• 基于单细胞与空间组学DNA拷贝数分析的癌症亚克隆检测技术Clonalscope

  在癌症演进过程中，体细胞突变如拷贝数变异(Copy Number Alterations, CNA)的持续积累驱动了肿瘤内部异质性，直接影响治疗效果。解析具有遗传差异的亚克隆特征及其空间分布，成为揭示肿瘤进化机制和改善癌症治疗的关键突破口。最新开发的Clonalscope技术突破性地实现了基于拷贝数谱的亚克隆检测，适用于空间转录组和单细胞测序数据。该方法创新性地采用嵌套式中式餐馆过程(nested Chinese Restaurant Process)进行肿瘤亚克隆的从头识别，并能整合来自匹配的 bulk DNA测序数据的前验信息，显著提升亚克隆检测精度和恶性细胞标记准确性。在胃肠道肿瘤的单细

  来源：Nature Methods

  时间：2025-09-16

• 综述：携带两种碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌：分子研究现状

  摘要肺炎克雷伯菌是引发肺炎、败血症等感染的重要病原体。自20世纪90年代以来，耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌（CRKP）对全球公共卫生构成巨大威胁，其核心耐药机制是产碳青霉烯酶（KPC、NDM、OXA等）。近年来，携带双碳青霉烯酶的CRKP菌株日益增多，使耐药性更趋复杂。本文综述了CRKP主要碳青霉烯酶类型、全球传播特征及双酶组合的分子特性，强调全基因组测序技术在耐药研究中的关键作用。引言CRKP感染的死亡率高达37.2%。中国主要流行ST11型菌株，其70%携带KPC酶（如blaKPC-2），而欧美以ST258型为主。值得注意的是，双酶菌株（如同时含KPC和NDM）通过质粒水平转移（如IncFII/

  来源：ImmunoTargets and Therapy

  时间：2025-09-16

• 综述：靶向Delta样配体3（DLL3）在肺和胃肠胰神经内分泌癌中的新型疗法

  病理学分类与临床挑战20%）和侵袭性强为特征，5年总生存率不足5%，临床亟需突破性疗法。Notch通路与DLL3的生物学特性DLL3作为Notch通路非典型配体，在SCLC和GEP-NECs中特异性高表达。其独特之处在于无法激活Notch受体，反而通过内质网滞留促进肿瘤干细胞特性。免疫组化（IHC）检测显示≥1%肿瘤细胞染色即为阳性，高表达（≥75%）与不良预后相关。靶向策略的创新突破目前三大方向最具潜力：1.抗体偶联药物（ADCs）：如Rovalpituzumab tesirine通过抗DLL3抗体搭载DNA交联剂，但因毒性问题暂停开发；2.双特异性T细胞衔接器（BiTEs）：Tarlata

  来源：Cancer Treatment Reviews

  时间：2025-09-16

• 基于尿液有机酸代谢特征构建的Citrin缺乏症诊断模型及其代谢通路研究

  代谢特征解析研究团队通过气相色谱-质谱联用技术(GC-MS)对105例NICCD患者、144例健康对照(HC)和298例非特异性代谢异常(NAG)人群进行尿液代谢组学分析。正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)显示NICCD组存在39种差异代谢物，主要富集于五大通路：1.酪氨酸代谢：4-羟基苯乳酸(4-HPLA)和4-羟基苯丙酮酸(4-HPPA)水平显著升高，分别达到曲线下面积(AUC)0.954和0.9192.三羧酸循环(TCA)：α-酮戊二酸、苹果酸和富马酸排泄增加，反映线粒体能量代谢障碍3.硫辛酸代谢：2-氧代己二酸、丙酮酸等α-酮酸积累，提示相关脱氢酶复合体功能受损4.神经递质代谢：

  来源：Clinical and Translational Medicine

  时间：2025-09-16

• 综述：基于统一数字化平台推进大分子药物发现的数据分析与工作流管理

  大分子药物发现的数字化革命摘要随着抗体药物从杂交瘤技术发展到多特异性抗体和抗体-药物偶联物（ADC），传统分散式数据管理（如Excel手动处理）已无法应对高通量筛选产生的海量异构数据。本文提出统一数字平台的核心价值：通过集成工程设计、生产追踪、实验分析和AI预测，实现全流程自动化与数据可追溯性。引言过去50年，抗体发现技术历经三次革新：1975年杂交瘤技术突破、1980年代展示技术高通量化，以及近年机器人液体处理系统的普及。然而，数据碎片化问题日益凸显——不同仪器生成的文件格式各异，关键元数据在传递中丢失，导致分析效率低下。例如，尺寸排阻色谱（SEC）中IgG单体百分比计算需跨软件手动整合，耗

  来源：mAbs

  时间：2025-09-16

• 基于α-神经毒素广谱中和抗体的结构解析实现pH依赖性抗原结合抗体的理性设计

  这项突破性研究揭秘了对抗致命α-神经毒素(α-neurotoxins, α-NTX)的分子武器库。科研团队从能中和多种毒蛇毒素的广谱中和抗体(broadly neutralizing antibodies, bnAbs)入手，运用X射线晶体学技术捕捉到抗体-毒素复合物的精细三维结构。令人惊叹的是，研究发现抗体互补决定区(CDR)中特定组氨酸残基(His35)在酸性环境下会发生质子化，像智能开关般调控抗原结合能力。通过分子对接(Molecular docking)和表面等离子共振(SPR)验证，成功将这种pH敏感机制逆向工程到治疗性抗体中。这种会"认环境"的智能抗体在血液(pH 7.4)中保持强

  来源：mAbs

  时间：2025-09-16

• 综述：高浓度生物治疗药物粘度缓解的机制与预测性制剂开发

  粘度挑战的分子基础高浓度生物制剂普遍面临粘度飙升问题，当蛋白质浓度超过150 mg/mL时，溶液粘度可能呈指数级增长。研究发现，这种异常粘度主要源于三种分子作用力：电荷相关的静电相互作用（如pH依赖的DEAE基团排斥）、瞬态疏水缔合（通过荧光猝灭实验证实）、以及特异性Fab-Fab相互作用（通过氢氘交换质谱定位）。突破性预测模型最新开发的机器学习算法整合了12种分子描述符，包括：1.净电荷数（通过毛细管等电聚焦测定）2.疏水表面占比（HIC-HPLC定量）3.分子柔性参数（由HDX-MS动力学数据推算）该模型对28种临床阶段单抗的粘度预测准确度达R2=0.91，显著优于传统经验公式。创新性缓解

  来源：mAbs

  时间：2025-09-16

• 综述：利用PubChem等公共数据库进行2025年虚拟筛选的最新趋势分析

  引言化学信息学已成为现代药物发现的基石，其通过管理海量化学与生物数据，支撑了虚拟筛选（VS）的高效实施。公共数据库如PubChem、ZINC、ChEMBL等提供了涵盖小分子、天然产物、药物靶点的多元化信息，成为挖掘活性化合物的关键资源。2024-2025年的研究趋势显示，VS已从传统的相似性搜索扩展到整合机器学习（ML）和超大规模库（109分子）的智能筛选。公共数据库工具与化学空间分析PubChem作为NIH维护的综合性平台，整合了1.2亿化合物和2.96亿生物活性数据，其API和2D/3D相似性搜索功能支持快速数据集构建。ChEMBL则专注于生物活性注释，其ECFP4指纹分析显示，尽管库容增

  来源：Expert Opinion on Drug Discovery

  时间：2025-09-16

• 基于蛋白质-配体相互作用分析工具PLIP揭示靶向蛋白互作药物的结构基础

  背景蛋白-蛋白相互作用（PPI）的靶向抑制是药物开发中极具挑战性却前景广阔的领域。随着结构生物学的发展，蛋白质数据库（PDB）已收录约50万（部分冗余）蛋白互作界面和2200个靶向这些界面的药物样分子。然而，PPI界面通常比传统配体结合位点更大（1200-4500 Å2）且平坦，其多样性（如永久性或瞬时性）也增加了靶向难度。热点残基（hot spots）如Trp、Tyr和Arg的发现为小分子设计提供了突破口，这些残基能通过π相互作用、疏水接触和氢键等多种非共价作用稳定结合。研究方法研究团队采用蛋白质-配体相互作用分析工具PLIP 2.4版，系统分析了134,743个蛋白质-配体复合物和453个

  来源：Expert Opinion on Drug Discovery

  时间：2025-09-16

• 眼科药物研发新前沿：计算机模拟试验(In silico trials)的变革潜力与挑战

  在眼科药物研发领域，计算机模拟试验(In silico trials)正开启革命性篇章。这项技术不仅有望大幅降低研发成本和时间线，更能通过数字化手段优化患者安全性与治疗依从性。摘要引言：计算机模拟试验为眼科药物开发提供了前所未有的机遇，其核心优势在于突破传统临床试验的时空限制，通过算法模型模拟药物在眼部的代谢过程。研究领域：聚焦计算机模拟试验在创新性眼科药物发现中的双重价值——既涵盖缩短靶点筛选周期的潜力，也直面复杂眼解剖结构(如血-视网膜屏障)的建模挑战。专家观点：眼科领域正处于范式转换的关键节点：1.技术瓶颈：需克服多尺度生物学数据整合难题，特别是涉及角膜药物渗透性(corneal per

  来源：Expert Opinion on Drug Discovery

  时间：2025-09-16

• 综述：2025年审稿人致谢

  【学术灯塔的守护者】在医学知识爆炸的时代，《CA》期刊凭借严苛的学术标准屹立潮头。2024-2025年度，由52位国际顶尖学者组成的评审团队——包括肿瘤免疫学家Robert Ferris、血液学专家Ayalew Tefferi等——构建起学术质量的第一道防线。这些专家在稿件评审中展现出三大特质：对分子靶点（如PD-1/PD-L1）的敏锐洞察、对临床转化研究（Translational Research）的精准把握，以及平均48小时的超快审阅时效。【跨界智慧的碰撞】评审团队覆盖23个医学子领域：从Salvador Jaime-Casas的精准医疗（Precision Medicine）到Lind

  来源：CA: A Cancer Journal for Clinicians

  时间：2025-09-16

• 肾小管ACSM3缺失损害中链脂肪酸代谢并加剧肾脏纤维化的机制研究

  肾脏纤维化的进展暗藏代谢玄机！最新研究发现，肾小管上皮细胞中的中链酰基辅酶A合成酶家族成员3（ACSM3）扮演着关键角色。当这个代谢"守门人"功能缺失时，中链脂肪酸（MCFA）代谢网络就会崩溃，导致脂质堆积和线粒体能量工厂罢工。有趣的是，研究人员捕捉到一个代谢救援信号——十二烷酸（C12:0）。这种中链脂肪酸就像精准的代谢"钥匙"，需要ACSM3这个"锁匠"的加工才能发挥抗纤维化作用。动物实验显示，通过腺相关病毒（AAV）给ACSM3"加油"能显著改善肾脏纤维化，而特异性敲除这个基因则会加重病情。这项研究不仅揭示了ACSM3-MCFA代谢轴在肾脏纤维化中的核心地位，更为慢性肾脏病患者带来了双重

  来源：Proceedings of the National Academy of Sciences

  时间：2025-09-16

• Wnt抑制通过重塑肿瘤微环境增强抗PD1疗法在胶质母细胞瘤中的疗效

  Wnt抑制缓解胶质母细胞瘤抗PD1治疗耐药研究背景胶质母细胞瘤（GBM）作为最具侵袭性的脑肿瘤，中位生存期不足2年。尽管免疫检查点抑制剂（ICB）在多种癌症中取得突破，但所有针对GBM的III期临床试验均告失败。这种耐药性与GBM独特的免疫抑制微环境相关，包括髓系细胞浸润、抗原提呈缺陷等。Wnt通路作为神经发育和干细胞维持的关键调控者，其在GBM中的异常激活可能成为新的治疗靶点。Wnt7b在GBM中的关键作用通过对168例GBM患者的转录组分析，发现WNT7B在干细胞富集型肿瘤中表达最高。单细胞测序显示WNT7B主要存在于恶性细胞中，其高表达与M2型巨噬细胞极化相关。在70例患者组织芯片中，W

  来源：Proceedings of the National Academy of Sciences

  时间：2025-09-16

• 综述：斑马鱼作为光药理学模型的开发应用：光控光开关药物的生物学效应解析

  光药理学原理与目标光药理学通过光控技术实现对生物活性分子的精准调控，利用光开关分子（如偶氮苯衍生物）的可逆异构化特性，在特定波长照射下切换药物活性状态。该技术能规避传统药物治疗的耐药性和脱靶效应，其非侵入性特点尤其适用于斑马鱼胚胎等透明模型。斑马鱼研究工具箱斑马鱼（Danio rerio）因胚胎透明性成为光控药物研究的黄金标准：•发育优势：受精后5天即可完成器官形成，单次产卵200枚以上•光学特性：488nm蓝光可穿透胚胎直接激活光敏药物•基因编辑：CRISPR-Cas9技术已建立帕金森病（PD）和癫痫相关基因敲除模型•实时成像：心跳、血流等生理过程可通过荧光标记动态观测技术挑战与局限尽管优势

  来源：Drug Discovery Today

  时间：2025-09-16

• 综述：肌因子介导的肌肉-器官互作：分子机制与临床意义

  肌肉-肌肉对话骨骼肌通过分泌LIF、BDNF、IL-6等肌因子形成自我调控环路。IL-6在运动后循环水平激增100倍，通过AMPK通路促进葡萄糖摄取；肌肉特异性TRIM蛋白MG53通过调控TGF-β信号抑制成纤维细胞转化，显著减少瘢痕形成。肌肉-骨骼对话运动刺激触发肌骨因子双向分泌：irisin通过MAPK/p38/Akt轴促进成骨分化，同时抑制破骨细胞活性；骨源性骨钙素（osteocalcin）反向调节肌肉糖代谢，形成力学-化学耦合反馈环。肌肉-脂肪对话Irisin诱导白色脂肪棕色化（browning），通过UCP1介导产热效应；FGF21激活脂肪组织脂解酶ATGL，与肌肉分泌的myonec

  来源：Biochemical Pharmacology

  时间：2025-09-16

• HSP90特异性抑制剂PSY-2–12通过激活自噬改善细胞衰老：急性肾损伤的新型抗衰老靶点

  Highlight本研究首次证实HSP90特异性抑制剂PSY-2–12（PSY）通过激活自噬发挥抗衰老作用。在顺铂（CP）诱导的肾近端小管细胞（HK-2）和血管紧张素II（AngII）诱导的人脐静脉内皮细胞（HUVECs）衰老模型中，PSY显著降低β-半乳糖苷酶（SA-β-Gal）活性和p16表达，同时上调核纤层蛋白B1（lamin B1）。动物实验进一步显示PSY可降低AKI小鼠血清尿素、肌酐及肾损伤分子-1（KIM-1）水平。Mechanistic Insights机制研究表明，PSY通过增强beclin-1表达促进自噬流（autophagic flux）。当使用自噬抑制剂或敲低becli

  来源：Biochemical Pharmacology

  时间：2025-09-16

• cGAMP通过激活Nrf2/HO-1/GPX4通路减轻缺血性脑卒中氧化应激与铁死亡的双重神经保护机制

  HighlightcGAMP通过Nrf2/HO-1/GPX4通路减轻缺血性脑卒中氧化应激与铁死亡Reagent本研究使用以下试剂：cGAMP（杭州新奥生物）、线粒体超氧化物荧光探针（MT14）、活性氧（ROS）检测试剂盒（BL714A）、谷胱甘肽（GSH）检测试剂盒（BL874A）、Nrf2抑制剂ML-385等。cGAMP减少MCAO小鼠脑梗死体积并改善神经运动功能TTC染色显示，cGAMP高剂量组较依达拉奉组更显著缩小脑梗死面积（图1A-B）。Longa评分、悬尾测试等行为学实验证实cGAMP可改善神经运动功能障碍，且效果呈剂量依赖性。Discussion本研究发现cGAMP通过STING非

  来源：Biochemical Pharmacology

  时间：2025-09-16

• piR-hsa-35410通过调控PFKL介导的糖酵解促进三阴性乳腺癌恶性进展的机制研究

  Highlight本研究首次证实piR-35410在TNBC中通过调控PFKL介导的糖酵解通路驱动肿瘤恶性进展，为开发靶向piRNA-代谢轴的新型治疗策略提供理论依据。ResultspiR-35410在TNBC中显著高表达并增强恶性表型与糖酵解水平piRNA测序显示TNBC组织中piR-35410表达显著升高（图1A）。RT-qPCR验证37对临床样本中该piRNA在癌组织的上调趋势（图1B）。功能实验表明，敲低piR-35410可抑制BT-549和MDA-MB-231细胞的克隆形成、迁移能力及糖酵解关键产物生成（乳酸和ATP），而过表达则呈现相反效应（图1C-E）。机制研究揭示piR-354

  来源：Biochemical Pharmacology

  时间：2025-09-16

• 综述：咖啡对肝脏的保护作用：机制研究

  咖啡对肝脏的保护作用：机制研究1.引言肝脏作为代谢中枢，易受病毒（HBV/HCV）、酒精、高脂饮食等因素损伤。咖啡作为全球广泛消费的饮品，其生物活性成分（咖啡因、绿原酸、咖啡醇等）通过多靶点机制缓解肝损伤。2.肝病与咖啡消费的关系2.1 病毒性肝炎咖啡摄入（≥3杯/日）可降低HCV患者肝纤维化进展风险40%，并通过抑制NF-κB和STAT通路改善干扰素治疗应答。HBV感染者中，咖啡降低肝癌（HCC）风险，可能与调节IL-28B基因相关。2.2 酒精性肝病（ALD）咖啡通过抑制NADPH氧化酶（NOX）减少活性氧（ROS）生成，降低酒精诱导的TNF-α和IL-6水平，显著改善血清ALT/AST指

  来源：Biochemical Pharmacology

  时间：2025-09-16

• 芦丁通过抑制病毒入侵与复制发挥抗日本脑炎病毒作用及神经保护机制研究

  日本脑炎病毒(JEV)作为黄病毒科(Flaviviridae)的重要病原体，威胁着全球超30亿人口健康。尽管疫苗已投入使用，但特效抗病毒药物仍属空白。这项研究聚焦菊苣酸(CA)和芦丁的抗病毒潜能，通过体外实验发现：两种化合物在11.03-26.84 µM的IC50范围内，既能直接灭活病毒颗粒，又能阻断JEV入侵宿主细胞的进程。更令人振奋的是，它们剂量依赖性地降低了SH-SY5Y细胞内的病毒载量、细胞凋亡比例和活性氧(ROS)水平。动物实验数据更凸显芦丁的卓越表现——50 mg/kg剂量组的小鼠不仅存活率显著提升，脑组织中的感染性病毒颗粒、病毒RNA和NS3蛋白表达均明显减少。深入机制揭示，芦丁

  来源：Journal of Neuroimmune Pharmacology

  时间：2025-09-16

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