• 基于迁移学习与置换不变性的复杂系统全基因组细胞特异性干预效应预测模型SETComp构建与应用验证

  1 引言随着人工智能和高通量组学技术的发展，研究者对疾病机制和药物开发等生物医学问题的理解日益深入。单一药物往往难以应对复杂疾病的复杂机制，基于多药物或天然产物（NP）等复杂系统的联合疗法逐渐成为研究热点。然而，相较于单化合物靶点预测，复杂系统靶点预测需整合化合物间相互作用、副作用等信息，且面临成分数量不确定的挑战。现有复杂系统预测算法存在局限性，如无法基于特定实体（如靶细胞）预测、预测精度低、无法进行方向性预测及依赖先验知识等。当前，单化合物干预转录组学数据（如LINCS项目的CMap）积累丰富，而复杂系统干预数据相对稀缺。迁移学习作为深度学习技术，在样本量有限的场景中具有良好适用性。同时，

  来源：Advanced Science

  时间：2025-09-21

• 新型集成125I粒子近距离放疗与多柔比星化疗的输尿管支架：从体外到体内的协同抗肿瘤机制研究

  引言输尿管癌（UC）作为泌尿系统恶性肿瘤，预后较差且死亡率高达24.6%。目前肾输尿管全切术是标准治疗方案，但对高龄、麻醉禁忌或拒绝手术的患者仅能采用姑息性输尿管支架植入。传统支架缺乏抗肿瘤功能，开发兼具引流与治疗功能的新型支架成为重要研究方向。聚氨酯（PU）材料因其良好生物相容性和载药特性，与多柔比星（DOX）载药系统及125I粒子近距离放疗（ISB）技术结合，可形成协同抗肿瘤效应。材料与方法支架设计与制备新型IUS采用双腔结构设计，长20cm，直径6F，两端为双J型结构。其中一腔容纳10颗125I粒子（直径0.8mm×长度4.8mm，半衰期59.6天），另一腔为引流通道。支架表面通过超声喷

  来源：Bioengineering & Translational Medicine

  时间：2025-09-21

• 工程化益生菌通过分泌PCSK9纳米抗体与调节肠道菌群改善高脂血症和动脉粥样硬化的作用与机制研究

  工程化益生菌的构建与表征研究团队通过密码子优化获得了人源PCSK9纳米抗体VHH-B11的序列，并将其与四种不同信号肽（NSP4、dsbA、pelB、phoA）组合，构建了重组质粒pUC19-tac-信号肽-PCSK9nb。Western blot分析表明，携带NSP4信号肽的工程菌EcN/PCSK9nb能够最有效地将PCSK9nb分泌至培养上清液中。透射电镜显示工程菌形态未发生改变，生长曲线与野生型EcN无显著差异，表明外源基因的导入未影响细菌的基本生理特性。PCSK9nb的表达与功能验证Co-IP实验证实，EcN/PCSK9nb分泌的PCSK9nb能够特异性结合小鼠PCSK9蛋白。通过EL

  来源：Bioengineering & Translational Medicine

  时间：2025-09-21

• 单细胞测序揭示CD8Teff细胞活化作为三阴性乳腺癌免疫治疗预测新标志物

  三阴性乳腺癌（TNBC）作为乳腺癌中最具侵袭性的亚型，长期以来面临治疗选择有限和预后不良的困境。尽管免疫检查点抑制剂（ICIs）的出现为TNBC患者带来了新的希望，但肿瘤免疫微环境（TME）的高度异质性使得疗效预测变得异常困难。传统基于CD8+T细胞浸润程度的"热肿瘤"和"冷肿瘤"分类方法存在明显局限性——部分患者即使显示高CD8+T细胞浸润，仍对免疫治疗无响应，这表明单纯细胞数量并不能完全反映免疫功能状态。这种预测瓶颈严重制约了免疫治疗在TNBC中的精准应用，亟需发现更可靠的生物标志物来指导临床决策。为了突破这一困境，研究人员在《Molecular Biomedicine》发表了一项开创性研

  来源：Molecular Biomedicine

  时间：2025-09-21

• 无还原剂生物合成银纳米粒子功能化细菌纳米纤维素复合材料：基于耐银中间醋酸杆菌的栽培与后处理一体化策略

  Highlight本研究首次利用耐银中间醋酸杆菌（Acetobacter intermedius）G7，通过栽培阶段银离子原位还原与碱性后处理相结合的双相生物合成策略，实现了完全由微生物和内源生物聚合物驱动的银纳米粒子（SNP）功能化细菌纳米纤维素（BNC）复合材料制备，无需任何外部还原剂。Bacteria strain and culture conditions本研究采用的A. intermedius G7是一株从腐败葡萄渣中分离得到的新型耐银菌株，现存于本实验室微生物培养物保藏库。该菌株可同时产生细菌纳米纤维素（BNC）和乙酰聚糖（acetan）。除特别说明外，菌株均在Hestrin–S

  来源：International Journal of Biological Macromolecules

  时间：2025-09-21

• 基于马铃薯皮过氧化物酶（PP）的聚甲基丙烯酸酸水凝胶生物催化制备及其抗炎潜力初探

  HighlightDSC、XRD和FTIR分析通过自由基聚合法合成的PMAA水凝胶，其由H2O2/PP/VC引发的聚合机制如图2所示。过氧化氢与过氧化物酶反应使其转化为活性形态，进而将维生素C氧化为抗坏血酸自由基。形成的抗坏血酸自由基促使单体（甲基丙烯酸）分子中的C=C键断裂，从而启动MAA聚合过程。具体而言，过氧化氢氧化...结论采用基于过氧化氢（H2O2）、维生素C（VC）和马铃薯皮过氧化物酶（PP）的环保引发体系，成功在环境条件下合成了PMAA水凝胶。该方法将反应时间和H2O2用量较无PP的引发体系减少约三倍，仅需30.0μL H2O2即可在8小时内完成聚合。FTIR证实了水凝胶的化学组

  来源：International Journal of Biological Macromolecules

  时间：2025-09-21

• TRIM21通过激活BRD4介导的内皮细胞自噬缓解脓毒症相关凝血病

  AbstractPurpose探究三结构域蛋白21（TRIM21）在脓毒症相关凝血病（SAC）中调控自噬的作用与机制。Method构建TRIM21和溴结构域蛋白4（BRD4）的过表达载体、si-BRD4及空载体，转染至人微血管内皮细胞（HMEC-1）。体外实验中，采用脂多糖（LPS）（40 μg/mL）联合尼日利亚菌素（Nigericin）（20 μM）处理细胞0.5小时建立脓毒症模型。通过酶联免疫吸附试验（ELISA）检测炎症与凝血因子水平；流式细胞术测定细胞内活性氧（ROS）水平及细胞凋亡；免疫共沉淀（CO-IP）验证TRIM21对BRD4泛素化的影响。体内实验采用盲肠结扎穿孔（CLP）法

  来源：International Immunopharmacology

  时间：2025-09-21

• SMC4通过抑制cGAS-STING通路与稳定PD-L1蛋白双重调控三阴性乳腺癌免疫逃避机制研究

  三阴性乳腺癌（TNBC）作为乳腺癌中最具侵袭性的亚型，因其缺乏雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）和人类表皮生长因子受体2（HER2）表达，治疗手段有限且预后较差。尽管免疫检查点抑制剂（ICIs）尤其是PD-1/PD-L1抑制剂在多种癌症治疗中取得突破，但在TNBC中的应用仍面临响应率低、耐药性强的挑战。肿瘤免疫微环境（TME）的抑制性特征以及免疫细胞功能障碍是导致疗效不佳的关键因素。因此，深入探索TNBC免疫逃避的分子机制，寻找新的治疗靶点和生物标志物，成为当前研究的迫切需求。在此背景下，哈尔滨医科大学肿瘤医院张清媛教授团队在《International Immunopharmacolog

  来源：International Immunopharmacology

  时间：2025-09-21

• 补体C6缺陷通过破坏膜攻击复合物形成和增强M2样肿瘤相关巨噬细胞反应加剧结直肠肿瘤发生

  在当今肿瘤研究领域，结直肠癌(CRC)作为全球癌症相关死亡的第二大原因，其发病机制和治疗方法一直是医学界关注的焦点。尽管在早期检测和治疗手段方面取得了进展，但晚期CRC患者的预后仍然不容乐观。肿瘤微环境(TME)作为肿瘤发生、发展和治疗反应的关键调节者，其中免疫景观的不平衡，特别是免疫抑制性免疫细胞和炎症介质的优势存在，为肿瘤生长和转移提供了便利条件。补体系统作为先天免疫的重要组成部分，近年来被发现在肿瘤免疫中扮演着关键调节者的角色。然而，在CRC中，补体系统的具体作用机制尚未完全阐明。特别是补体成分C6，作为终端膜攻击复合物(MAC)形成不可或缺的组成部分，其在CRC中的作用更是知之甚少。研

  来源：International Immunopharmacology

  时间：2025-09-21

• IL-1β预处理骨髓间充质干细胞外泌体通过调控SIRT6/NLRP3通路促进皮肤创伤修复的研究

  Isolation and identification of exosomes通过透射电镜（TEM）和纳米颗粒追踪分析（NTA）对骨髓间充质干细胞来源的外泌体（BMSC-exos）和IL-1β刺激的骨髓间充质干细胞来源的外泌体（IL-1β-BMSC-exos）进行了形态和粒径表征。分离得到的外泌体呈现典型的杯状结构，直径范围在30至150纳米之间（图1A-B）。Western blot分析确认了外泌体标志物CD9、CD63和TSG101的存在（图1C）。免疫荧光染色进一步验证了这些结果。Discussion皮肤创伤愈合是一个高度协调的生物学过程，涉及多种细胞类型、复杂信号通路、众多调控因子及

  来源：International Immunopharmacology

  时间：2025-09-21

• 评估噬菌体pK8与多粘菌素B联合用药对抗临床多重耐药肺炎克雷伯菌的体外协同效应及药效学模型研究

  在全球公共卫生领域，多重耐药革兰阴性菌的蔓延已构成严峻挑战。其中，肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)作为关键病原体，引发的严重感染常伴随高发病率与死亡率。传统抗生素研发速度迟缓，而现有治疗方案效果有限，促使科学家将目光转向替代疗法。噬菌体治疗——一种利用特定病毒精准攻击细菌的方法——重新进入医学视野。尽管噬菌体疗法在东欧已有近百年历史，但其应用仍面临巨大障碍：高度特异性导致抗菌谱狭窄，细菌快速产生耐药性，以及个体化治疗的复杂性。为突破这些局限，研究者开始探索将噬菌体与常规抗生素联合使用的策略。这种组合疗法有望发挥协同效应，克服单一疗法的不足。发表在《Internatio

  来源：International Journal of Antimicrobial Agents

  时间：2025-09-21

• 法国MBL（金属β-内酰胺酶）肠杆菌血流感染的流行病学、治疗及预后：一项回顾性多中心研究

  在全球抗生素耐药危机日益严峻的背景下，碳青霉烯耐药革兰阴性杆菌（CR-GNB）已成为公共卫生领域的重大威胁。其中，产金属β-内酰胺酶（Metallo-β-Lactamase, MBL）的肠杆菌目细菌尤其令人担忧，它们能够水解包括碳青霉烯类在内的几乎所有β-内酰胺类抗生素，导致治疗选择极度有限。血流感染（Bloodstream Infections, BSI）是其中最致命的感染类型之一，死亡率高达20-45%，占全球抗生素耐药相关死亡的70%以上。法国近年来面临MBL肠杆菌感染率显著上升的严峻挑战。根据法国国家耐药监测中心（F-NRC）数据，MBL在碳青霉烯酶肠杆菌（CPE）中的比例从2017年

  来源：International Journal of Antimicrobial Agents

  时间：2025-09-21

• 虾青素与塞来昔布联用对小鼠骨癌痛模型的协同镇痛作用研究：从行为学验证到靶点预测

  HighlightMethodThe experimental flow is shown in Fig. 1.（实验流程如图1所示）Establishment and evaluation of the BCP mouse model（骨癌痛小鼠模型的建立与评估）为评估骨癌痛（BCP）小鼠模型是否成功建立，我们在造模后第0、3、7、10、14和21天进行了疼痛行为学评估。行为学结果显示，与Naïve组和PBS组相比，BCP组小鼠在注射LLC细胞后的第7-14天，左后爪（荷瘤侧）对机械刺激的机械缩足阈值（MWT）显著降低（图2A），对冷痛刺激的缩足潜伏期（PWL）明显缩短（图2B）。Discu

  来源：International Immunopharmacology

  时间：2025-09-21

• 全球临床医生对噬菌体疗法的态度与实践：首项国际匿名调查研究

  Highlight噬菌体疗法作为应对全球抗菌素耐药性（AMR）威胁的有力工具，正通过跨学科临床实践推动治疗范式变革。本研究首次通过国际调查捕捉临床医生的真实态度与经验，为治疗标准化提供关键数据支撑。Materials and Methods我们通过专家论证和文献回顾设计了23个问题的调查问卷（补充材料；https://forms.gle/kbqVUvXstmBNVsHW8）。问卷包含三个部分：受访者 demographics（人口统计学特征）、对噬菌体疗法的态度以及实际治疗经验。调查中未对专业术语进行定义。在结果分析中，我们使用"hesitation（犹豫）"一词特指临床医生提出的具体顾虑，包

  来源：International Journal of Antimicrobial Agents

  时间：2025-09-21

• DDX3X通过调控NLRP3炎症小体活化与巨噬细胞焦亡对话介导痛风性炎症的新机制

  痛风作为一种自身炎症性疾病，全球发病率持续上升，其特征是关节内单钠尿酸盐(MSU)晶体沉积引发的急性炎症发作和自发缓解的独特临床过程。尽管MSU晶体通过激活NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NLRP3)炎症小体触发炎症 cascade的反应已被广泛认可，但驱动急性发作向自发缓解转变的内在分子机制仍是未解之谜。近年来，程序性细胞死亡的新形式——焦亡(Pyroptosis)被证实与痛风炎症密切相关。这种由炎症小体、Caspase家族和Gasdermin家族介导的细胞死亡方式，会导致细胞膜破裂和大量炎症因子(如IL-1β)释放，但焦亡在痛风动态病程中的具体调控机制尚不清楚。在此背景下，研究人员将目

  来源：International Immunopharmacology

  时间：2025-09-21

• 去铁胺通过激活HIF-1α/BNIP3介导的线粒体自噬和抑制铁死亡改善椎间盘退变

  Abstract背景(Background)椎间盘退变（IVDD）是导致腰背痛的主要原因，其特征包括软骨终板（CEP）退化、细胞外基质（ECM）降解和氧化应激。去铁胺（DFO）作为一种铁螯合剂，已被证明在治疗铁过载疾病中具有疗效。目的(Objective)本研究旨在系统探讨DFO在IVDD和铁死亡中的作用及分子机制。方法(Methods)我们采用生物信息学分析、体外细胞模型和体内小鼠IVDD模型进行研究。结果(Results)生物信息学分析鉴定出65个DFO与IVDD的共同作用靶点，涉及线粒体功能调控、氧化应激反应和HIF-1α信号通路。体外实验中，100 μM DFO逆转了叔丁基过氧化氢（T

  来源：International Immunopharmacology

  时间：2025-09-21

• YAP通过p300/CBP介导的FoxO3乙酰化调控自噬缓解四氯化碳急性肝损伤的作用机制研究

  Highlight本研究首次揭示YAP通过竞争性招募p300/CBP复合物，减少FoxO3的乙酰化修饰，从而增强其转录活性并促进自噬相关基因（如LC3）表达，最终缓解CCl4诱导的急性肝损伤。这一发现为靶向YAP-FoxO3自噬轴治疗化学性肝损伤提供了新策略。CCl4诱导的ALI触发YAP激活通过腹腔注射CCl4（1 mL/kg剂量溶于橄榄油）建立急性肝损伤模型。肝组织病理学（H&E染色）和血清ALT/AST水平随时间恶化，并在24小时达到峰值（图1A-D）。蛋白质免疫印迹分析显示，内源性YAP随CCl4处理时间延长而显著激活，且与RIPK3介导的坏死性凋亡同步上调。讨论本研究证明YA

  来源：International Immunopharmacology

  时间：2025-09-21

• 山柰酚通过双重靶向p53-p21-p16衰老通路与Nrf2/HO-1/NQO1抗氧化机制抑制动脉粥样硬化斑块形成：一项结合体内外研究的深入解析

  心血管疾病是全球首要死因，而动脉粥样硬化（Atherosclerosis, AS）是其主要的病理基础。尽管他汀类药物在降低低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）方面取得显著成效，但仍有30%–40%患者面临残留心血管风险，斑块持续进展或不稳定。他汀类药物对晚期斑块的稳定能力有限，且长期使用可能加剧胰岛素抵抗和增加2型糖尿病发病率。这些局限凸显了仅靠降脂无法解决的残留风险和斑块不稳定性问题，迫切需要新的治疗策略。近年来，大量证据表明，氧化应激和细胞衰老通过“氧化-炎症-衰老”的恶性循环加速斑块失稳。打破这一循环，同时纠正全身代谢失衡，成为干预AS的新方向。因此，具有多靶点调节特性的天然黄酮类化合物引起

  来源：International Immunopharmacology

  时间：2025-09-21

• Lp-PLA2/LPC轴激活触发内皮细胞铁死亡以驱动糖尿病肾病的发展

  HighlightLp-PLA2/LPC轴是糖尿病肾病中内皮细胞铁死亡的新型激活因子。Darapladib通过抑制这一铁依赖性细胞死亡途径保护肾功能，为治疗提供了不依赖于血糖控制的机制性治疗策略。INTRODUCTION糖尿病肾病（DKD）是糖尿病最严重的微血管并发症之一，影响高达40%的2型糖尿病患者，并显著导致终末期肾病和心血管疾病发病。内皮功能障碍（以血管舒张功能受损、炎症和氧化应激为特征）在DKD发病机制中起着关键作用，然而其潜在机制仍未完全明确。Animals雄性C57BLKS/J db/db小鼠及年龄匹配的db/m对照组（8周龄，20–25克；中国维通利华动物中心，北京）在无特定病

  来源：Free Radical Biology and Medicine

  时间：2025-09-21

• MAO-B激活型荧光探针的理性设计及其在活性评估与生物医学应用中的突破

  HighlightAHPC的设计与光谱特性首先，我们基于MAO-B的底物特性合成了两种潜在底物。如Scheme 1所示，MAO-A和MAO-B几乎不能催化ACDC，而MAO-B对AHPC的催化速率是MAO-A的62.6倍（表S1）。这一现象通过分子对接实验得到进一步解释。经过20纳秒分子动力学（MD）模拟，所有系统均达到稳定构象，为后续分析提供了可靠基础（图S4）。高效的催化机制使AHPC成为检测MAO-B的理想工具。结论总之，我们开发出一种名为AHPC的高选择性、高灵敏度荧光探针，可用于复杂生物系统中MAO-B活性的检测，并能实时监测细胞和器官内源性的MAO-B水平。值得注意的是，AHPC能

  来源：Free Radical Biology and Medicine

  时间：2025-09-21

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