• 工程化诱导型接合质粒：开启可调控水平基因转移的抗微生物新策略

  引言：全球健康危机与创新解决方案抗菌素耐药性正成为全球健康的持续性威胁，包括细菌和真菌在内的多种微生物对所有已知抗微生物药物产生耐药性的能力令人震惊。近年来，由于对抗真菌治疗耐药性的上升，真菌病原体已成为重大威胁。世界卫生组织(WHO)在2022年发布了首份真菌优先病原体清单，凸显了全球范围内真菌感染带来的巨大公共卫生风险。农业领域同样面临挑战，植物病原真菌的抗药性威胁着全球粮食安全。目前，基于细菌接合作用的新型抗微生物药物正在开发中。这是一种需要直接细胞间接触的自然水平基因转移机制。该过程利用IV型分泌系统(type IV secretion system)递送DNA，包括编码对目标受体有毒

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 基于全基因组测序的沙门氏菌耐药性监测准确性提升：一项流行病学框架研究

  Abstract全基因组测序（WGS）技术在细菌抗菌药物耐药性（AMR）监测领域展现出显著优势，但其检测准确性受生物信息学分析参数设置的显著影响。本研究基于加拿大禽类生产监测系统中收集的1633株海德堡和肯塔基沙门氏菌分离株的全基因组数据，采用StarAMR耐药基因预测工具，通过系统调整基因覆盖度（COV）和核苷酸一致性（ID）参数，评估不同参数组合对AMR预测准确性的影响。研究结果通过回归模型控制混杂因素后显示，参数设置对预测敏感性和特异性存在微小但显著的影响，且这种影响因血清型和药物类别而异。1. Introduction抗菌药物耐药性（AMR）已成为全球公共卫生重大威胁，世界卫生组织呼吁

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 加拿大零售肉类中艰难梭菌的监测及其与社区获得性人类感染的基因组关联研究

  Abstract社区获得性艰难梭菌感染（CA-CDI）在加拿大持续引发关注，占加拿大医院感染监测计划（CNISP）报告病例的四分之一。本研究从加拿大零售猪肉（3/219, 1.4%）和牛肉（0/99, 0%）中分离出产毒艰难梭菌，通过PCR核糖体分型（PCR ribotyping）和全基因组测序（WGS）鉴定为ST1/RT027、ST8/RT002和ST10/RT015型，这些型别均曾从加拿大CA-CDI患者中分离。肉类分离株对测试抗菌药物普遍敏感，仅一株对克林霉素呈中介耐药。基因组分析显示，两个猪肉分离株与人类临床CA-CDI分离株通过核心基因组多位点序列分型（cgMLST）聚类，单核苷酸变

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 肉鸡盲肠微生物组与抗菌饲养方案及性别差异的关联研究及其对抗菌素耐药性(AMR)的启示

  引言在禽类生产中，抗菌剂使用(AMU)与改善生长性能、成本效益、饲料转化率、疾病预防和通过调节微生物群维护肠道健康相关。然而，过度的AMU导致了细菌中抗菌素耐药性(AMR)的上升。细菌通过水平基因转移(包括结合质粒和转座子等移动遗传元件)交换遗传信息，包括抗菌素耐药性基因(ARGs)。头孢噻呋是一种仅用于动物的β-内酰胺类第三代头孢菌素抗生素，通常注射到一日龄雏鸡或蛋中以预防由大肠杆菌引起的卵黄囊感染，这可能导致选择出头孢噻呋耐药的大肠杆菌。涉及blaCMY-2基因的耐药机制可能诱导其他细菌对其他人用重要药物(如头孢曲松和头孢霉素)产生耐药性。据报道，鸡肉产品中的头孢噻呋耐药海德堡沙门氏菌与人

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 比较宏基因组学揭示传统与自然畜牧生产系统中抗菌药物耐药基因丰度的有限差异

  Abstract该研究从“One Health”视角出发，针对畜牧业中抗菌药物耐药性（AMR）的发展与传播问题，采用宏基因组学方法比较了自然（NAT）和传统（CONV）生产系统对肉牛、猪和肉鸡肠道微生物组及耐药组的影响。结果表明，在牛中，CONV系统的Bacteroidetes、Euryarchaeota和Spirochaetes菌门更丰富（q 0.05）。抗菌药物耐药基因（ARG）的类别在不同畜牧物种中均未受AMU影响，但猪的多种四环素耐药基因在CONV中更丰富（q < 0.05）。研究结论认为，停止AMU未必会在单一生殖周期内立即降低ARG的丰度或多样性。Introduction抗菌药物

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 即食冷冻核果中第三代头孢菌素和碳青霉烯类耐药肠杆菌目细菌的灵敏检测与回收方法的开发及评估

  引言抗菌素耐药性（AMR）是一个紧迫的全球公共卫生问题，导致住院时间延长、医疗成本上升和高死亡率。世界卫生组织（WHO）将产超广谱β-内酰胺酶（ESBL）和碳青霉烯酶（CP）的肠杆菌目（ESBL-EB和CP-EB）列为重点研究和应对的耐药菌。ESBL能介导对包括第三代头孢菌素（3GCs）在内的多种β-内酰胺类抗生素的耐药性，而CP则能水解包括碳青霉烯类（最后一道防线抗生素）在内的所有β-内酰胺类药物，导致治疗选择极为有限。食物，特别是即食（RTE）食品，作为AMR传播的潜在载体，其作用尚未被充分了解。因此，开发灵敏的方法来检测和回收食品中的这些耐药菌，对于评估其风险和完善监测体系至关重要。材料

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 无抗生素养猪场农业生态系统中可存活肠杆菌科与肠球菌的评估及其耐药性传播机制研究

  引言抗菌素耐药性（AMR）是全球公共卫生的重大威胁，农业实践中抗生素及其他生物杀菌剂的使用对人类、动物和植物健康均产生深远影响。本研究旨在评估加拿大魁北克省一家无抗生素养猪场的农业生态系统中，作为耐药标志菌的肠杆菌科和肠球菌在不同基质中的水平，包括饲料、粪便、粪肥、农田土壤、溪流水体及沉积物以及邻近森林土壤。通过分析这些样本，研究试图揭示AMR在农场与环境间的传播机制及热点区域。材料与方法样本采集于2022年秋季、2023年春季和秋季以及2024年春季，覆盖了猪的整个生产周期，包括母猪、断奶前仔猪、育肥初期和末期猪只的饲料和粪便。环境样本则包括粪肥、农田土壤、森林土壤、水体及沉积物。所有样本均

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 非洲特有羊肚菌新种Morchella capensis sp. nov.的发现及其生态学意义

  科研人员在南非开普植物区（Cape Floristic Region）的春季观测到一种生长于濒危山龙眼科（Proteaceae）植物下的羊肚菌属（Morchella）真菌。该真菌兼具羊肚菌属典型的隐存特征与广泛的表型表达多样性。鉴于其独特生态位及非洲从未记载过特有羊肚菌物种的背景，研究者推测这可能是一个新物种。通过关键基因区域测序、系统发育分析和形态学研究，最终证实这是一种前所未有的羊肚菌新种——被命名为Morchella capensis sp. nov.（开普羊肚菌）。从子实体下方采集的根系样本显示出多种根际活动特征，暗示其可能与宿主植物存在共生关系。值得注意的是，该物种在南非开普半岛具有

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 饲料添加鼠李糖乳杆菌LGG对接种大西洋鲑的微生物组及杀鲑气单胞菌攻毒抗性的初步研究

  Abstract 0.05）。然而，感染显著改变了皮肤黏液和粪便微生物组：例如，皮肤黏液中的Clostridium sensu stricto从3.14%增至9.20%，粪便中从1.39%增至3.74%（P < 0.05）；粪便中的Aeromonas从0.02%增至0.60%（P < 0.05）；Photobacterium从未被检出（0%）增至52.16%（P < 0.01），而Aliivibrio则从67.21%降至0.71%（P < 0.01）。感染后，LGG组皮肤黏液中的Lactococcus（9.93%）和Lactobacillus（2.11%）显著高于其他组（分别为4.14%和1.

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 鲍曼不动杆菌复合体对氯己定二葡糖酸盐耐受性机制及分子流行病学研究

  研究人员针对鲍曼不动杆菌复合体中不同物种对氯己定二葡糖酸盐（CHG）的耐受性差异展开深入探索。通过对889株菌株的分析发现，鲍曼不动杆菌（A. baumannii）占比最高（84.2%），且对测试抗生素普遍耐药，而其他三种物种（A. nosocomialis、A. pittii和A. seifertii）则相对敏感。值得注意的是，CHG耐受菌株的比例在鲍曼不动杆菌中高达92.1%，远高于其他物种。在分子机制层面，与标准菌株ATCC 19606相比，耐受CHG的鲍曼不动杆菌表现出qacEΔ1、fabI及外排泵相关基因的上调表达，同时oprD基因表达下降。其他物种则呈现特异性表达模式：A. nos

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 加拿大肉鸡源普通大肠杆菌的基因型多样性、致病型分布及耐药基因组特征研究

  Abstract85%）。超过95%的β-内酰胺类、氟喹诺酮类和酚类耐药基因被预测为质粒携带。魁北克省分离株的每个基因组中耐药决定簇数量最高，而与β-内酰胺耐药相关的基因在卑诗省的分离株中更常见。加拿大禽类中的普通大肠杆菌具有高度多样性，可携带具有临床意义的致病型相关毒力因子和耐药决定簇，存在演变为致病菌株的风险。Introduction大肠杆菌是肠杆菌科成员，是动物和人类胃肠道的正常栖息菌。致病性大肠杆菌菌株因携带特定毒力因子和产生多种毒素，可引起人类多种疾病，包括腹泻性感染和肠外感染。大肠杆菌致病型根据感染部位和特定疾病进行区分，肠道致病型包括产肠毒素大肠杆菌（ETEC）、肠致病性大肠杆菌

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 癌症患者阿片类药物处方趋势与疼痛评分：大型医疗系统2016-2020年回顾性研究

  背景阿片类药物管理政策的实施可能对癌症患者的疼痛管理产生不利影响，但癌症患者同样面临阿片类药物相关危害的风险。本研究旨在确定2016年至2020年间癌症患者按临床分层和疼痛分层的阿片类药物处方趋势。方法这项回顾性研究在康涅狄格州大型医疗系统（Yale New Haven Health System）中进行，纳入2016-2020年新诊断癌症且未使用过阿片类药物的成年患者（N=10,232）。通过肿瘤登记处识别患者，从电子健康记录（EHR）获取治疗和处方数据。研究使用逻辑回归计算2016-2020年阿片类药物处方预测概率的变化，重点分析两个亚群：接受手术治疗的患者（n=4405）和转移性癌症患者

  来源：Cancer

  时间：2025-09-23

• 跨越数据流：通过数据标准与实施策略提升"同一健康"基因组学数据质量与整合水平

  应对复杂数据模型的挑战加拿大抗菌耐药基因组研究与发展计划（GRDI-AMR）及其"同一健康"扩展项目（GAOH）采用基因组学方法研究医疗保健、食品生产和环境因素对抗菌素耐药性（AMR）产生和传播的影响。整合跨越"同一健康"连续体的基因组学背景数据流面临巨大挑战，主要体现在数据范围、内容和结构的多样性方面。细菌分离株全基因组测序（WGS）工作流程中涉及的实体和过程极为复杂，包括采样事件、样本、生物体、分离株、文库制备和测序等多个环节，这些环节之间存在一对多的关系，对扁平化的表格数据管理系统构成显著挑战。数据标准集成策略的创新实践基于对GAOH网络合作伙伴数据管理需求的分析，研究团队提出了三种主要

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 非伤寒沙门氏菌肠炎亚种血清型之间的质粒接合能力存在差异

  本文探讨了在不同血清型的*Salmonella enterica*中，IncI1质粒传播的差异性及其影响因素。*Salmonella*作为一种重要的食源性病原体，其与多重耐药性相关的质粒传播对公共卫生构成重大挑战。研究通过实验方法，评估了IncI1质粒在40种*Salmonella*菌株中的传播效率，并分析了环境条件、细胞表面特征以及菌株生长特性对质粒传播的影响。研究中使用的供体菌株为*Salmonella enterica* ser. Kentucky，该菌株携带一种赋予其对第三代头孢菌素（如头孢噻肟和头孢曲松）耐药性的IncI1质粒。通过使用固相接合实验，研究人员发现，37种受体菌株能够成

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 综述：加拿大环境中抗菌素耐药性发生情况的范围综述

  Abstract抗菌素耐药性（AMR）已成为影响人类、动物和环境健康的全球性挑战。环境作为抗生素耐药菌（ARB）和抗生素耐药基因（ARGs）的储存库与传播途径，其作用日益受到关注。本研究通过范围综述和系统思维方法，系统分析了加拿大水体、土壤和生物气溶胶中AMR的分布特征与传播路径。研究构建的系统图谱揭示了AMR在环境介质中的复杂交互网络，其中废水处理厂和商业畜禽养殖设施是当前主要研究热点，而零售业等环节仍存在显著数据缺口。总计纳入103项水体研究、67项土壤研究和12项空气研究，指出需通过跨学科合作完善AMR环境传播机制的理解。Introduction抗生素在人类医疗、畜禽养殖和农作物保护中的

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 抗菌耐药性海德堡沙门氏菌在新鲜松木刨花垫料微环境中的生存动力学与基因组演化研究

  引言肉鸡养殖普遍采用植物源性垫料材料，其中松木刨花（Pine Wood Shavings, PWS）因成本效益和促进禽类健康性能的特性，在欧美国家广泛应用。垫料作为禽类排泄物吸收和行为活动的基质，其微生物组成直接影响食源性病原菌的传播风险。管理实践特别是垫料使用方式（新鲜垫料与重复使用垫料）显著影响沙门氏菌等病原体的定植动态。海德堡沙门氏菌（Salmonella Heidelberg）作为引起人类沙门氏菌病的重要血清型，常呈现多重耐药特性，且其携带可移动遗传元件的能力使其成为AMR传播的重要载体。因此，解析S. Heidelberg在垫料环境中的生存机制及AMR进化规律，对制定"One-Hea

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 综述：M13噬菌体作为一种多功能平台，可通过基因工程用于新型材料的开发

  M13噬菌体作为生物材料在多个领域的应用研究进展一、M13噬菌体的生物学特性与工程化潜力M13噬菌体是一种非溶菌丝状噬菌体，其独特的纳米级杆状结构（直径6纳米，长度880纳米）和稳定的自组装特性，使其成为生物材料工程的理想模板。该噬菌体由11种蛋白质组成，其中pVIII蛋白占据98%的病毒质量，形成紧密排列的衣壳结构，为表面功能化提供了广阔平台。pIII蛋白作为主要受体蛋白，其暴露的N端结构域和可变区域（VHR）为外源蛋白的展示提供了高自由度空间。这种天然液晶行为使其能够通过简单的溶液处理形成有序的三维结构，为制造宏观材料奠定了基础。二、规模化生产与纯化技术优化工业级M13噬菌体的生产已形成标

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 综述：从模式到预测：机器学习与抗真菌耐药性生物标志物的发现

  抗真菌耐药性的全球挑战与机器学习介入契机真菌病原体对人类健康、农业及生态系统构成重大威胁，其感染尤其在免疫缺陷人群中引发高发病率与死亡率。随着抗真菌耐药性（AFR）的日益加剧，现有治疗手段效果受限，亟需创新策略应对。传统AFR生物标志物发现依赖实验室对比与靶向突变，但存在耗时长、操作依赖性强等局限。机器学习（ML）作为人工智能的核心分支，通过分析海量数据模式，为AFR研究带来突破性进展。抗真菌耐药性的机制与紧迫性AFR问题在临床与环境环境中日趋严峻。抗真菌药物种类有限，主要分为三类：多烯类（破坏细胞膜固醇）、棘白菌素类（抑制1,3-β-d-葡聚糖合成）及唑类（抑制麦角固醇合成）。耐药机制包括内

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 综述：白色念珠菌（Candida albicans）：一种重要人类病原体的研究历史概述

  白色念珠菌（Candida albicans）是一种重要的机会性致病真菌，被世界卫生组织列为“严重优先”病原体。它可引起从口腔念珠菌病（鹅口疮）到致命的侵袭性念珠菌病等多种感染。其致病性与其作为人类黏膜（如口腔、胃肠道和泌尿生殖道）共生菌的独特生活方式密切相关，一旦宿主免疫系统受损（如因癌症化疗、器官移植或使用皮质类固醇），或微生物组平衡被抗生素打破，或使用留置导管（为其生物膜形成提供表面），它便会转化为病原体。早期对白色念珠菌细胞生物学的研究很大程度上借鉴了酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）的模式系统。然而，白色念珠菌的二倍体性质、缺乏稳定的质粒、CUG密码子重新分

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

• 综述：有效实施一体化“一体健康”抗菌素耐药性研究的考量与要求

  结构性障碍与研究缺口研讨会识别出实施OH AMR研究的普遍障碍，包括跨部门数据整合困难、资金与资源（如计算能力与存储）有限、以及跨学科协作不足。这些障碍导致数据难以互操作且缺乏行动性。研究缺口主要表现为“研究孤岛”——人类、动物、植物/作物及环境维度各自独立研究，却缺乏相互关联的实证。这源于合作不足、资源限制及部门特定任务不重叠，造成所谓的“OH”研究未能真正体现互联性。关键工具与原则为应对上述挑战，研讨会提出一系列工具与原则：跨学科性、人际关系与互惠合作OH研究需Intentional建立跨学科合作，基于尊重、信任与互惠原则。尤其需与受影响社区（如基础设施落后地区）共同设计研究，保障其数据所

  来源：Canadian Journal of Microbiology

  时间：2025-09-23

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