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The Scientist:2015年度十大创新产品(top 1-5)
生物通报道:The Scientist杂志终于揭晓了2015年的十大创新产品,评出了对科研和医学领域影响较大的测序仪、试剂盒、基因组编辑产品和其他技术。值得注意的是,在高科技大行其道的时代一个增强版的传统技术强势逆袭:光学显微镜3D Cell Explorer不需要标记就可以揭示活细胞中的显著细节。此外,生命科学领域近来最火的CRISPR基因组编辑技术在十大创新产品里面独占两席。(延伸阅读:The Scientist:2014年度十大创新产品)Top 1:GemCode测序平台(10X Genomics公司)如今越来越多的实验室配备了自己的DNA测序系统,比如Illumina台式测序仪。但这些
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12月生命科学界名人名言
本月值得关注的研究点评与名人名言: 因为2015年了。——当记者问新当选的加拿大总理Justin Trudeau为何选择组建了一个性别平等的内阁时,他如是答道。注:新当选的加拿大总理Justin Trudeau内阁成员包括该国第一位女性医学地理学家科技部部长Kirsty Duncan,以及创新,科学与经济发展部女部长Navdeep Bains。图片上为:Justin Trudeau(最下面一排中间),科技部部长Kirsty Duncan(最上面一排左边第三位),创新,科学与经济发展部部长Navdeep Bains(中间一排左边第二位)感觉很快,但我们会将其控制在科学允许的范围内。——Edita
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张锋Science重大突破:攻克CRISPR-Cas9基因组编辑的主要障碍
生物通报道 来自麻省理工学院-哈佛医学院Broad研究所和麻省理工学院McGovern脑研究所的研究人员,设计改造了革命性的CRISPR-Cas9基因编辑系统,大大减少了“脱靶”编辑错误。这一完善的技术解决了使用基因组编辑时面对的一个主要技术问题。CRISPR-Cas9系统是通过对细胞的DNA进行精确地靶向修饰来发挥作用。借助于与靶位点序列相匹配的一段短RNA分子,Cas9蛋白可改变指定位点的DNA。尽管Cas9能够高度有效地切割它的靶位点,这一系统有一个主要的缺点:就是一旦进入到细胞中,它可以结合并切割额外的非目标位点。这有可能会造成意外的编辑,完全改变基因表达或是敲除掉某一基因
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动物的基因组编辑引发热烈讨论
近两年,基因组编辑实验正在如火如荼地进行。尽管人类胚胎的CRISPR基因编辑已经暂停,但这些工具被应用在动物身上。据《纽约时报》报道,一些公司正利用这种技术来改造农场动物。在爱荷华州的一个农场内,创业公司Recombinetics对两头犊牛的基因进行编辑,使它们不长出牛角,这意味着它们将不用忍受割牛角的痛苦过程。通常,农民会割掉牛角,以防止受伤。相反,当犊牛还是培养皿中的单个细胞时,科学家们利用基因编辑工具,将负责长角的smidgen基因片段换成了安格斯肉牛的片段,而后者是没有角的。之后,通过正常的DNA复制机制将这种改变复制到所有细胞,并传递给后代。CRISPR技术以RNA为向导,利用酶在特
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刘小乐教授连发多项研究成果
生物通报道:华人女学者、哈佛大学公共卫生学院Dana-Farber癌症研究所的刘小乐(X Shirley Liu)教授,也是教育部“****”讲座教授、中组部“****”入选者,是国际生物信息学界的领军人物。其带领的课题组长期致力于生物大数据的收集和信息挖掘、筛选治疗癌症药物的有效靶点,以及开发个性化癌症诊断和治疗的新方法。近期,刘小乐教授带领的研究小组先后在《Genome Research》、《PLOS Computational Biology》和《Genome Biology》等国际著名学术期刊发表多项研究成果。今年六月份,刘小乐教授与CRISPR/Cas9技术先驱之一、麻省理工学院-哈
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人类基因编辑峰会在美召开
生物通报道:重写你的DNA,正越来越接近于现实:一种革命性的技术,正在为基因工程打开新的领域——为疑难病症带来有希望的疗法,也伴随着设计婴儿所带来的担忧。延伸阅读:基因编辑研究热潮引发伦理学争论。 本周,来自世界各地的数百名科学家和伦理学家,聚集在美国华盛顿讨论人类基因编辑的界限,他们担心,快速涌现出来的基因编辑研究,可能会超过安全和伦理审查。在中国研究人员首次尝试对人类胚胎中进行基因编辑之后,这个问题显得更为紧迫,这个实验室实验做的并不够好,但是却提高了“将来改变人类遗传性——将修饰的DNA传递给后代”的前景。在这次国际峰会前夕,美国加州大学伯克利分校的分子生物学家Jennifer Doud
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华东师范大学用CRISPR编辑啮齿动物单细胞胚胎
生物通报道 来自华东师范大学的研究人员报告称,他们采用Cas9蛋白来删除基因组大片段及敲入功能性基因盒(gene cassette),完成了对啮齿动物单细胞胚胎的基因组编辑。这一成果发布在12月1日的《Scientific Reports》杂志上。华东师范大学生科院生命医学研究所刘明耀(Mingyao Liu)教授和李大力(Dali Li)副教授是这篇论文的共同通讯作者。前者主要从事G蛋白偶联受体(GPCR)在个体发育和重大疾病发生发展过程中的功能及信号转导机理研究,从而进行靶向新药研发。后者主要研究领域是结合分子生物学手段及转基因、小鼠基因敲除技术研究GPCR和组蛋白修饰酶的生物
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用CRISPR制备视网膜神经细胞
生物通报道:最近,美国约翰霍普金斯大学的研究人员,开发出一种方法,能有效地将人类干细胞转化为视网膜神经节细胞——位于视网膜内的神经细胞类型,可将来自眼睛的视觉信号传递到大脑。这些细胞的死亡和功能障碍可导致一些疾病患者的视力丧失,如青光眼和多发性硬化症。本研究负责人、约翰霍普金斯大学医学院眼科学教授Donald Zack博士指出:“我们的工作不但会让我们更好地了解视神经的生物学,而且也给我们带来一个细胞为基础的人体模型,可用于发现阻止或治疗致盲疾病的药物。而且,最终它可能会促进细胞移植疗法的发展,恢复青光眼和MS患者的视力。”相关研究结果发表在最近的《Scientific Reports》,使基
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Nature:揭秘CRISPR基因组编辑的7个事实
生物通报道 12月1-3日,美国国家科学院、美国国家医学院、中国科学院与英国皇家学院将在美国的华盛顿联合举办一次峰会。作为这一大型国际会议的主题,人类基因组编辑的伦理学再度被放到聚光灯下。赶在这次峰会召开前,Nature网站撰写了一篇“Genome editing: 7 facts about a revolutionary technology”的文章,为我们揭示了7个有关基因组编辑的重要事实。1.目前,只有一项发表的研究描述对人类生殖细胞进行了基因组编辑。今年4月,由中山大学黄军就(Junjiu Huang)领导的一个研究小组,报告称他们利用当前流行的CRISPR–Cas9技术
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遗传学大牛:生殖细胞CRISPR不应禁止
生物通报道 CRISPR技术风暴正在席卷全球。这种简单的基因组编辑技术能够轻松地编辑任何物种的DNA,不过它曾被用来改变人体胚胎的DNA,引发安全性的担忧。近日,多位科学家和伦理学家齐聚华盛顿,讨论基因组编辑技术的这些问题。遗传学界的两位顶尖科学家,加州大学伯克利分校的Jennifer Doudna和哈佛大学医学院的George Church强调了监管的必要,但认为不应该完全禁止人类生殖细胞的编辑。他们在《Nature》杂志上发表了他们的看法。Doudna认为,人们应该商议基因组编辑研究的界限,特别是人类生殖细胞的编辑。“全面禁止也许会阻碍那些可能在未来带来治疗方法的研究,考虑到CRISPR/
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2015世界艾滋病日:带来治愈希望的新技术
生物通报道:为提高人们对艾滋病的认识,世界卫生组织于1988年将每年的12月1日定为世界艾滋病日,号召世界各国和国际组织在这一天举办相关活动,宣传和普及预防艾滋病的知识。从2011年开始,世界艾滋病日的主题都一直是Getting to Zero——零感染,零歧视和零死亡。而今年,联合国会员国也提出了更新应对艾滋病的目标,即在2030年前结束艾滋病流行。 这也就是说“结束艾滋病”已经被提上了日程,虽然我们身边不断有媒体报道艾滋病例的增多,但是从大数据上来看,艾滋病患者确实越来越多的得到救助——据统计,2000年后由于艾滋病引发的死亡率降低了42%,新感染者减少了35%。同时今年6月,古巴成为世界
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Genome Biol最新CRISPR综述文章
生物通报道:以CRISPR为基础的方法,已经迅速成为一种倍受青睐的方法,来干扰基因以发现它们的功能。来自哈佛-麻省理工学院布罗德研究所和麻省综合医院的研究人员Daniel B. Graham、David E. Root,在十一月二十七日的国际著名学术期刊《Genome Biology》上,发表题为“Resources for the design of CRISPR gene editing experiments”的综述文章,该综述文章回顾了基因编辑实验设计中的关键注意事项,并调查了目前可用来协助这一技术使用者的工具和资源。延伸阅读:CRISPR专家发表CRISPR/Cas9综述。细菌II型
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南京农大用TALENs和CRISPR实现大豆高效定向诱变
生物通报道:大豆(Glycine max(L.)Merrill.)是一种古老的多倍体植物,是具有重要经济价值的豆科作物。大豆为食物生产和动物饲料提供了丰富的蛋白质和油。近年来,各种各样的遗传方法已被用来改善大豆的农业性状。CRISPR是生命进化历史上细菌和病毒进行斗争产生的免疫武器,自2012年以来,研究人员常用这种强大的“基因组编辑”技术,对生物的DNA序列进行修剪、切断、替换或添加,迅速成为生命科学最热门的技术。近期,这项热门技术也相继被应用于农作物的基因组编辑。例如,2015年五月二十九日在Nature子刊《Scientific Reports》发表的一项研究中,来自西北农林科技大学、中
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张锋公司Genome Biology发表CRISPR新成果
生物通报道:细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争,为此它们演化出了多种防御机制,CRISPR适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合,可以在引导RNA的指引下,靶标并切割入侵者的遗传物质。近几年,人们将CRISPR系统开发成了强大的基因组编辑工具。该系统使用简单而且扩展性强,很快便受到了研究者们的广泛欢迎。几乎所有实验室都可以很方便的进行CRISPR基因组编辑,你只需要在自己感兴趣的细胞或生物中表达Cas9内切酶和引导RNA(gRNA)。内切酶Cas9会在gRNA的指导下引入位点特异性的双链断裂,然后细胞通过同源重组进行修复,最终改写基因组的特定位点
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Cell:CRISPR技术在癌症领域大放异彩
生物通报道 科学家们绘制出了让我们细胞存活的基因的图谱,为了解我们基因组的运作机制以及哪些基因对像癌症这样的疾病至关重要建立了一个期盼已久的立足点。由多伦多大学Donnelly中心Jason Moffat教授领导的一个研究小组,在药学系Stephane Angers的帮助下,逐个关闭了近1.8万个基因(整个人类基因组的90%)来寻找对细胞生存至关重要的基因发表在11月25日《细胞》(Cell)杂志上的数据,揭示出了由1,500多个必需基因构成的“核心”基因组群。这为实现生物研究的长期目标:确切描绘出基因组中每个基因的功能奠定了基础。通过在5种不同的癌细胞系,包括脑癌、视网膜癌、卵巢
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中大黄军就、松阳洲教授:发表CRISPR/Cas9基因编辑新成果
生物通报道 来自中山大学的研究人员报告称,他们利用CRISPR/Cas9系统构建出了Slx2基因敲除小鼠模型,证实了CRISPR/Cas9技术可以推动对睾丸特异性X连锁基因的体内功能研究。这一研究成果发布在11月24日的《PLoS One》杂志上。中山大学生命科学学院的黄军就(Junjiu Huang)副教授和松阳洲(Zhou Songyang)教授是这篇论文的共同通讯作者。在过去的十多年,松阳洲教授在分子细胞学领域的研究中做出了独创性的贡献。他对人体细胞端粒调节机理和胚胎干细胞的蛋白组学和功能性的研究处于国内外相关领域的前沿。“80后”的黄军就副教授是位年轻的学者,今年他的研究团
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Nature、Science关注CRISPR基因编辑新成果
生物通报道 利用一种创新性基因编辑技术,加州大学的科学家们构建出了一种蚊子品系,其能够通过后代将一些疟疾阻断基因快速导入蚊子种群,最终消灭这种昆虫向人类传播疟疾的能力。这种新模型代表了在建立抗虐蚊子种群研究工作中取得的一个重大进展,随着进一步的开发其有可能帮助消灭这一每年危害全球数百万人健康的疾病。这项研究工作发布在11月23日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上,同日Nature和Science网站都对这一成果进行了热点报道。为了构建出这一品种,加州大学欧文分校和圣地亚哥分校的研究人员将一个DNA元件插入到了斯氏按蚊(Anopheles stephensi)的生殖细胞中,使得一
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西南大学将CRISPR用于鱼类遗传学研究
生物通报道:与哺乳动物不同的是,鱼类的性别决定基因在物种之间有所差异,但是,是否有一个共同的分子通路调节着硬骨鱼的性腺性别决定,目前尚不明确。十一月二十日,来自西南大学、日本爱媛大学和美国马里兰大学研究人员,在国际著名遗传学期刊《PLOS Genetics》发表题为“A Tandem Duplicate of Anti-Müllerian Hormone with a Missense SNP on the Y Chromosome Is Essential for Male Sex Determination in Nile Tilapia, Oreochromis niloticus”的研
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中国科学家Nature畅谈CRISPR基因编辑
生物通报道 中国的科学界正在大胆地推进遗传重组动物的相关研究工作。尽管一些科学家表示担心会出现伦理学问题,在中国新的狗、山羊、猴和猪品种正在快速地被制造出来。11月18日,Nature网站以“China's bold push into genetically customized animals”为题对当前中国的CRISPR基因编辑研究工作状况进行了全方位的报道。上接:Nature:中国大胆的CRISPR研究引发国际担忧这种争论或许有点夸张。中国科学家表示,从未试图编辑人类生殖细胞或开发临床应用。人类胚胎论文的共同作者、中山大学遗传学家黄军就(Junjiu Huang)在一封电子
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Nature关注中国CRISPR基因编辑研究
生物通报道 中国的科学界正在大胆地推进遗传重组动物的相关研究工作。尽管一些科学家表示担心会出现伦理学问题,在中国新的狗、山羊、猴和猪品种正在快速地被制造出来。11月18日,Nature网站以“China's bold push into genetically customized animals”为题对当前中国的CRISPR基因编辑研究工作状况进行了全方位的报道。中国西部的陕西省以其崎岖风化的地形、煤炭及羊毛而著称,而非它的科学。然而在陕西省陕北绒山羊工程技术研究中心,科学家们刚刚创造出了一种新山羊,相比于正常的山羊它们的肌肉更结实、羊毛更长。这些山羊并非是通过育种而是直接操控动