPR是一种成本相对较低、较为简单的、相对精确的基因编辑方法,具有治疗多种疾病的潜力。尽管研究人员曾采集人类细胞进行类似基因编辑,而且在白血病和艾滋病病毒感染治疗案例中也曾使用过技术相对较成熟、成本更加昂贵的基因编辑方法,但这种新方法尚未开展临
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Nature子刊:CRISPR在癌症研究中的新应用
生物通报道:p53是最早发现也是最重要的肿瘤抑制子之一,被称为基因组的守护者。这种蛋白可以作为转录因子在细胞核中起作用,通过控制特定基因的表达,在细胞周期、DNA修复和细胞凋亡等重要过程中发挥关键作用。Mdm2失活p53是癌症中最常见的事件之一,因此用化合物靶标p53-Mdm2互作是很有前景的癌症治疗策略。不过,人们对p53激活药物面对的抵抗机制还知之甚少。德国马尔堡Philipps大学的研究人员建立了以CRISPR-Cas9为基础的靶点确证方法,并在肺癌和结肠直肠癌中进行了研究。这项研究前不久发表在Nature Chemical Biology杂志上,文章的通讯作者是马尔堡Philipps大
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Nature子刊发布CRISPR-Cas9基因编辑重要成果
生物通报道 由伦敦帝国学院领导的一个研究小组,第一次将疟蚊改造成了不能生育及快速传递这一性状的蚊子,由此增加了减少这种疾病传播的可能性。冈比亚按蚊(Anopheles gambiae)是撒哈拉以南非洲危险疟原虫的主要携带者,每年90%的疟疾死亡病例都发生在这一地区。每年有200多万人感染疟疾,导致43万多人死亡。现在,研究人员对冈比亚按蚊进行了遗传改造,让它们携带了一种破坏雌蚊子卵子生成的改造基因。利用一种叫做“基因驱动”的技术,研究人员确保了这一基因可以加速传递给后代,随着时间推移将这一基因传播至整个种群。在数年之内,这种传播有可能大大减少或消灭当地的疟蚊种群,他们的研究成果朝着
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Nature、Science:人类基因编辑取得共识
生物通报道:美国科学院、英国皇家学会和中国科学院联合主持的人类基因编辑国际峰会,探讨了用新方法(比如CRISPR)改变人类DNA的前景和风险,尤其是引起巨大争议的卵子、精子和胚胎基因组编辑。胚胎或生殖细胞的基因工程改造,会给个体及其后代带来永久性的基因改变,被许多人视为洪水猛兽。但这样的技术能阻止遗传学疾病的传递,造福许多被病痛折磨的患者。而且完全禁止这样的研究似乎并不现实。人类基因编辑国际峰会经过三天的热烈讨论终于达成共识,会议组委会于十二月三日发布了自己起草的声明。该声明指出,基因编辑技术不应用于准备建立妊娠的人类胚胎。推进生殖细胞基因编辑的临床使用是“不负责任的”,除非安全和效率问题得到
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科学家称基因工程正站在革命新前沿
生物通报道:人类具有改变大自然的能力,这是我们物种几千年来的一个特点,现在,这项能力已经向前迈出了一大步。我们改变生命遗传学的能力,以前只局限于家养动物,如牲畜和农作物。现在它延伸到了整个生物圈,包括我们自己。延伸阅读:Science:基因工程迈入新纪元 。全球范围内的基因工程,是科幻小说的梦想,有时也是噩梦。但现在,这个可能性已经到来。第一次,关于“大规模地快速转变整个生态系统”的讨论,不再是假想。上周,来自加州大学圣迭哥分校和加州大学欧文分校的科学家们宣布,他们制备出了转基因的蚊子品种,不仅可阻断疟疾寄生虫感染,而且还能将其抗疟基因传播到整个物种。在一些地区,一个季节可能就足以改变种群。疟
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The Scientist:2015年度十大创新产品(top 6-10)
生物通报道:The Scientist杂志终于揭晓了2015年的十大创新产品,评出了对科研和医学领域影响较大的测序仪、试剂盒、基因组编辑产品和其他技术。值得注意的是,在高科技大行其道的时代一个增强版的传统技术强势逆袭:光学显微镜3D Cell Explorer不需要标记就可以揭示活细胞中的显著细节。此外,生命科学领域近来最火的CRISPR基因组编辑技术在十大创新产品里面独占两席。(延伸阅读:The Scientist:2015年度十大创新产品top 1-5)Top 5:CRISPR Epigenetic Activator(Sigma Aldrich公司)Sigma公司九月份推出的CRISPR
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Nature专题:基因组编辑
生物通报道 遗传工程这一名词出现于上世纪70年代,然而直到过去的几年里,研究人员才开发出一些工具,让他们能够以设想的精度来改造基因组。本月,中、美、英三国的科学团体汇聚于美国华盛顿,联合举办了一场“以编辑人类生殖细胞系”为主题的国际峰会。12月3日,《自然》(Nature)杂志也推出了一期名为“Genome editing”的专题,以11篇文章形式专题介绍了三种主要的基因组编辑工具,基因组编辑在医学、农业、表观遗传学等各个领域广泛应用,胚胎基因组编辑,及基因组编辑面对的4大问题等等相关内容。ZFNs、TALENs和 CRISPR–Cas9,基因组编辑的三大工具基因组编辑简单来说,就