• 基于方向约束扩散薛定谔桥的单细胞扰动响应预测模型及其在基因调控网络与药物发现中的应用

  亮点陈述引言单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术能够以高分辨率表征细胞对外部扰动的响应，支持系统性追踪转录反应、识别调控通路及发现治疗靶点[1,2,3]。这些进展不仅推动基础生物学研究，更为生物医学信息学奠定基础，支撑数据驱动的药物发现、临床决策支持与精准医疗[4,5,6]。随着Perturb-seq和sci-Plex等高通量扰动技术的出现，基于扰动的实验已成为机制探索的强大工具[7,8,9]。单细胞扰动建模的核心挑战在于实现分布外（OOD）泛化，即预测训练集中未出现的扰动条件下的细胞响应。仅依赖实验策略在此类场景中仍有局限，计算建模成为扩展预测能力的关键补充[8,10]。近期研究通过潜

  来源：Journal of Biomedical Informatics

  时间：2025-09-27

• 双通路模型跨尺度语义融合集成在药物重定位（Drug Repositioning）中的创新应用

  亮点我们计算元路径可达性和边置信度以生成增强边，有效解决网络边缘稀疏问题。我们设计了一个双分支网络，捕获多尺度特征，从完整的药物-疾病-蛋白质网络中提取拓扑特征信息，同时挖掘子图中的显著特征信息。提出自适应残差图注意力（Adaptive Residual Graph Attention），在信息传播过程中进行自我调节，显著提高稳定性和泛化能力。设计评分驱动Top-K卷积图池化（Score-Driven Top-K Convolutional Graph Pooling），筛选最关键节点，减少冗余信息。异质网络构建我们将异质图定义为三元组 G=(V,E,F)，其中 V={Vdr, Vdi, Vp

  来源：Journal of Biomedical Informatics

  时间：2025-09-27

• 术中皮质类固醇给药对可切除胃癌患者预后的影响：一项多中心随机开放标签II/III期研究的回应与阐释

  胃癌是全球范围内最具挑战性的恶性肿瘤之一，尤其对于可切除胃癌患者，术后并发症和长期生存率仍是临床关注的焦点。近年来，围术期炎症反应调控逐渐成为改善外科预后的重要研究方向。尽管术前新辅助化疗和术后辅助化疗方案不断优化，但术中管理策略尤其是免疫调节干预的价值尚未得到充分验证。在此背景下，日本研究团队开展了这项旨在评估术中皮质类固醇给药对可切除胃癌患者预后影响的多中心临床研究。该研究采用多中心、随机、开放标签的II/III期试验设计，纳入来自日本23家医疗中心的603例可切除胃癌患者。研究对象按1:1比例随机分配至干预组（术中静脉注射地塞米松）或对照组（常规手术）。主要终点为II期部分的术后90天内

  来源：Gastric Cancer

  时间：2025-09-27

• 综述：胃切除术中的教科书结局：有用指标还是移动靶点？一项范围综述

  背景胃切除术是胃癌治疗的核心手段，传统质量指标如死亡率和并发症率难以全面反映治疗质量。复合指标教科书结局（Textbook Outcome, TO）及其肿瘤学版本（Textbook Oncological Outcome, TOO）应运而生，旨在通过多维度整合评估“理想”的手术过程。TO最初由Dijs-Elsinga提出，强调患者倾向的无并发症围手术期过程，后经Kolfschoten在结直肠手术中正式定义。荷兰上消化道癌症审计（DUCA）小组将其适配于胃食管手术，定义了包括R0切除、≥15枚淋巴结检出、无严重并发症（Clavien-Dindo≥II级）、无30天再入院等10项标准。TOO则进一

  来源：Gastric Cancer

  时间：2025-09-27

• 基于肿瘤表型分型揭示食管胃结合部癌分子特征与免疫微环境的新视角

  基于肿瘤表型的分型方法为食管胃结合部癌（Esophagogastric Junction Cancer, EGJ）提供了全新的分子特征解析视角。研究背景显示，全球范围内EGJ癌发病率持续上升，其中Siewert II型涵盖肠型与胃型两种表型，但二者的分子图谱与临床病理特征尚未明确。研究方法涵盖对2014至2023年间接受手术切除的922例EGJ或胃癌患者的分析。通过免疫组化（Immunohistochemistry）技术将肿瘤划分为肠型与胃型表型，并采用全外显子测序（Whole-Exome Sequencing）进行分子 profiling，系统探索了临床病理特征、突变模式、免疫应答及生存结局

  来源：Gastric Cancer

  时间：2025-09-27

• 角蛋白细胞自噬介导的自组装四面体框架核酸可促进伤口愈合并减少疤痕增生

  创伤往往会导致伤口形成和瘢痕增生，而这一过程可能对患者的健康和生活质量产生深远影响。在伤口愈合过程中，如果细胞无法有效修复受损组织，可能会引发一系列并发症，如慢性伤口、瘢痕过度增生，甚至发展为瘢痕癌等严重问题。因此，探索能够促进伤口愈合并减少瘢痕形成的新型治疗方法具有重要的临床意义。近年来，研究人员发现一种基于DNA结构的新型纳米材料——四面体框架核酸（tFNA）在多种疾病治疗中表现出良好的效果，但其对伤口愈合的具体作用机制尚未完全明确。本研究旨在探讨tFNA对人类永生化表皮细胞（HaCaT细胞）和伤口愈合的影响，通过体外实验与体内实验相结合的方式，揭示其在促进伤口修复和减少瘢痕形成中的作用。

  来源：MedComm

  时间：2025-09-27

• 综述：中性粒细胞在稳态和疾病中的作用

  ### 高等生物免疫细胞——中性粒细胞：在生理平衡与疾病发展中的双重角色中性粒细胞是哺乳动物体内先天免疫系统中占主导地位的一类免疫细胞，它们在清除病原体和维持机体稳态方面发挥着至关重要的作用。近年来，随着对中性粒细胞在癌症及其他非肿瘤性疾病中的作用研究不断深入，科学家们发现这些细胞并非单一功能的“清道夫”，而是在不同疾病阶段展现出复杂的动态变化。中性粒细胞在癌症的发展过程中既可能抑制肿瘤生长，也可能促进其发展，这种双重功能使得它们成为研究的重要对象。此外，中性粒细胞还广泛参与感染、自身免疫疾病、神经退行性疾病和代谢疾病等非肿瘤性疾病的进程，表明它们在维持机体健康与应对疾病方面具有广泛而深远的影

  来源：MedComm

  时间：2025-09-27

• 针对Pkp2缺陷的基因疗法可减轻心脏纤维化：来自Pkp2敲除大鼠单细胞转录组学的见解

  心脏衰竭（Heart Failure, HF）是一种多种心血管疾病终末期表现，通常表现为心脏结构重塑和功能障碍的临床综合征，其中心肌纤维化是疾病进展的重要标志。尽管HF的病因具有多样性，包括缺血性损伤、压力负荷增加和遗传性心肌病等，但它们在病理生理机制上存在共性，如心肌细胞凋亡、纤维化替代以及电机械不同步等。当前的治疗策略，如神经内分泌阻断（β受体阻滞剂、ACEI/ARB、ARNI、醛固酮受体拮抗剂）和利尿剂，主要提供症状缓解，却对阻止纤维化重塑的效果有限。因此，探索更具针对性的抗纤维化干预手段，成为改善HF患者预后的关键。心脏的结构和功能依赖于多种复杂的细胞间连接，其中桥粒（desmosom

  来源：MedComm

  时间：2025-09-27

• 综述：线粒体相关的内质网膜在健康与疾病中的作用

  膜接触位点（Membrane Contact Sites, MCSs）是细胞内不同细胞器之间密切接触的区域，它们通过特定的蛋白质组成来稳定这种相互作用，从而协调细胞器之间的功能。在众多MCSs中，线粒体-内质网膜接触位点（Mitochondria-Associated ER Membranes, MAMs）尤为关键，它在生理和病理环境中都发挥着重要作用。MAMs参与多种细胞过程，包括钙离子（Ca²⁺）转运、脂质代谢、内质网应激反应、氧化应激调控、线粒体动态变化以及线粒体自噬（mitophagy）。当MAMs的组成成分调控失常时，疾病的发病率会显著上升。本文旨在阐述MAMs蛋白在健康状态下的功能

  来源：MedComm

  时间：2025-09-27

• 基于骨密度的联合模型用于非小细胞肺癌患者接受免疫检查点抑制剂治疗后的无创预后预测：一项多中心回顾性研究

  本研究聚焦于非小细胞肺癌（NSCLC）患者在接受免疫检查点抑制剂（ICI）治疗过程中，基线骨矿物质密度（BMD）和治疗后BMD下降（BMDD）的预后价值。通过整合多中心数据，研究团队构建了一个结合BMD/BMDD与临床特征的联合模型，用于非侵入性地预测NSCLC患者的疗效和预后情况。研究还通过转录组学分析探讨了BMD在免疫治疗中的潜在生物学机制。这些发现为免疫治疗的临床决策提供了新的工具，并有助于更精准地进行患者风险分层。### 骨矿物质密度与免疫治疗预后的关系研究纳入了2096名接受ICI治疗的晚期NSCLC患者，构建了一个影像-预后队列，并通过基因表达数据与影像学特征的匹配，形成了另一个影

  来源：MedComm

  时间：2025-09-27

• 综述：唾液代谢组学在系统性疾病早期检测和监测方面的进展与挑战

  在现代医学研究中，唾液代谢组学正逐渐成为一种强大的非侵入性手段，用于探索人类健康与疾病之间的关系。相较于血液或尿液等传统生物样本，唾液因其易于获取、微创性以及适合重复采样的特性，成为研究者关注的重点。近年来，随着核磁共振（NMR）、质谱（MS）、毛细管电泳（CE）以及生物信息学等技术的不断进步，唾液代谢组学在灵敏度和可重复性方面得到了显著提升，使得其在多种系统性疾病的诊断与监测中展现出广阔的应用前景。唾液代谢组学的应用范围涵盖了癌症、心血管疾病、糖尿病、病毒感染、自身免疫性疾病以及神经退行性疾病等多个领域。这一技术的优势在于，它不仅能够反映口腔局部的代谢变化，还能捕捉到全身性的生理和病理信息。

  来源：MedComm

  时间：2025-09-27

• 综述：自由基与健康和疾病

  自由基，即具有不成对电子的分子或原子，是一种具有双重作用的生物分子。它们在细胞功能中既可能造成损伤，也可能参与信号传导，这种双重特性决定了其在生理和病理状态下的不同表现。自由基的生成与浓度、时空分布密切相关，其作用的正负取决于这些因素。在正常生理条件下，自由基是调控线粒体功能、细胞信号传递以及免疫反应的重要介质，有助于维持代谢稳态和免疫平衡。然而，当自由基的生成失衡，如过度产生或供应不足时，会导致氧化应激或还原应激，进而引发多种疾病状态，如癌症、糖尿病、神经退行性疾病等。当前针对自由基的治疗策略在临床实践中往往面临挑战，主要原因在于其剂量控制和靶向性不足，导致治疗效果有限甚至产生反效果。这种治

  来源：MedComm

  时间：2025-09-27

• 综述：基于石墨烯量子点的生物成像和药物递送系统的最新进展

  ### 图形化分析：基于石墨烯量子点（GQDs）在生物医学领域的潜力近年来，随着纳米技术的发展，石墨烯量子点（Graphene Quantum Dots, GQDs）作为一种新型的碳基纳米材料，因其独特的物理化学性质、光学特性和电子行为，被广泛应用于生物医学领域。GQDs作为石墨烯的纳米级结构，不仅保留了石墨烯的许多优异特性，如高比表面积、优异的导电性以及良好的机械强度，还通过量子限域效应和边缘效应展现出独特的光学行为，如荧光发射。这些特性使得GQDs在生物成像、药物输送以及疾病诊断等方面展现出巨大的应用潜力。GQDs相较于传统量子点（Quantum Dots, QDs）的优势尤为显著。传统Q

  来源：MedComm

  时间：2025-09-27

• 低甲基化增强的F-Box蛋白32通过泛素介导的PHLPP2降解促进肝细胞癌的发生

  肝细胞癌（HCC）是全球范围内常见的恶性肿瘤之一，也是癌症相关死亡的主要原因之一。尽管在诊断和治疗方面取得了一定进展，但HCC的整体预后仍然不理想，主要原因包括其复杂的病理机制和高度的异质性。晚期诊断、有限的治疗选择以及对传统疗法的耐药性，都是导致HCC患者生存率低的重要因素。因此，深入理解推动HCC发生和发展的分子机制，对于识别新的治疗靶点具有重要意义。本研究聚焦于F-Box蛋白家族成员F-Box Protein 32（FBXO32）在HCC中的作用及其分子机制，揭示了其在HCC恶性进展中的关键角色。FBXO32属于F-box蛋白家族，该家族在多种癌症中通过泛素化和降解特定底物参与多个与癌症

  来源：MedComm

  时间：2025-09-27

• 错义突变和功能丧失突变对家族性和散发性梅尼埃病遗传结构的不同影响

  Meniere disease (MD) is a chronic inner ear disorder characterized by episodic vertigo, fluctuating sensorineural hearing loss (SNHL), tinnitus, and aural fullness. This study aimed to investigate whether the genetic burden in sporadic MD (SMD) overlaps with familial MD (FMD), potentially revealing

  来源：MedComm

  时间：2025-09-27

• 基于ddPCR技术的AVGN7基因治疗在Göttingen小型猪体内生物分布分析方法的开发与验证

  随着基因治疗领域的快速发展，监管机构对临床前研究提出了更高要求，其中载体生物分布研究是支持新药临床试验申请（IND）的关键环节。尽管腺相关病毒（AAV）载体已成为基因治疗的主要递送工具，但大型动物模型的生物分布检测仍面临方法学标准化不足的挑战。特别是与传统实时荧光定量PCR（qPCR）相比，微滴式数字PCR（ddPCR）技术虽具有绝对定量、高灵敏度和抗干扰能力强等优势，但其在大型动物模型中的应用验证范例十分稀缺。Göttingen小型猪作为非人灵长类动物的替代模型，因其生理结构、药物代谢与人类高度相似，且伦理争议小、繁殖能力强，正逐渐成为基因治疗研究的重要平台。然而，猪组织样本中存在大量抑制剂

  来源：The AAPS Journal

  时间：2025-09-27

• 系统性肥大细胞增多症中白细胞增多、单核细胞增多和嗜酸性粒细胞增多的表型、遗传学及预后分析：基于GREM注册库596例患者的研究

  在血液肿瘤领域，系统性肥大细胞增多症（Systemic Mastocytosis, SM）是一种罕见的髓系肿瘤，其特征是肥大细胞在骨髓等多个器官中异常聚集和增殖。尽管SM的诊断和治疗近年来取得了一定进展，但患者临床表现异质性大，预后差异显著，尤其是晚期SM（Advanced SM, AdvSM）患者生存率较低，这给临床管理带来巨大挑战。值得注意的是，许多SM患者常伴随外周血细胞计数异常，例如白细胞增多、单核细胞增多和嗜酸性粒细胞增多（L/M/E），但这些现象与疾病表型、遗传学改变以及预后的具体关联尚未得到系统研究。因此，深入探讨L/M/E在SM中的意义，对于疾病分层、预后评估及治疗策略制定具有

  来源：The Journal of Allergy and Clinical Immunology: In Practice

  时间：2025-09-27

• 儿童重症哮喘生物制剂治疗的真实世界依从性分析及其临床结局关联研究

  在儿童重症哮喘治疗领域，生物制剂（Biologics）的出现为传统吸入性糖皮质激素（ICS）控制不佳的患者带来了新的希望。这类靶向药物能显著改善哮喘症状、肺功能指标和急性发作频率，但一个关键问题始终悬而未决：孩子们能否坚持使用这些需要注射的生物制剂？以往研究表明，患儿对常规吸入药物的依从性往往不尽如人意，那么对于更新、更复杂的生物疗法，他们的实际用药行为又如何？这不仅关系到治疗效果，更直接影响临床决策和医疗资源分配。为了解开这个谜团，由Steven J. Rose、Aisaku Nakamura、Md Monir Hossain、Theresa W. Guilbert和Rachelle R.

  来源：The Journal of Allergy and Clinical Immunology: In Practice

  时间：2025-09-27

• FIP评分系统：开发与验证用于筛查FIP1L1::PDGFRA相关高嗜酸性粒细胞综合征的新型工具

  在血液系统疾病领域，高嗜酸性粒细胞综合征（Hypereosinophilic Syndrome, HES）是一组以外周血和组织中嗜酸性粒细胞异常增多为特征的异质性疾病。其中，由FIP1L1与PDGFRA基因融合（F/P融合基因）驱动的HES亚型虽然罕见，却是唯一对酪氨酸激酶抑制剂伊马替尼治疗高度敏感的类型。然而，F/P融合基因检测作为一线诊断手段，在实际临床应用中存在明显局限性：其诊断性能不佳，且检测成本高昂，导致许多患者面临不必要的检查负担和医疗资源浪费。这一矛盾凸显了开发高效筛查工具的必要性——如何精准识别最需要接受F/P检测的患者群体，成为临床实践中的关键问题。针对这一挑战，由Romai

  来源：The Journal of Allergy and Clinical Immunology: In Practice

  时间：2025-09-27

• Remibrutinib治疗慢性自发性荨麻疹：疗效、安全性及生活质量改善的系统评价与Meta分析

  慢性自发性荨麻疹（Chronic Spontaneous Urticaria, CSU）是一种以反复发作的风团和瘙痒为特征的免疫介导性皮肤病，全球约有1%的人口受其困扰。该疾病不仅严重影响患者的生活质量，还常常对常规治疗如抗组胺药甚至奥马珠单抗（omalizumab）产生耐药性，成为临床治疗的一大难题。在这一背景下，靶向新的信号通路、开发更高效且安全的治疗药物成为当前研究的重点。近日，一项发表于《The Journal of Allergy and Clinical Immunology: In Practice》的系统评价与Meta分析研究，深入探讨了Remibrutinib——一种新型布鲁

  来源：The Journal of Allergy and Clinical Immunology: In Practice

  时间：2025-09-27

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