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清华大学Nature发布重要调控图谱
生物通报道 来自清华大学生命科学学院、北京大学等机构的研究人员报道称，他们绘制出了哺乳动物着床前胚胎易接近染色质的景观图。这一重要的研究成果发布在6月15日的《自然》（Nature）杂志上。领导这一研究的是清华大学生命科学学院的颉伟(Wei Xie)研究员，其主要科研领域与方向包括表观遗传学，基因组学和生物信息学。2013年，颉伟在美国圣地亚哥Ludwig肿瘤研究所攻读博士后时，以第一作者在Cell杂志上发表文章，揭示了引导早期人类胚胎发育的基因开启和关闭的机制。此外，这项研究还描述了一种有可能不只在胚胎发育过程中，并且同样在癌症中起极其重要作用的新遗传现象（任兵教授《Cell》绘
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韩春雨：“冷板凳”上坐出科学新秀
■记者 王超韩春雨火了。这位曾经没有任何名誉标签的科学新星，近日遭到了多家媒体的轮番“轰炸”。今年42岁的韩春雨现任河北科技大学生物科学与工程学院生命科学系副教授、硕士研究生导师。今年5月，他作为通讯作者在《自然—生物技术》杂志提出的新基因编辑技术NgAgo-gDNA，向当前最火热的“第三代”基因编辑技术CRISPR-Cas9发起了挑战。韩春雨及其团队的发现被一些人称作是“第四代”基因编辑技术。然而，在成名之前，这位科学“新秀”曾坐了十多年的“冷板凳”。“科研在这里也有退路”十年寒窗无人问，一举成名天下知。这正是韩春雨科研生涯的写照。让韩春雨一朝成名的研究成果是他与团队利用格氏嗜盐碱杆菌实现D
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窃取CRISPR的免疫“黑客”
生物通报道：英属哥伦比亚大学的研究人员发现，一种感染主要淡水细菌的病毒使用“偷来”的CRISPR劫持宿主的免疫系统。这种病毒黑客在控制宿主免疫系统之后，迅速给系统打上补丁，以确保其他黑客无法闯入。这项研究发表在美国微生物学会旗下的mBio杂志上。细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争，为此它们演化出了多种防御机制，CRISPR-Cas适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas的组合，可以在引导RNA的指引下，靶标并切割入侵者的遗传物质。2012年研究者们利用这一特点，将CRISPR系统发展成了强大的基因组编辑工具。该系统使用简单而且扩展性强，很快便成为了生物学领
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候选院士屈良鹄国际期刊发表癌症成果
生物通报道：Wnt/β-catenin信号通路异常激活的一个标志，已经在大多数的结直肠癌（CRC）中被观察到，但是这个途径所调控的非编码RNA的作用，我们仍然知之甚少。6月7日在国际著名肿瘤期刊《Oncotarget》发表的一项研究中，来自中山大学、美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员指出，miR-150是一种新型的Wnt效应物，可通过靶定CREB信号通路而显著提高结直肠癌细胞的EMT。本文通讯作者是中山大学生命科学学院教授、博士生导师，国家杰出青年基金获得者，教育部“****奖励计划”特聘教授屈良鹄，屈良鹄教授长期从事分子生物学与基因工程方面的教学与科学研究，是RNA组学领域专家。他
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广州医科大学用CRISPR纠正地贫突变
生物通报道：β地中海贫血（β-Thal）是世界上最常见的一种遗传性疾病。生成患者特异性的β-Thal诱导多能干细胞（iPSCs），纠正这些细胞中的致病突变，然后分化成为造血干细胞（HSCs），为这种疾病的治疗提供了一种新策略。相关阅读：南方医科大学Blood发表地中海贫血研究新发现；中国发现世界首例缺失型α地中海贫血突变基因。6月10日，国际著名学术期刊《Journal of Biological Chemistry》在线刊登了广州医科大学第三附属医院孙筱放教授带领的一项研究成果，题为“Combining single-strand oligodeoxynucleotides and CRIS
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Cell社论：基因组编辑工具升级版
生物通报道：基于原核 CRISPR-Cas 免疫系统的基因组编辑技术是近几十年来最强大的生物学技术突破之一，这种工具能对许多种类的生物进行精确的遗传改变，为基础研究，生物技术和临床医学带来了巨大的希望。最新一期（6月2日）Cell杂志介绍了这种技术工具的最新升级改造，指出通过改进Cas9酶和重编程新酶，研究人员能获得更加适合不同基因组编辑应用的新工具，这也加速了其在临床上的应用。应该说CRISPR-Cas系统是继Meganuclease、锌指酶和TALEN之后，又一通过各自的DNA结合域来靶向目的序列，不过这一技术使用RNA为核酸酶导航，不仅很容易设计，而且能够改写几乎任何基因组序列。但是这并
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Nature子刊：发现CRISPR/Cas的对抗系统
生物通报道 来自多伦多大学和新西兰奥塔哥大学的一个研究小组证实，不同的细菌物种群编码了一些阻断特异CRISPR/Cas系统活性的蛋白。扫描前噬菌体( prophage，整合在细菌基因组内的噬菌体基因组 )，多伦多大学的Alan Davidson和同事发现了5个新的蛋白质编码anti-CRISPR基因，在他的研究小组以往鉴别的9个anti-CRISPR基因列表中添加了新成员。发表在6月13日Nature Microbiology杂志上的这项新研究，揭示了了解CRISPR系统运作机制的一条途径及实现CRISPR基因编辑的一个潜在扩展工具（Cell发布突破性CRISPR新技术 ）。法国艾
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减肥大作战，十大最受欢迎的健康研究
生物通报道：炎炎夏日，正是减肥健身的好时节。衣柜里那些的轻薄衣裙会燃起你斗志，督促你摆脱藏了一个冬季的赘肉。为了帮助大家科学减肥，Biotechniques杂志盘点了近期最受欢迎的十项健康研究。1. 吃得巧妙，减肥更有效跑步是最简单易行的减肥运动。不过，要想达到理想的减肥效果，光跑步可能还不够。康涅狄格大学的研究人员发现，一份科学的食谱能让你事半功倍。他们的研究显示，脂肪含量高、蛋白质充足的低碳水化合物饮食可以帮助长跑运动员燃烧脂肪。这项研究告诉我们，管住自己的嘴巴少吃碳水化合物是减肥的不二法门。这种饮食可以有效训练你的身体，帮你甩掉更多的脂肪。（原文：Metabolic chara
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青年学者利用CRISPR筛选癌症治疗靶标
生物通报道：来自加拿大多伦多大学Jason Moffat实验室的Traver Hart也是一位CRISPR技术领域的青年科学家，他曾自己定义了一套用于评估RNAi和CRISPR遗传筛选治疗的金标准，并且利用HCT116细胞系（来自人类结肠癌），Hart发现CRISPR筛选不仅更加敏感，也能避免出现额外的背景错误。最初Hart等人只是想弄清楚不同细胞系或遗传背景下需要什么不同的基因，了解细胞系的基因型有助于他们进行预测，例如结肠癌，携带DLD1 和 HCT116 的细胞系都存在 KRAS 驱动突变，这表明 MAPK 下游通路都被激活了，Hart等人通过筛选证实了这一预测。为了更好地理解每个细胞系
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Traver Hart：利用CRISPR发现未知基因功能
上篇：CRISPR领衔科学家探讨CRISPR遗传筛选生物通报道：自2012年底CRISPR/Cas9最初被用于基因编辑之后，这个前途光明的技术已经被应用到了许多研究领域，而且随着技术的改良，越来越多的研究团队利用CRISPR进行大规模的遗传筛选，比如用于识别导致癌症抵抗治疗的突变，或者加速药物靶标评估。RNA干扰，相比于CRISPR/Cas9 在遗传筛选方面的作用，无论是效率和特异性方面，目前都难以望其项背了。人类细胞系遗传筛选寻找癌症靶向以RNA干扰为基础的遗传筛选已经实现了人类细胞全基因组范围筛选，但是由于对 RNAi 生物学的不完整解析，以及由此产生的数据，导致了一些错误的分析，比如一篇
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遗传学大牛Science发布CRISPR/Cas重要研究成果
生物通报道 根据发表在6月9日《科学》（Science）杂志上的一项研究报道，哈佛大学的研究人员利用细菌CRISPR/Cas适应性免疫系统，开发出了一种方法长期记录活细胞中的分子事件。这一系统将特异的合成DNA元件按一种时间上有序的排列整合到了细菌基因组中，一旦测序就可以提供细菌DNA事件时间表的读取值。特拉维夫大学微生物学家Udi Qimron（未参与该项工作）说：“这项工作的重要之处在于提供了一个原理证明：或许可以利用一种令人着迷的细菌免疫系统来作为一种具有骄人记录能力的工具。”CRISPR/Cas系统是通过从感染病毒基因组中剪掉一些短DNA元件，将这些元件整合到细菌基因组中（
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遗传学大牛谈CRISPR革命的下一站
生物通报道：George M. Church是哈佛医学院著名的遗传学教授、Wyss研究所的核心成员，被誉为是个人基因组学和合成生物学的先锋。1984年，Church和 Walter Gilbert发表了首个直接基因组测序方法，一些策略现在仍应用在二代测序技术中。此外，他还发明了多重化分子技术和条码式标签，并作为纳米孔测序技术的发明者之一。2014年9月，George M. Church教授领导哈佛医学院的团队，开发了单分子互作测序（SMI-Seq）技术，该技术能够实现单分子水平上的并行分析，获得大量蛋白质的互作图谱。相关阅读：遗传学大牛Nature发表新技术：单分子互作测序。随后的11月，他领
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华中农大CRISPR疗法综述刊登国际期刊
生物通报道：近期，来自华中农业大学、中科院武汉病毒研究所、巴基斯坦医学科学研究所以及华中科技大学同济医学院的研究人员，在国际著名学术期刊《Oncotarget》发表题为“CRISPR/Cas9 therapeutics: a cure for cancer and other genetic diseases”的综述文章。这项研究的通讯作者是华中农业大学动物科学技术学院、动物医学院的张淑君教授。近年来，可用的癌症治疗方法已经发展到改善病人的预后。化疗、放疗和手术被结合起来使用，以减少癌细胞复发，并使寿命最多增加了五年。然而，有害的副作用和毒性提高了死亡率，同时也大大降低了患者生活的质量。对癌症
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Cancer discovery：CRISPR筛选存在假阳性
生物通报道：基因筛选是经典的生物学研究方法，常用于鉴定在生物学过程中起作用的基因。十多年来，RNAi一直是这个领域的王者。不过，CRISPR-Cas9正在逐渐瓦解RNAi的统治地位。Cancer discovery杂志最近发表的一项研究显示，CRISPR-Cas9能够更全面的评估癌细胞弱点，筛选出更多的癌细胞必需基因。不过CRISPR筛选也会产生假阳性结果，需要设立对照谨慎分析。RNAi主要是引入siRNA或者shRNA，让细胞降解相应的mRNA，通过功能缺失表型来进行基因筛选。不过RNAi比较容易出现错误，siRNA/shRNA的脱靶效应会引起假阳性结果，siRNA/shRNA缺乏活性会引起
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Cancer Discovery：细胞对CRISPR的应答不容忽视
生物通报道：这两年几乎人人都在谈论CRISPR基因组编辑，那么细胞对这个系统的闯入作何感想呢？Cancer Discovery杂志最近发表的一项研究指出，细胞会对CRISPR-Cas9产生一种不容忽视的应答。细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争，为此它们演化出了多种防御机制，CRISPR-Cas适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合，可以在引导RNA的指引下，靶标并切割入侵者的遗传物质。这种特性使CRISPR系统成为了基因组编辑和基因功能研究的实用工具。CRISPR-Cas9能够很方便的在哺乳动物细胞中进行体细胞遗传筛选。但哈佛大学Dana-Far
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顶尖干细胞专家：让骨髓移植更安全的方法
生物通报道：最近，哈佛大学干细胞研究所(HSCI)的科学家们，开发出了一种使骨髓——造血干细胞——移植更安全的疗法，因此，可能更广泛适用于数以百万计患有血液疾病（如镰状细胞性贫血、地中海贫血和艾滋病）的人。目前，骨髓移植是治疗这些血液疾病唯一有效的疗法。但是，对于新的、移植的干细胞来说，要发挥它们的作用，首先必须“驱逐”或杀死有缺陷的干细胞。要做到这一点，就需要病人忍受化疗和辐射——对身体的恶性攻击，会产生终生的影响。最近在《Nature Biotechnology》杂志上发表的一项研究中，HSCI和马萨诸塞州总医院(MGH)的研究人员，与波士顿儿童医院以及Dana Farber癌症研究所合作
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两篇Nature Biotechnology聚焦CRISPR基因组编辑新工具
生物通报道 在2015年发表于Cell杂志上的一项研究中，哈佛-麻省理工Broad研究所的张锋及其同事们报告称发现了一种不同的CRISPR系统：CRISPR–Cpf1，其有潜力实现更简单、更精确的基因组工程操作。自此之后，这一CRISPR基因组编辑新型工具吸引了世界各地实验室的广泛注意（张锋Cell：新一代CRISPR基因组编辑系统 ）。2016年4月20日，来自哈尔滨工业大学、清华大学的研究人员报告称，他们获得了Cpf1/CRISPR RNA复合物的晶体结构。这一重要的研究成果发布在Nature杂志上（哈尔滨工业大学Nature发表CRISPR研究重要成果 ）。同日，德国马克思普
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CRISPR牛人：利用CRISPR发现未知基因功能
生物通报道：自2012年底CRISPR/Cas9最初被用于基因编辑之后，这个前途光明的技术已经被应用到了许多研究领域，而且随着技术的改良，越来越多的研究团队利用CRISPR进行大规模的遗传筛选，比如用于识别导致癌症抵抗治疗的突变，或者加速药物靶标评估。RNA干扰，相比于CRISPR/Cas9 在遗传筛选方面的作用，无论是效率和特异性方面，目前都难以望其项背了。上篇：CRISPR领衔科学家探讨CRISPR遗传筛选张锋解析如何利用CRISPR发现未知基因功能CRISPR 系统的一大亮点在于导向RNAs的特异性，张锋说，这样一来我们就能生成靶向每个基因或某个基因多个位点的CRISPR导向慢病毒库。然
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CRISPR遗传筛选：eSpCas9 突变
生物通报道：基因编辑，尤其是CRISPR/Cas9系统，从某种意义上来说就像是一辆正在生产的闪亮新车，在构建主要框架的同时也开始启动，而且还准备开始一路飚车。自2012年底CRISPR/Cas9最初被用于基因编辑之后，这个前途光明的技术已经被应用到了许多研究领域，而且随着技术的改良，越来越多的研究团队利用CRISPR进行大规模的遗传筛选，比如用于识别导致癌症抵抗治疗的突变，或者加速药物靶标评估。RNA干扰，相比于CRISPR/Cas9 在遗传筛选方面的作用，无论是效率和特异性方面，目前都难以望其项背了。同时，譬如MD安德森癌症中心等处的研究人员也开始进一步了解CRISPR/Cas9的特性和局限
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张锋Science文章：靶向RNA的新型CRISPR系统
生物通报道 来自麻省理工学院-哈佛大学Broad研究所、麻省理工学院、美国国立卫生研究院、罗格斯大学新布朗斯维克分校和俄罗斯Skolkovo理工学院的研究人员，确定了一个靶向RNA而非DNA的新型CRISPR系统的特征。研究结果发表在《科学》（Science）杂志上。这种新方法有潜力开辟一条强大的细胞操控途径。鉴于DNA编辑会造成细胞基因组永久性的改变，这一基于CRISPR的RNA靶向方法能允许研究人员生成可以上调或下调的短暂改变，相比现有的RNA干扰技术具有更大的特异性和功能。Broad研究所核心成员张锋（Feng Zhang）博士以及NIH进化基因组学课题组负责人Eugene
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